| 摘要 | 第4-5页 |
| ABSTRACT | 第5-6页 |
| 1 绪论 | 第9-12页 |
| 1.1 研究背景与意义 | 第9-11页 |
| 1.2 论文结构安排 | 第11-12页 |
| 2 评估RNA三维结构的能量函数研究 | 第12-37页 |
| 2.1 能量函数研究现状 | 第12-15页 |
| 2.1.1 基于知识的能量函数 | 第12-14页 |
| 2.1.2 能量函数存在问题 | 第14-15页 |
| 2.2 研究依据 | 第15-17页 |
| 2.2.1 德拜-休克尔离子溶液理论 | 第16页 |
| 2.2.2 Delphi介绍 | 第16-17页 |
| 2.3 研究目的 | 第17-18页 |
| 2.4 原理和方法 | 第18-36页 |
| 2.4.1 训练集和测试集的选取 | 第18-19页 |
| 2.4.2 基于库伦德拜势的静电评估函数Elec_DH的建立和参数选取 | 第19-28页 |
| 2.4.3 基于Delphi的静电评估函数Elec_Delphi打分性能研究 | 第28-31页 |
| 2.4.4 组合评分函数打分性能的研究 | 第31-36页 |
| 2.5 本章小结和总结 | 第36-37页 |
| 3 三分支环的空间结构分布 | 第37-54页 |
| 3.1 前言 | 第37-40页 |
| 3.2 原理和方法 | 第40-54页 |
| 3.2.1 样本结构数据集的提取 | 第40-41页 |
| 3.2.2 三分支环螺旋之间的角度分布 | 第41-49页 |
| 3.2.3 三分支环螺旋同轴堆积预测 | 第49-50页 |
| 3.2.4 三分支环家族预测 | 第50-51页 |
| 3.2.5 Junction_Explorer三分支环同轴堆积精度验证 | 第51-53页 |
| 3.2.6 本章小结和讨论 | 第53-54页 |
| 4 总结和展望 | 第54-56页 |
| 4.1 工作总结 | 第54-55页 |
| 4.2 展望 | 第55-56页 |
| 致谢 | 第56-57页 |
| 参考文献 | 第57-60页 |
