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琼脂降解相关酶类及酶法制备新琼寡糖的研究

摘要第1-10页
Abstract第10-13页
缩略词表第13-14页
第一章 前言第14-37页
 1 海洋微生物及其应用第14-18页
   ·海洋微生物发展历程第14-16页
   ·海洋微生物应用第16-18页
 2 硫酸酯酶第18-21页
   ·硫酸酯酶简介第18-20页
   ·硫酸酯酶应用第20-21页
 3 琼脂酶和琼脂寡糖第21-31页
   ·琼脂酶简介及应用第21-26页
   ·琼脂寡糖简介及应用第26-31页
 4 海洋微生物基因组学研究第31-32页
   ·海洋微生物基因组学与生物多样性第31页
   ·海洋微生物基因组学与代谢第31-32页
 5 琼脂及其生产工艺第32-36页
   ·琼脂来源、组成及用途第32-33页
   ·琼脂生产工艺第33-34页
   ·琼脂工业发展前景及存在问题第34-36页
 6 本论文研究目的与意义第36-37页
第二章 红树林产硫酸酯酶假单胞菌Pseudomonas sp.S9的筛选及全基因组测序第37-60页
 1 引言第37-38页
 2 材料与方法第38-44页
   ·实验材料第38-40页
     ·样品第38页
     ·菌株第38页
     ·质粒载体第38页
     ·试剂盒第38-39页
     ·PCR扩增相关引物第39页
     ·生化试剂第39页
     ·培养基和溶液第39页
     ·主要实验仪器第39-40页
   ·实验方法第40-44页
     ·产硫酸酯酶菌株分离鉴定第40-43页
     ·Pseudomonas sp.S9菌株基因组测序第43-44页
 3 结果与分析第44-58页
   ·产硫酸酯酶菌株分离鉴定第44-46页
     ·菌株筛选第44页
     ·表型特征第44-45页
     ·生理生化特性第45页
     ·系统发育分析第45-46页
   ·菌株Pseudomonas sp.S9基因组测序第46-58页
     ·基因组DNA检测第46-47页
     ·基因组测序分析第47-58页
 4 讨论第58-60页
第三章 红树林假单胞菌Pseudomonas sp.S9硫酸酯酶基因的克隆、表达及功能第60-87页
 1 引言第60页
 2 材料与方法第60-71页
   ·实验材料第60-62页
     ·样品第60-61页
     ·菌株第61页
     ·质粒载体第61页
     ·试剂盒第61页
     ·PCR扩增相关引物第61-62页
     ·生化试剂第62页
     ·培养基和溶液第62页
     ·主要实验仪器第62页
   ·实验方法第62-71页
     ·芳香族硫酸酯酶基因序列分析第62页
     ·重组表达质粒构建与目的蛋白表达纯化第62-66页
     ·芳香族硫酸酯酶活检测第66页
     ·重组芳香族硫酸酷酶酶学性质第66页
     ·芳香族硫酸酯酶降解龙须菜多糖硫酸根第66-67页
     ·烷基型硫酸酯酶基因sdsAP克隆与序列分析第67-68页
     ·重组表达质粒构建与目的蛋白表达纯化第68-69页
     ·烷基型硫酸酯酶酶活检测第69页
     ·二聚体检测第69-70页
     ·重组烷基型硫酸酯酶酶学性质第70-71页
 3 结果与讨论第71-85页
   ·芳香族硫酸酯酶分析第71-75页
     ·芳香族硫酸酯酶基因序列分析第71页
     ·芳香族硫酸酯酶重组表达纯化及活性检测第71-74页
     ·重组芳香族硫酸酯酶ArySX3酶学性质第74-75页
     ·芳香族硫酸酯酶降解龙须菜硫酸根第75页
   ·烷基型硫酸酯酶分析第75-85页
     ·Pseudomonas sp.S9基因组部分酶切DNA检测第75-76页
     ·Pseudomonas sp.S9菌株中烷基型硫酸酯酶sdsAP序列分析第76-79页
     ·目的蛋白表达纯化第79页
     ·SdsAP分子量分析第79-80页
     ·重组烷基型硫酸酯酶性质分析第80-85页
 4 讨论第85-87页
第四章 海洋噬琼脂菌Agarivorans sp.LQ48的分离鉴定及其琼脂酶基因的克隆、表达、功能第87-109页
 1 引言第87页
 2 材料与方法第87-94页
   ·实验材料第87-89页
     ·样品第87页
     ·菌株第87-88页
     ·质粒载体第88页
     ·试剂盒第88页
     ·PCR扩增相关引物第88页
     ·生化试剂第88页
     ·培养基和溶液第88-89页
     ·主要实验仪器第89页
     ·薄层层析(TLC)第89页
   ·实验方法第89-94页
     ·产琼脂酶菌株分离鉴定第89-91页
     ·琼脂酶基因克隆与序列分析第91-92页
     ·重组表达质粒构建与目的蛋白表达纯化第92页
     ·AgaA酶活检测第92-93页
     ·重组琼脂酶AgaA酶学性质第93-94页
 3 结果与分析第94-105页
   ·产琼脂酶菌株分离鉴定第94-99页
     ·菌株筛选第94页
     ·形态特征第94页
     ·生理生化特性第94-95页
     ·系统发育分析第95-96页
     ·DNA-DNA杂交分析第96页
     ·脂肪酸成分第96-99页
   ·琼脂酶agaA基因克隆与序列分析第99-105页
     ·Agarivorans sp.LQ48基因组文库阳性克隆的筛选鉴定第99页
     ·阳性克隆pLQ1序列分析第99-102页
     ·目的蛋白表达纯化第102-103页
     ·重组琼脂酶性质第103-105页
 4 讨论第105-109页
第五章 新琼脂寡糖的酶法制备及其体外抗氧化功能第109-120页
 1 引言第109页
 2 材料与方法第109-112页
   ·实验材料第109-110页
     ·菌株第109页
     ·生化试剂第109页
     ·培养基和溶液第109-110页
     ·主要实验仪器第110页
     ·薄层层析第110页
   ·实验方法第110-112页
     ·菌株发酵培养第110页
     ·琼脂粗酶制备第110页
     ·粗酶活力检测第110页
     ·酶法制备新琼寡糖第110-111页
     ·新琼寡糖体外抗氧化性功能鉴定第111-112页
 3 结果与分析第112-118页
   ·制备琼脂粗酶第112-113页
   ·酶法制备新琼寡糖第113-115页
     ·酶解终产物检测第113-114页
     ·制备新琼寡糖第114页
     ·新琼寡糖纯度鉴定第114-115页
   ·新琼寡糖NA2、NA4体外抗氧化性鉴定第115-118页
     ·DPPH自由基的清除能力第115-116页
     ·超氧阴离子自由基清除能力第116-117页
     ·羟基自由基清除能力第117-118页
 4 讨论第118-120页
总结与展望第120-122页
 1. 总结第120-121页
 2. 展望第121-122页
参考文献第122-140页
致谢第140-141页
附录1 芳香族硫酸酯酶核苷酸序列第141-149页
附录2 博士期间发表的论文第149页

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