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华东地区部分猪场关节炎主要病原菌流行状况调查及致病基因变异分析

摘要第6-8页
ABSTRACT第8-9页
符号说明第15-16页
第一章 文献综述第16-30页
    1 猪关节炎的研究进展第16-17页
        1.1 主要病原第16页
        1.2 临床症状第16-17页
        1.3 诊断检测第17页
        1.4 预防治疗第17页
    2 猪链球菌第17-22页
        2.1 病原学第18页
        2.2 主要致病因子第18-20页
            2.2.1 荚膜多糖第18-19页
            2.2.2 溶血素第19页
            2.2.3 谷氨酸脱氢酶第19页
            2.2.4 溶菌酶释放蛋白第19-20页
            2.2.5 细胞外因子第20页
            2.2.6 第二开放式阅读框第20页
            2.2.7 纤连蛋白结合蛋白第20页
        2.3 流行病学及危害第20-22页
    3 副猪嗜血杆菌第22-28页
        3.1 病原学第23页
        3.2 主要致病因子第23-26页
            3.2.1 37Kda蛋白第23-24页
            3.2.2 荚膜第24页
            3.2.3 脂低聚糖(LOS)第24页
            3.2.4 神经氨酸酶第24-25页
            3.2.5 转铁结合蛋白基因第25页
            3.2.6 6-磷酸葡萄糖脱氢酶第25页
            3.2.7 免疫球蛋白蛋白酶A第25页
            3.2.8 三聚体转运蛋白第25-26页
        3.3 流行病学及危害第26-28页
    4 多重PCR技术研究进展第28-29页
    5 本研究的目的与意义第29-30页
第二章 猪链球菌2型和副猪嗜血杆菌二重PCR检测方法的建立及应用第30-40页
    1 材料第30-31页
        1.1 菌株与样品采集第30页
        1.2 主要试剂第30-31页
        1.3 主要仪器第31页
    2 链球菌2型和副猪嗜血杆菌二重PCR方法的建立第31-36页
        2.1 引物第31页
        2.2 细菌培养第31-32页
        2.3 细菌DNA提取第32页
        2.4 DNA浓度测定第32页
        2.5 猪链球菌2型cps2J基因PCR扩增第32-33页
        2.6 副猪嗜血杆菌 16s rRNA基因PCR扩增第33页
        2.7 cps2J基因和 16s rRNA基因PCR产物回收第33页
        2.8 重组质粒标准品的制备第33-34页
            2.8.1 DH5α感受态细胞的制备第33-34页
            2.8.2 目的基因与载体的连接第34页
            2.8.3 重组质粒的转化第34页
            2.8.4 重组质粒的提取和鉴定第34页
        2.9 链球菌2型、副猪嗜血杆菌二重PCR方法的优化第34-36页
            2.9.1 退火温度优化第35页
            2.9.2 引物浓度优化第35页
            2.9.3 特异性试验第35页
            2.9.4 灵敏性试验第35页
            2.9.5 临床样品检测第35-36页
    3 结果第36-39页
        3.1 目的片段的克隆与鉴定第36-37页
        3.2 链球菌2型与副猪嗜血杆菌二重PCR方法退火温度优化第37页
        3.3 链球菌2型与副猪嗜血杆菌二重PCR方法引物浓度优化第37页
        3.4 链球菌2型与副猪嗜血杆菌二重PCR特异性试验第37-38页
        3.5 链球菌2型与副猪嗜血杆菌二重PCR灵敏度试验第38-39页
        3.6 样品PCR检测结果第39页
    4 讨论第39-40页
第三章 华东地区部分猪场链球菌2型毒力因子分布研究第40-56页
    1 材料第40-41页
        1.1 菌株与样品采集第40页
        1.2 主要试剂第40-41页
        1.3 主要仪器第41页
    2 华东地区部分猪场链球菌毒力因子PCR检测第41-44页
        2.1 引物第41-42页
        2.2 细菌培养第42页
        2.3 细菌DNA提取第42页
        2.4 样品链球菌检测第42页
        2.5 cps2J基因、ef基因和gdh基因三重PCR鉴定第42-43页
        2.6 sly基因、mrp基因、orf2基因和gadph基因四重PCR鉴定第43页
        2.7 链球菌2型cps2J基因产物回收第43页
        2.8 目的基因与载体的连接第43-44页
        2.9 重组质粒的转化第44页
        2.10 链球菌2型cps2J序列分析第44页
    3 结果第44-54页
        3.1 et-tu基因PCR检测链球菌第44-45页
        3.2 cps2J基因、ef基因、gdh基因三重PCR第45页
        3.3 sly基因、mrp基因、orf2基因、gadph基因4重PCR第45-46页
        3.4 毒力因子分布分析第46-47页
        3.5 分离株cps2J基因序列分析第47-53页
        3.6 cps基因进化树分析(聚类分析)第53-54页
    4 讨论第54-56页
第四章 副猪嗜血杆菌临床分离株RFLP-PCR分型第56-62页
    1 材料第56-57页
        1.1 样品第56页
        1.2 主要试剂第56页
        1.3 主要仪器第56-57页
    2 副猪嗜血杆菌分离株RFLP-PCR分型第57-59页
        2.1 引物第57页
        2.2 细菌培养第57页
        2.3 细菌DNA提取第57页
        2.4 副猪嗜血杆菌分离株tbpA基因PCR扩增第57-58页
        2.5 副猪嗜血杆菌tbpA基因PCR产物回收第58页
        2.6 tbpA基因TaqⅠ、AvaⅠ、RsaⅠ内切分型第58页
        2.7 内切酶图谱分析第58-59页
    3 结果第59-60页
        3.1 分离株tbpA基因PCR扩增结果第59页
        3.2 tbpA基因酶切结果第59页
        3.3 副猪嗜血杆菌分离株RFLP-PCR基因型命名结果第59-60页
    4 讨论第60-62页
第五章 猪链球菌、副猪嗜血杆菌临床分离株药敏试验第62-68页
    1 材料第62-63页
        1.1 样品第62页
        1.2 主要试剂第62页
        1.3 主要仪器第62-63页
    2 方法第63页
        2.1 细菌培养第63页
        2.2 药敏试验第63页
    3 结果第63-66页
        3.1 抑菌环直径测量试验第63页
        3.2 链球菌和副猪嗜血杆菌耐药性分析第63-66页
    4 讨论第66-68页
第六章 结论与展望第68-70页
    1 结论第68页
    2 未来研究的展望第68-70页
参考文献第70-80页
附录1 试剂的配置第80-81页
附录2 细菌基因组DNA快速提取试剂盒DN11说明书第81-82页
附录3 AXYPREP DNA凝胶回收试剂盒说明书第82-83页
附录4 小量AXYPREP质粒提取试剂盒说明书第83-84页
致谢第84-86页
攻读硕士学位期间已发表或录用的论文第86-88页

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