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甘蓝型油菜pol CMS温度敏感性的分子机制研究

摘要第6-8页
Abstract第8-9页
缩略语表第10-11页
1.前言第11-19页
    1.1 植物细胞质雄性不育研究进展第11-14页
        1.1.1 植物细胞质雄性不育的分类第11-12页
        1.1.2 植物细胞质雄性不育机制假说第12-14页
    1.2 波里马细胞质雄性不育及其恢复基因的研究第14-16页
        1.2.1 pol CMS系统的分子生物学研究第15页
        1.2.2 pol CMS恢复基因的研究第15-16页
    1.3 温敏型波里马细胞质不育的研究第16-17页
        1.3.1 温敏型pol CMS的花器官形态观察第16页
        1.3.2 影响温敏型pol CMS育性的环境因素第16页
        1.3.3 温敏型pol CMS育性的遗传规律第16页
        1.3.4 温敏型pol CMS系统的分子生物学研究第16-17页
    1.4 RNA测序在转录组分析中的运用第17-18页
    1.5 本研究的意义第18-19页
2.材料与方法第19-29页
    2.1 植物材料第19页
    2.2 对照试验第19页
    2.3 性状观察第19-20页
    2.4 材料取样第20页
    2.5 总RNA的提取(试剂盒法)第20-21页
    2.6 总RNA的纯化第21-22页
    2.7 建库测序第22-24页
    2.8 原始数据质控第24-25页
    2.9 RNA-seq分析流程第25-28页
        2.9.1 使用Hisat2对Reads进行Mapping第25页
        2.9.2 使用samtools文件格式转化第25页
        2.9.3 使用stringTie组装转录本并评估表达量第25-26页
        2.9.4 联合使用DEseq2和Ballgown筛选差异表达基因第26页
        2.9.5 使用Blast2GO进行GO和KEGG通路分析第26-28页
    2.10 实时荧光定量PCR第28-29页
3.结果与分析第29-53页
    3.1 育性性状观察第29-30页
    3.2 RNA样品质量检测第30-31页
    3.3 测序数据质控第31-32页
    3.4 数据mapping第32-34页
    3.5 转录本组装第34-35页
    3.6 差异表达分析第35-36页
    3.7 基因本体注释第36-40页
    3.8 Y402高低温GO富集分析第40-43页
    3.9 Y402高低温KEGG通路富集分析第43-45页
    3.10 恢复基因Rfp及其等位基因表达分析第45-46页
    3.11 转录因子SPL1和SPL12表达分析第46-47页
    3.12 减数分裂前期调控花药发育相关基因表达分析第47-50页
    3.13 差异表达基因qRT-PCR验证第50-53页
4.讨论第53-58页
    4.1 RNA-Seq技术的有效性第53-54页
    4.2 pol TCMS育性转化分子机制第54-57页
    4.3 后续研究展望第57-58页
参考文献第58-67页
附录第67-72页
致谢第72页

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