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水稻氮代谢基础研究:谷氨酸脱氢酶作用的分子机理

摘要第1-9页
Abstract第9-11页
缩略词表第11-12页
1 文献综述第12-25页
   ·植物的氮源第12页
   ·NO_3~-的还原第12-13页
   ·NH_4~+的同化第13-21页
     ·高等植物GS/GOGAT的研究概况第13-16页
     ·高等植物GDH的研究概况第16-21页
       ·GDH生化特性及活性变化第16-17页
       ·GDH与光呼吸作用的关系第17-18页
       ·GDH在碳氮代谢中的作用第18-19页
       ·GDH与植物逆境的关系第19页
       ·GDH基因克隆第19-21页
       ·GDH转基因植物的研究现状第21页
   ·植物基因功能研究策略第21-25页
     ·生物信息学第22-23页
     ·研究基因表达及功能分析的实验方法第23-25页
       ·表达序列标签(ESTs)第23页
       ·Northern杂交、半定量反转录PCR和实时定量PCR第23-24页
       ·基因芯片技术第24-25页
2 本研究的目的和意义第25-26页
3 材料与方法第26-39页
   ·实验材料第26-27页
     ·水稻材料及其处理第26页
     ·遗传转化的载体与菌株第26-27页
   ·生物信息学分析第27-28页
   ·遗传转化载体的构建和转化第28-31页
     ·超量表达载体的构建第28-29页
     ·RNAi抑制表达载体的构建第29页
     ·Promoter分析载体的构建第29-31页
     ·遗传转化第31页
   ·DNA的抽提和Southern杂交第31-32页
   ·RNA抽提、RT-PCR、qPCR和Northern杂交第32页
   ·转基因植株的种植和性状考察第32-39页
     ·苗期水培试验和性状考察第32-33页
     ·孕穗期水培试验第33页
     ·田间试验和性状考察第33-34页
       ·大田低氮胁迫实验第33页
       ·大田抗旱性实验第33-34页
     ·苗期培养基试验和性状考察第34-36页
     ·考察性状的测定第36-39页
       ·谷氨酸脱氢酶活性的测定第36-37页
       ·水溶性蛋白含量的测定第37-39页
       ·SPAD值测定第39页
       ·糙米中氮含量的测定方法第39页
   ·GFP的表达观察第39页
4 结果与分析第39-60页
   ·OsGDH基因生物信息学以及表达模式分析第39-52页
     ·OsGDH基因分离第39-41页
     ·OsGDH基因的进化和蛋白质motif分析第41-44页
     ·OsGDH表达谱分析第44-50页
       ·用qPCR方法分析苗期缺氮及缺磷条件下OsGDH表达谱第44-45页
       ·通过RT-PCR分析OsGDH在正常条件下的表达谱第45-46页
       ·用Microarray分析OsGDH全生育期的表达模式第46-48页
       ·启动子融合GFP蛋白的转基因植株的获得与分析第48-50页
     ·OsGDH的单核苷酸多态性分析第50-52页
   ·超量表达OsGDH1、OsGDH4和α-gdhANC转基因植株的获得与功能分析第52-59页
     ·转基因植株的获得与鉴定第52-55页
       ·基因片段的获得与转化载体的构建第52页
       ·转基因植株的获得与鉴定第52-55页
     ·转基因植株的种植及其功能验证第55-59页
       ·转基因植株的苗期水培种植第55-56页
       ·转基因植株谷氨酸脱氢酶活性的测定分析第56-57页
       ·转基因植株苗期培养基试验第57页
       ·转基因植株孕穗期水培试验第57-59页
       ·转基因植株的经济产量及籽粒氮含量的测定分析第59页
   ·RNAi抑制表达的转基因植株的获得与鉴定第59-60页
5 讨论第60-65页
   ·关于水稻谷氨酸脱氢酶(GDH)基因功能的探讨第60-62页
   ·关于GDH酶活性测定第62-63页
   ·关于氮高效利用的转基因水稻新品种培育方法的探讨第63-64页
   ·关于后续工作的设想第64-65页
参考文献第65-76页
致谢第76-77页
附录Ⅰ 部分实验的操作流程第77-84页
 Protocol 1:Extraction of total DNA with CTAB method第77-78页
 Protocol 2:TRIzol Reagent RNA Isolation Method第78-79页
 Protocol 3:RT-PCR(Reverse transcription PCR)第79-81页
 Protocol 4:Northern Hybridization第81-84页
附录Ⅱ 附表及附图第84-90页
 附表1 来源于不同物种谷氨酸脱氢酶信息第84-86页
 附表2 OsGDH在不同品种中差异表达第86-87页
 附图1 PF02812和整个蛋白质序列进化树第87-88页
 附图2 MEME对GDH蛋白结构分析结果第88页
 附图3 层次聚类分析野生型拟南芥Affymetrix(ATH1)芯片中编码谷氨酰胺合成酶(GS)、谷氨酸合成酶(GOGAT)和谷氨酸脱氢酶(GDH)基因第88-90页
附录Ⅲ 简历第90页

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