| 摘要 | 第7-9页 |
| Abstract | 第9-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-22页 |
| 1.1 柑橘黄龙病概述 | 第12-17页 |
| 1.1.1 寄主范围 | 第12-13页 |
| 1.1.2 病原的毒力机制 | 第13-17页 |
| 1.2 转录组学和蛋白组学研究进展 | 第17-22页 |
| 1.2.1 转录组及其研究技术 | 第17页 |
| 1.2.2 蛋白组及其研究技术 | 第17-18页 |
| 1.2.3.感染黄龙病柑橘宿主的转录组学和蛋白组学研究 | 第18-22页 |
| 第二章 引言 | 第22-24页 |
| 2.1 研究背景 | 第22-23页 |
| 2.2 技术路线 | 第23页 |
| 2.3 主要研究内容 | 第23-24页 |
| 2.3.1 马蜂柑响应CLas侵染的生物学研究 | 第23页 |
| 2.3.2 马蜂柑响应CLas侵染的转录组学研究 | 第23页 |
| 2.3.3 马蜂柑响应CLas侵染的蛋白组学研究 | 第23-24页 |
| 第三章 马蜂柑响应CLas侵染的生物学研究 | 第24-42页 |
| 3.1 试验材料 | 第25-27页 |
| 3.1.1 供试毒源及苗木 | 第25页 |
| 3.1.2 主要试剂（盒） | 第25页 |
| 3.1.3 主要存储液 | 第25-27页 |
| 3.1.4 主要仪器 | 第27页 |
| 3.2 试验方法 | 第27-33页 |
| 3.2.1 总核酸提取 | 第27-28页 |
| 3.2.2 引物 | 第28页 |
| 3.2.3 PCR扩增与克隆鉴定 | 第28-30页 |
| 3.2.4 制备质粒标准品 | 第30页 |
| 3.2.5 ddPCR检测体系的建立 | 第30-31页 |
| 3.2.6 ddPCR检测体系的应用 | 第31-32页 |
| 3.2.7 Spurr树脂样品制备固定及包埋 | 第32页 |
| 3.2.8 切片 | 第32页 |
| 3.2.9 半薄切片染色 | 第32-33页 |
| 3.3 结果与分析 | 第33-39页 |
| 3.3.1 PCR扩增与克隆鉴定 | 第33-34页 |
| 3.3.2 ddPCR条件的优化及体系的确定 | 第34-37页 |
| 3.3.3 马蜂柑感染黄龙病前、后期的症状差异 | 第37-38页 |
| 3.3.4 感病马蜂柑显微结构观察 | 第38-39页 |
| 3.4 讨论 | 第39-40页 |
| 3.5 小结 | 第40-42页 |
| 第四章 马蜂柑响应CLas侵染的前后期转录组学研究 | 第42-64页 |
| 4.1 材料与方法 | 第42-47页 |
| 4.1.1 供试材料 | 第42页 |
| 4.1.2 主要试剂与仪器 | 第42页 |
| 4.1.3 总核酸提取 | 第42页 |
| 4.1.4 转录组测序 | 第42-43页 |
| 4.1.5 数据分析 | 第43-44页 |
| 4.1.6 核酸RNA提取 | 第44-45页 |
| 4.1.7 RT-qPCR验证 | 第45-46页 |
| 4.1.8 基因相对表达量计算 | 第46-47页 |
| 4.2 结果与分析 | 第47-60页 |
| 4.2.1 RNA质量检测 | 第47-48页 |
| 4.2.2 测序数据过滤 | 第48-49页 |
| 4.2.3 参考基因组比对结果 | 第49页 |
| 4.2.4 新转录本预测 | 第49页 |
| 4.2.5 样品间的相关性 | 第49-50页 |
| 4.2.6 差异表达基因筛选 | 第50-51页 |
| 4.2.7 差异表达基因表达趋势分析 | 第51-52页 |
| 4.2.8 趋势表达基因GO功能富集分析 | 第52-54页 |
| 4.2.9 趋势表达基因KEGG通路富集分析 | 第54-56页 |
| 4.2.10 抗性相关代谢途径及基因分析 | 第56-58页 |
| 4.2.11 RT-qPCR验证 | 第58-60页 |
| 4.3 讨论 | 第60-61页 |
| 4.3.1 马蜂柑响应CLas侵染的防御机制 | 第60-61页 |
| 4.3.2 感染黄龙病对马蜂柑产生的影响 | 第61页 |
| 4.4 小结 | 第61-64页 |
| 第五章 马蜂柑响应CLas侵染的前后期蛋白组学研究 | 第64-82页 |
| 5.1 材料与方法 | 第64-66页 |
| 5.1.1 供试材料 | 第64页 |
| 5.1.2 主要试剂与仪器 | 第64页 |
| 5.1.3 方法与步骤 | 第64-66页 |
| 5.2 结果与分析 | 第66-80页 |
| 5.2.1 蛋白质鉴定 | 第66-70页 |
| 5.2.2 蛋白质注释 | 第70-73页 |
| 5.2.3 差异表达蛋白筛选 | 第73-75页 |
| 5.2.4 蛋白组与转录组关联分析 | 第75-80页 |
| 5.3 讨论 | 第80-81页 |
| 5.4 小结 | 第81-82页 |
| 第六章 主要结论、创新点与展望 | 第82-84页 |
| 6.1 主要结论 | 第82-83页 |
| 6.1.1 马蜂柑响应CLas侵染的生物学研究 | 第82页 |
| 6.1.2 马蜂柑响应CLas侵染的转录组学研究 | 第82页 |
| 6.1.3 马蜂柑响应CLas侵染的蛋白组学研究 | 第82-83页 |
| 6.2 创新点 | 第83页 |
| 6.3 展望 | 第83-84页 |
| 参考文献 | 第84-94页 |
| 附录I 缩略词与中英文对照 | 第94-96页 |
| 附录II 附表 | 第96-112页 |
| 攻读硕士学位期间发表论文及参加科研项目 | 第112-114页 |
| 致谢 | 第114-115页 |
