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多组学分析中国野生毛葡萄芪类物质代谢调控机制

摘要第7-9页
ABSTRACT第9-11页
第一章 文献综述第15-23页
    1.1 葡萄抗白粉病研究进展第15-16页
    1.2 白藜芦醇及衍生物代谢途径研究进展第16-18页
        1.2.1 葡萄中白藜芦醇及其衍生物种类第16-17页
        1.2.2 葡萄中白藜芦醇衍生物合成途径第17-18页
    1.3 葡萄转录组和蛋白质组研究进展第18-21页
        1.3.1 葡萄转录组研究进展第18-19页
        1.3.2 葡萄蛋白质组研究进展第19-21页
    1.4 葡萄中基于共表达网络筛选核心转录因子研究进展第21-22页
    1.5 本研究的目的与意义第22-23页
第二章 材料与方法第23-32页
    2.1 材料第23页
        2.1.1 植物材料第23页
        2.1.2 主要试剂与仪器第23页
    2.2 方法第23-32页
        2.2.1 材料采集第23-24页
        2.2.2 葡萄果实RNA提取第24页
        2.2.3 转录组建库第24页
        2.2.4 转录组生物信息分析第24-25页
        2.2.5 实时荧光定量引物第25-26页
        2.2.6 实时荧光定量PCR第26-27页
        2.2.7 酵母单杂交验证第27页
        2.2.8 葡萄白藜芦醇主要衍生物代谢基因家族成员鉴定第27页
        2.2.9 染色体定位分析、基因聚类分析和外显子-内含子结构分析第27页
        2.2.10 基因保守模体分析和表达模式分析第27页
        2.2.11 基因克隆和序列分析第27-28页
        2.2.12 载体构建第28页
        2.2.13 VqNAC1功能验证实验使用引物第28-29页
        2.2.14 酵母自激活验证第29页
        2.2.15 亚细胞定位第29页
        2.2.16 葡萄叶片瞬时转化第29页
        2.2.17 葡萄果实蛋白质提取第29页
        2.2.18 i TRAQ蛋白质组实验流程第29页
        2.2.19 蛋白质组数据分析第29-30页
        2.2.20 代谢组分析第30页
        2.2.21 芪类物质含量测定第30页
        2.2.22 类黄酮和花青苷含量测定第30-32页
第三章 结果与分析第32-98页
    3.1 两个葡萄材料果实四个发育时期转录组分析第32-81页
        3.1.1 ‘丹凤-2’和‘赤霞珠’果实转录组测序数据分析第32-38页
        3.1.2 ‘丹凤-2’和‘赤霞珠’果实转录组差异表达基因分析第38页
        3.1.3 ‘丹凤-2’和‘赤霞珠’果实转录组差异表达基因功能富集分析第38-45页
        3.1.4 ‘丹凤-2’和‘赤霞珠’果实中芪合成酶相关基因差异表达分析第45-46页
        3.1.5 葡萄白藜芦醇主要衍生物代谢基因家族成员鉴定第46-47页
        3.1.6 葡萄白藜芦醇主要衍生物代谢基因家族成员染色体定位分析第47-48页
        3.1.7 葡萄白藜芦醇主要衍生物代谢基因家族成员聚类分析第48-50页
        3.1.8 葡萄白藜芦醇主要衍生物代谢基因家族成员外显子-内含子结构分析第50-52页
        3.1.9 葡萄白藜芦醇主要衍生物代谢基因家族成员保守模体分析第52-54页
        3.1.10 葡萄白藜芦醇主要衍生物代谢基因家族成员表达模式分析第54-57页
        3.1.11 转录因子-芪合成酶基因共表达分析第57-60页
        3.1.12 VqNAC1基因调控芪类物质积累第60-66页
        3.1.13 中国野生毛葡萄新转录本组装与注释第66-69页
        3.1.14 ‘丹凤-2’和‘赤霞珠’果实转录组可变剪接分析第69-71页
        3.1.15 ‘丹凤-2’和‘赤霞珠’中参与调控芪合成酶基因长链非编码RNA分析第71-74页
        3.1.16 ‘丹凤-2’和‘赤霞珠’果实胁迫相关差异表达基因分析第74-79页
        3.1.17 ‘丹凤-2’和‘赤霞珠’转录组SNP分析第79-81页
        3.1.18 两个葡萄材料果实四个发育时期转录组分析小结第81页
    3.2 两个葡萄材料果实四个发育时期蛋白质组分析第81-90页
        3.2.1 ‘丹凤-2’和‘赤霞珠’果实差异蛋白分析第81-83页
        3.2.2 转录组和蛋白组关联分析第83-85页
        3.2.3 ‘丹凤-2’和‘赤霞珠’差异蛋白功能分析第85-89页
        3.2.4 两个葡萄材料果实四个发育时期蛋白质组分析小结第89-90页
    3.3 两个葡萄材料果实四个发育时期代谢组分析第90-96页
        3.3.1 ‘丹凤-2’和‘赤霞珠’果实代谢组分析第90-93页
        3.3.2 ‘丹凤-2’和‘赤霞珠’果实芪类物质含量测定第93-94页
        3.3.3 ‘丹凤-2’和‘赤霞珠’果实黄酮类物质含量测定第94-95页
        3.3.4 两个葡萄材料果实四个发育时期代谢组分析小结第95-96页
    3.4 多组学分析中国野生毛葡萄芪类物质代谢调控机制第96-98页
第四章 讨论第98-104页
    4.1 芪合成酶基因表达受多种转录因子调控第98-100页
    4.2 胁迫相关差异表达蛋白参与植物抗病第100-101页
    4.3 苯丙氨酸代谢途径差异表达蛋白参与芪类物质代谢调控第101-102页
    4.4 芪类物质代谢及其对真菌病害的防御作用第102-104页
第五章 结论和创新点第104-106页
    5.1 结论第104-105页
    5.2 创新点第105-106页
参考文献第106-117页
附录第117-129页
缩略词第129-130页
致谢第130-131页
个人简介第131页

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