致谢 | 第4-5页 |
摘要 | 第5-7页 |
Abstract | 第7-8页 |
英文缩略词表 | 第12-13页 |
文献综述 | 第13-20页 |
1 MiRNA的研究 | 第13-14页 |
2 山羊的排卵周期的研究 | 第14-15页 |
3 关于山羊卵巢的研究 | 第15-17页 |
4 miRNA在卵巢上的研究进展 | 第17-20页 |
引言 | 第20-21页 |
1 材料与方法 | 第21-25页 |
1.1 试验材料 | 第21-22页 |
1.1.1 试验动物 | 第21页 |
1.1.2 主要仪器设备 | 第21-22页 |
1.2 试验方法与流程 | 第22-25页 |
1.2.1 样本采集 | 第22页 |
1.2.2 总RNA提取 | 第22页 |
1.2.3 总RNA的质量分析 | 第22页 |
1.2.4 RNA混池的建立 | 第22页 |
1.2.5 构建测序文库和测序 | 第22页 |
1.2.6 测序原始数据的处理 | 第22-23页 |
1.2.7 SmallRNA文库的分类注释 | 第23页 |
1.2.8 新miRNA的预测 | 第23页 |
1.2.9 已知miRNA和新miRNA的差异分析 | 第23页 |
1.2.10 表达模式聚类分析及靶基因预测 | 第23页 |
1.2.11 miRNA的靶基因GO富集分析和KEGG通路分析 | 第23-24页 |
1.2.12 测序结果的定量验证 | 第24-25页 |
2 结果与分析 | 第25-36页 |
2.1 总RNA的质量检测 | 第25页 |
2.2 文库RNA的质量分析 | 第25-26页 |
2.3 smallRNA文库片段长度分布 | 第26页 |
2.4 公共及特有序列 | 第26-27页 |
2.5 smallRNA的基因组比对 | 第27页 |
2.6 重复序列比对 | 第27-28页 |
2.7 外显子和内含子的比对 | 第28-29页 |
2.8 smallRNA分类注释 | 第29-30页 |
2.9 已知miRNA比对和新miRNA预测 | 第30页 |
2.10 已知miRNA和新miRNA的差异分析 | 第30-32页 |
2.11 已知miRNA和新miRNA的表达模式聚类分析 | 第32-33页 |
2.12 miRNA的GO富集分析 | 第33-34页 |
2.13 miRNA的KEGG通路分析 | 第34页 |
2.14 定量验证结果 | 第34-36页 |
3 讨论 | 第36-39页 |
3.1 样本采集 | 第36页 |
3.2 数据分析 | 第36-37页 |
3.3 生物信息学分析 | 第37-39页 |
4 结论 | 第39-40页 |
参考文献 | 第40-47页 |
个人简介 | 第47-48页 |