| 致谢 | 第6-7页 |
| 前言 | 第7-12页 |
| 摘要 | 第12-13页 |
| Abstract | 第13页 |
| 1 文献综述 | 第16-30页 |
| 1.1 转座元件的研究进展 | 第16-20页 |
| 1.1.1 转座元件的发现及类别 | 第16-17页 |
| 1.1.2 转座元件动植物基因组中的组成与差异 | 第17-20页 |
| 1.2 转座元件在植物生长中的作用 | 第20-22页 |
| 1.2.1 引起基因失活 | 第20页 |
| 1.2.2 改变基因表达水平 | 第20页 |
| 1.2.3 引起基因重组,丢失以及形成新基因 | 第20-22页 |
| 1.3 微型颠倒重复转座元件 | 第22-25页 |
| 1.3.1 MITEs的分类及其在植物基因组中的分布 | 第22-23页 |
| 1.3.2 MITEs的起源及其可能的转座机制 | 第23-24页 |
| 1.3.3 活性MITEs发现 | 第24-25页 |
| 1.4 DNA的同源重组 | 第25-29页 |
| 1.4.1 重组的发现 | 第25-26页 |
| 1.4.2 同源重组的分子机制 | 第26-29页 |
| 1.5 本研究的目的和意义 | 第29-30页 |
| 2 单拷贝基因组序列在细胞内可受诱导扩增成为一个典型的MITE | 第30-53页 |
| 2.1 研究目的 | 第30页 |
| 2.2 研究背景 | 第30-31页 |
| 2.3 材料和方法 | 第31-37页 |
| 2.3.1 植物材料 | 第31页 |
| 2.3.2 供试仪器 | 第31页 |
| 2.3.3 水稻基因组DNA的提取(上海生工UNIQ.10柱式植物基因组DNA提取试剂盒) | 第31-32页 |
| 2.3.4 普通PCR技术 | 第32页 |
| 2.3.5 琼脂糖凝胶电泳 | 第32-33页 |
| 2.3.6 PCR产物割胶回收(上海生工SanPrep柱式DNA胶回收试剂盒) | 第33页 |
| 2.3.7 转座子显示技术(TD技术) | 第33-34页 |
| 2.3.8 生物信息学分析 | 第34页 |
| 2.3.9 引物信息 | 第34-37页 |
| 2.4 实验结果与分析 | 第37-51页 |
| 2.4.1 三组水稻全基因组序列的比对及候选MITE元件的筛选 | 第37-39页 |
| 2.4.2 候选MITE序列的识别和分析 | 第39-40页 |
| 2.4.3 UC序列的结构分析 | 第40-45页 |
| 2.4.4 UC序列在部分水稻群体中的DNA多态性分析 | 第45-47页 |
| 2.4.5 一些基因组单拷贝序列在体内(in vivo)具转座活性并可受诱导扩增 | 第47-51页 |
| 2.5 结论及存在问题 | 第51-53页 |
| 3 转座事件所引发的重组进程可以在不同的时空发生 | 第53-78页 |
| 3.0 研究目的 | 第53页 |
| 3.1 研究背景 | 第53-54页 |
| 3.2 材料和方法 | 第54页 |
| 3.2.1 植物材料 | 第54页 |
| 3.2.2 生物信息学分析 | 第54页 |
| 3.3 实验结果和分析 | 第54-77页 |
| 3.3.1 生物信息学统计数据的重计算 | 第54-55页 |
| 3.3.2 候选MITE序列的再分析和数据挖掘 | 第55-59页 |
| 3.3.3 候选序列的大规模DNA多态性分析 | 第59-61页 |
| 3.3.4 上述第三方面实验结果的DNA测序分析 | 第61-70页 |
| 3.3.5 上述第四方面实验结果的DNA测序分析 | 第70-77页 |
| 3.4 结论 | 第77-78页 |
| 参考文献 | 第78-82页 |
