| 摘要 | 第4-6页 |
| SUMMARY | 第6-7页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-22页 |
| 1 仔猪腹泻疾病 | 第11-12页 |
| 2 MHC基因概述 | 第12-20页 |
| 2.1 SLA基因概述 | 第13-16页 |
| 2.1.1 SLA I类基因 | 第14-15页 |
| 2.1.2 SLA II类基因 | 第15-16页 |
| 2.1.3 SLA III类基因 | 第16页 |
| 2.2 SLA基因的遗传特性及生物功能 | 第16-17页 |
| 2.2.1 高度多态性 | 第16页 |
| 2.2.2 单倍型遗传 | 第16-17页 |
| 2.2.3 连锁不平衡 | 第17页 |
| 2.3 SLA基因的生物学功能 | 第17-18页 |
| 2.4 SLA基因多态性的研究进展 | 第18-19页 |
| 2.5 SLA基因与疾病的研究进展 | 第19-20页 |
| 2.6 SLA基因的生物信息学研究 | 第20页 |
| 3 研究目的和意义 | 第20-22页 |
| 第二章 材料与方法 | 第22-32页 |
| 1 试验材料、数据收集、主要溶液试剂的配制和仪器设备 | 第22-25页 |
| 1.1 试验材料 | 第22页 |
| 1.2 数据收集 | 第22页 |
| 1.3 主要溶液试剂的配制 | 第22-24页 |
| 1.4 主要仪器设备 | 第24-25页 |
| 1.5 试验地点 | 第25页 |
| 2 试验方法 | 第25-30页 |
| 2.1 试验技术路线 | 第25页 |
| 2.2 基因组DNA抽提及检测 | 第25-27页 |
| 2.2.1 DNA的抽提 | 第25-26页 |
| 2.2.2 DNA模板检测 | 第26页 |
| 2.2.3 核酸浓度检测和稀释 | 第26-27页 |
| 2.3 SLA-DQA和SLA-DRA基因的PCR扩增反应 | 第27-28页 |
| 2.3.1 引物设计 | 第27页 |
| 2.3.2 稀释引物 | 第27页 |
| 2.3.3 PCR扩增反应 | 第27-28页 |
| 2.3.4 PCR扩增产物检测 | 第28页 |
| 2.4 SLA-DQA基因的SSCP检测 | 第28-29页 |
| 2.5 SLA-DQA和SLA-DRA基因的克隆测序 | 第29-30页 |
| 2.5.1 目的片段的纯化和回收 | 第29页 |
| 2.5.2 感受态细胞的制备 | 第29-30页 |
| 2.5.3 克隆 | 第30页 |
| 3 统计分析方法 | 第30-32页 |
| 3.1 序列比对及等位基因确定 | 第30-31页 |
| 3.2 群体遗传学分析 | 第31页 |
| 3.3 基因多态性与仔猪腹泻的相关性分析 | 第31页 |
| 3.4 单倍型的构建及连锁不平衡分析 | 第31页 |
| 3.5 基因的蛋白质结构预测和分析 | 第31-32页 |
| 第三章 结果和分析 | 第32-49页 |
| 1 基因组DNA的提取结果 | 第32页 |
| 2 SLA-DQA和SLA-DRA基因PCR-SSCP检测结果 | 第32-34页 |
| 2.1 SLA-DQA基因PCR-SSCP检测 | 第32-33页 |
| 2.1.1 DQA基因外显子2的PCR及SSCP检测结果 | 第32页 |
| 2.1.2 DQA基因外显子3的PCR及SSCP检测结果 | 第32-33页 |
| 2.1.3 DQA基因外显子4的PCR及SSCP检测结果 | 第33页 |
| 2.2 SLA-DRA基因PCR-SSCP检测 | 第33-34页 |
| 2.2.1 DRA基因外显子1的PCR及SSCP检测结果 | 第33页 |
| 2.2.2 DRA基因外显子2的PCR及SSCP检测结果 | 第33-34页 |
| 2.2.3 DRA基因外显子4的PCR及SSCP检测结果 | 第34页 |
| 3 SLA-DQA和SLA-DRA基因测序结果与分析 | 第34-38页 |
| 3.1 SLA-DQA基因测序结果与分析 | 第35-36页 |
| 3.1.1 SLA-DQA基因外显子2测序结果与分析 | 第35页 |
| 3.1.2 SLA-DQA基因外显子3测序结果与分析 | 第35-36页 |
| 3.1.3 SLA-DQA基因外显子4测序结果与分析 | 第36页 |
| 3.2 SLA-DRA基因测序结果与分析 | 第36-38页 |
| 3.2.1 SLA-DRA基因外显子1测序结果与分析 | 第36-37页 |
| 3.2.2 SLA-DRA基因外显子2测序结果与分析 | 第37页 |
| 3.2.3 SLA-DRA基因外显子4测序结果与分析 | 第37-38页 |
| 4 SLA-DQA和SLA-DRA基因群体遗传分析 | 第38-39页 |
| 4.1 SLA-DQA的基因型和等位基因频率及遗传多态性分析 | 第38页 |
| 4.2 SLA-DRA的基因型和等位基因频率及遗传多态性分析 | 第38-39页 |
| 5 SLA-DQA和SLA-DRA基因多态性与仔猪腹泻的相关分析 | 第39-42页 |
| 5.1 SLA-DQA基因三外显子多态性与仔猪腹泻的关联性 | 第39-41页 |
| 5.2 SLA-DRA基因三外显子多态性与仔猪腹泻的关联性 | 第41-42页 |
| 6 SLA-DQA和DRA基因单倍型构建及连锁分析 | 第42-44页 |
| 6.1 SLA-DQA基因单倍型构建和连锁分析 | 第42-43页 |
| 6.2 SLA-DRA基因单倍型构建和连锁分析 | 第43-44页 |
| 7 SLA-DQA和DRA基因CDS区蛋白质的结构及功能预测 | 第44-49页 |
| 7.1 SLA-DQA基因CDS区蛋白质结构功能特性预测 | 第44-46页 |
| 7.1.1 SLA-DQA基因CDS区蛋白质功能预测 | 第44-45页 |
| 7.1.2 SLA-DQA基因CDS区蛋白质高级结构预测及合理性分析 | 第45-46页 |
| 7.2 SLA-DRA基因CDS区蛋白质结构功能特性预测 | 第46-49页 |
| 7.2.1 SLA-DRA基因CDS区蛋白质功能预测 | 第46-47页 |
| 7.2.2 SLA-DRA基因CDS区蛋白质高级结构预测及合理性分析 | 第47-49页 |
| 第四章 讨论 | 第49-58页 |
| 1 SLA-DQA和DRA基因多态性 | 第49-51页 |
| 1.1 SLA-DQA基因多态性 | 第49-50页 |
| 1.2 SLA-DRA基因多态性 | 第50-51页 |
| 2 SLA-DQA和DRA基因群体遗传学特征 | 第51-52页 |
| 2.1 SLA-DQA基因群体遗传学特征 | 第51-52页 |
| 2.2 SLA-DRA基因群体遗传学特征 | 第52页 |
| 3 SLA-DQA和DRA基因型与仔猪腹泻分析 | 第52-53页 |
| 3.1 SLA-DQA基因型与仔猪腹泻分析 | 第52-53页 |
| 3.2 SLA-DRA基因型与仔猪腹泻分析 | 第53页 |
| 4 SLA-DQA和DRA单倍型构建与分析 | 第53-55页 |
| 4.1 SLA-DQA单倍型构建与分析 | 第54页 |
| 4.2 SLA-DRA单倍型构建与分析 | 第54-55页 |
| 5 SLA-DQA和DRA蛋白质模型与功能分析 | 第55-58页 |
| 5.1 SLA-DQA和SLA-DRA蛋白质功能分析 | 第55-56页 |
| 5.2 SLA-DQA和SLA-DRA蛋白质模型分析 | 第56-58页 |
| 第五章 结论 | 第58-60页 |
| 创新点 | 第60-61页 |
| 参考文献 | 第61-68页 |
| 附录 | 第68-69页 |
| 致谢 | 第69-70页 |
| 作者简介 | 第70-71页 |
| 导师简介 | 第71-72页 |
