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拟南芥SMC5/6复合体中ASAP1-SNI1复合物的结构生物学初探

摘要第6-7页
Abstract第7-8页
缩略词表第9-10页
1 前言第10-32页
    1.1 研究问题的由来第10-11页
    1.2 SMC复合物的介绍第11-19页
        1.2.1 SMC复合物的发现第11-12页
        1.2.2 SMC复合物的组成第12-14页
        1.2.3 SMC复合物的分类第14-17页
        1.2.4 SMC5/6复合物的研究进展第17-19页
    1.3 Nse5-Nse6复合物的研究进展第19-20页
    1.4 拟南芥中Nse5,Nse6同源蛋白ASAP1,SNI1的研究进展第20-30页
        1.4.1 SNI1在植物系统获得性抗性中的研究进展第20-26页
        1.4.2 SNI1在DNA损伤修复中的研究进展第26-30页
        1.4.3 ASAP1的研究进展第30页
    1.5 本研究的意义第30-32页
2 实验材料及方法第32-58页
    2.1 实验材料第32-41页
        2.1.1 实验研究对象第32页
        2.1.2 实验所用菌株第32-33页
        2.1.3 实验仪器第33-34页
        2.1.4 实验所用载体第34-35页
        2.1.5 实验常用化学试剂及耗材第35页
        2.1.6 主要溶液的配方第35-41页
    2.2 实验方法第41-58页
        2.2.1 感受态制备第41-43页
        2.2.2 载体构建第43-50页
        2.2.3 蛋白的表达纯化第50-54页
        2.2.4 共表达验证蛋白的相互作用第54页
        2.2.5 蛋白二级结构的预测第54-55页
        2.2.6 限制性蛋白酶水解目的蛋白第55-56页
        2.2.7 半胱氨酸的突变第56页
        2.2.8 蛋白晶体的筛选及优化第56-58页
3 结果及分析第58-98页
    3.1 ASAP1-SNI1相互作用的验证第59-74页
        3.1.1 克隆构建第59-63页
        3.1.2 ASAP1和SNI1的生物信息学分析第63-68页
        3.1.3 单独纯化体外孵育验证ASAP1-SNI1的相互作用第68-69页
        3.1.4 共表达验证ASAP1-SNI1的相互作用第69-71页
        3.1.5 ASAP1-SNI1复合物的质谱鉴定第71-74页
    3.2 ASAP1-SNI1复合物的表达优化第74-78页
        3.2.1 亲和标签的优化第74-77页
        3.2.2 ASAP1-SNI1复合物诱导条件的优化第77-78页
    3.3 ASAP1-SNI1复合物的晶体初筛第78-98页
        3.3.1 野生型ASAP1-SNI1复合物的晶体初筛第78-85页
        3.3.2 含半胱氨酸突变ASAP1-SNI1复合物的晶体初筛第85-98页
4 讨论第98-101页
    4.1 总结第98-99页
    4.2 讨论展望第99-101页
        4.2.1 ASAP1,SNI1内部序列的取代第99-100页
        4.2.2 ASAP1-SNI1复合物互作蛋白的筛选第100-101页
参考文献第101-115页
附录第115-124页
    附录一:克隆编号表第115-122页
    附录二:晶体初筛汇总第122-123页
    附录三:个人简历,在学期间参与发表学术论文与研究成果第123-124页
致谢第124-125页

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