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产酶溶杆菌OH11中转录因子LetR调控次生代谢产物HSAF合成的机制研究

摘要第8-9页
ABSTRACT第9-10页
上篇 文献综述第11-24页
    第一章 产酶溶杆菌的研究进展第12-18页
        1 产酶溶杆菌的分类地位第12页
        2 产酶溶杆菌的生物学特性第12-13页
        3 产酶溶杆菌的生防机制第13-16页
            3.1 胞外水解酶第13-14页
            3.2 热稳定抗真菌因子(HSAF)第14-16页
        4 产酶溶杆菌调控机制的研究进展第16-18页
            4.1 产酶溶杆菌中DF的功能第16页
            4.2 产酶溶杆菌中ChpA的功能第16-17页
            4.3 产酶溶杆菌中PilR的功能第17页
            4.4 产酶溶杆菌中Clp的功能第17-18页
    第二章 转录因子的研究进展第18-24页
        1 转录因子的概念第18-19页
            1.1 转录因子发挥作用的方式第18页
            1.2 细菌中与RNA聚合酶作用的转录因子第18页
            1.3 细菌调节DNA结构的转录因子第18-19页
        2 转录因子的分类第19页
        3 TetR家族转录调控因子的结构第19-20页
        4 TetR家族转录调控因子的分布第20页
        5 TetR家族转录调控因子的功能第20-21页
        6 转录因子的研究方法第21-22页
            6.1 细菌单杂交技术第21-22页
            6.2 琼脂糖凝胶阻滞技术(EMSA)第22页
        7 本文研究的目的及意义第22-24页
下篇 研究内容第24-80页
    第一章 产酶溶杆菌OH11中HSAF合成关键基因的鉴定及功能研究第26-46页
        1 试验材料第27-31页
            1.1 菌株、质粒及其培养条件第27-29页
            1.2 引物设计第29-30页
            1.3 培养基第30-31页
            1.4 酶、抗生素、试剂盒、化学试剂和器材第31页
        2 研究方法第31-38页
            2.1 产酶溶杆菌OH11基因组中HSAF生物合成基因簇的序列分析第31页
            2.2 产酶溶杆菌OH11基因组DNA的提取第31-32页
            2.3 TransTaq聚合酶PCR体系和反应条件第32页
            2.4 PCR产物纯化第32-33页
            2.5 酶切体系第33页
            2.6 纯化酶切产物连接第33页
            2.7 连接产物转化大肠杆菌DH5α第33页
            2.8 重组载体的验证第33-34页
            2.9 质粒的提取与双酶切验证第34页
            2.10 产酶溶杆菌OH11电转感受态的制备以及突变体的筛选第34-35页
            2.11 病原菌拮抗活性测定第35-36页
            2.12 HSAF的提取和HPLC检测第36-37页
            2.13 Twitching Motility检测第37页
            2.14 菌落形态的观察第37-38页
            2.15 数据分析第38页
        3 结果与分析第38-45页
            3.1 产酶溶杆菌OH11中HSAF合成相关基因簇的定位第38页
            3.2 产酶溶杆菌OH11中HSAF合成相关基因簇各基因敲除突变体的构建第38-41页
            3.3 10% TSB上HSAF基因簇各基因突变体菌株的HSAF的HPLC检测第41-43页
            3.4 HSAF基因簇各基因突变体菌株对真菌、卵菌及酒酿酵母的拮抗活性第43页
            3.5 HSAF基因簇各基因突变体菌株Twitching motility的测定第43-44页
            3.6 HSAF基因簇各基因突变体菌株的生长及菌落形态观察第44-45页
        4 讨论第45-46页
    第二章 产酶溶杆菌OH11中转录因子LetR调控次生代谢产物HSAF合成的机制研究第46-80页
        1 实验材料第48-57页
            1.1 菌株、质粒及其培养条件第48-52页
            1.2 引物设计第52-55页
            1.3 培养基第55-56页
            1.4 试剂及溶液配制第56页
            1.5 酶、抗生素、试剂盒、化学试剂和器材第56-57页
        2 试验方法第57-65页
            2.1 产酶溶杆菌OH11中HSAF生物合成基因操作子的启动子区的定位及其活性的检测第57-59页
            2.2 细菌单杂交筛选第59-60页
            2.4 产酶溶杆菌OH11基因组DNA的提取第60页
            2.5 TransTaq聚合酶PCR体系和反应条件第60页
            2.6 PCR产物纯化第60页
            2.7 酶切体系第60页
            2.8 纯化酶切产物连接第60页
            2.9 连接产物转化大肠杆菌DH5α第60页
            2.10 重组载体的验证第60页
            2.11 质粒的提取与双酶切验证第60页
            2.12 产酶溶杆菌OH11电转感受态的制备以及突变体的筛选第60-61页
            2.13 HSAF的提取和HPLC检测第61页
            2.14 互补和过表达菌株的构建第61页
            2.15 HSAF合成关键基因pks/nrps (lafB)表达量的实时定量PCR第61-62页
            2.16 生长曲线的测定第62页
            2.17 琼脂糖凝胶阻滞试验(EMSA)第62-64页
            2.18 数据分析第64-65页
        3 结果与分析第65-78页
            3.1 产酶溶杆菌OH11中HSAF生物合成基因操作子的启动子区的定位第65-66页
            3.2 产酶溶杆菌OH11中转录因子的生物信息学预测第66-67页
            3.3 转录因子pTRG文库的构建及验证第67-68页
            3.5 细菌单杂交系统筛选能结合PHSAF区的转录因子第68-70页
            3.6 能结合在PHSAF区的转录因子敲除突变体的构建第70-72页
            3.7 10% TSB上能结合在PHSAF区的转录因子突变体菌株HSAF的HPLC检测第72-73页
            3.8 LetR序列分析第73-74页
            3.9 LetR互补和过表达菌株的构建第74页
            3.10 过表达菌株HSAF产量明显下降第74-76页
            3.11 琼脂糖凝胶阻滞试验(EMSA)结果第76-78页
        4 讨论第78-80页
参考文献第80-86页
全文总结第86-88页
本论文创新点第88-90页
附录一 缩写说明第90-92页
攻读学位期间发表的学术论文第92-94页
致谢第94页

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