摘要 | 第6-8页 |
Abstract | 第8-9页 |
缩略语表 | 第10-11页 |
1.前言 | 第11-19页 |
1.1 植物细胞质雄性不育研究进展 | 第11-14页 |
1.1.1 植物细胞质雄性不育的分类 | 第11-12页 |
1.1.2 植物细胞质雄性不育机制假说 | 第12-14页 |
1.2 波里马细胞质雄性不育及其恢复基因的研究 | 第14-16页 |
1.2.1 pol CMS系统的分子生物学研究 | 第15页 |
1.2.2 pol CMS恢复基因的研究 | 第15-16页 |
1.3 温敏型波里马细胞质不育的研究 | 第16-17页 |
1.3.1 温敏型pol CMS的花器官形态观察 | 第16页 |
1.3.2 影响温敏型pol CMS育性的环境因素 | 第16页 |
1.3.3 温敏型pol CMS育性的遗传规律 | 第16页 |
1.3.4 温敏型pol CMS系统的分子生物学研究 | 第16-17页 |
1.4 RNA测序在转录组分析中的运用 | 第17-18页 |
1.5 本研究的意义 | 第18-19页 |
2.材料与方法 | 第19-29页 |
2.1 植物材料 | 第19页 |
2.2 对照试验 | 第19页 |
2.3 性状观察 | 第19-20页 |
2.4 材料取样 | 第20页 |
2.5 总RNA的提取(试剂盒法) | 第20-21页 |
2.6 总RNA的纯化 | 第21-22页 |
2.7 建库测序 | 第22-24页 |
2.8 原始数据质控 | 第24-25页 |
2.9 RNA-seq分析流程 | 第25-28页 |
2.9.1 使用Hisat2对Reads进行Mapping | 第25页 |
2.9.2 使用samtools文件格式转化 | 第25页 |
2.9.3 使用stringTie组装转录本并评估表达量 | 第25-26页 |
2.9.4 联合使用DEseq2和Ballgown筛选差异表达基因 | 第26页 |
2.9.5 使用Blast2GO进行GO和KEGG通路分析 | 第26-28页 |
2.10 实时荧光定量PCR | 第28-29页 |
3.结果与分析 | 第29-53页 |
3.1 育性性状观察 | 第29-30页 |
3.2 RNA样品质量检测 | 第30-31页 |
3.3 测序数据质控 | 第31-32页 |
3.4 数据mapping | 第32-34页 |
3.5 转录本组装 | 第34-35页 |
3.6 差异表达分析 | 第35-36页 |
3.7 基因本体注释 | 第36-40页 |
3.8 Y402高低温GO富集分析 | 第40-43页 |
3.9 Y402高低温KEGG通路富集分析 | 第43-45页 |
3.10 恢复基因Rfp及其等位基因表达分析 | 第45-46页 |
3.11 转录因子SPL1和SPL12表达分析 | 第46-47页 |
3.12 减数分裂前期调控花药发育相关基因表达分析 | 第47-50页 |
3.13 差异表达基因qRT-PCR验证 | 第50-53页 |
4.讨论 | 第53-58页 |
4.1 RNA-Seq技术的有效性 | 第53-54页 |
4.2 pol TCMS育性转化分子机制 | 第54-57页 |
4.3 后续研究展望 | 第57-58页 |
参考文献 | 第58-67页 |
附录 | 第67-72页 |
致谢 | 第72页 |