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高产番茄红素酿酒酵母的设计构建与发酵过程优化

中文摘要第4-5页
ABSTRACT第5-6页
第1章 文献综述第11-27页
    1.1 番茄红素概述第11-13页
        1.1.1 番茄红素的理化性质第11页
        1.1.2 番茄红素的功能、用途和市场需求第11-12页
        1.1.3 番茄红素生物合成的优势与不足第12-13页
    1.2 番茄红素异源生物合成的研究现状和挑战第13-18页
        1.2.1 番茄红素异源生物合成路径第13-15页
        1.2.2 大肠杆菌合成番茄红素研究进展第15-16页
        1.2.3 酵母合成番茄红素的优势与研究进展第16-18页
        1.2.4 酿酒酵母合成番茄红素面临的挑战第18页
    1.3 异源路径与底盘细胞的适配性研究第18-21页
        1.3.1 适配性要素第18-19页
        1.3.2 代谢路径优化第19-20页
        1.3.3 底盘细胞改造第20页
        1.3.4 异源路径与底盘细胞适配第20-21页
    1.4 番茄红素合成路径与酿酒酵母的适配性研究策略第21-23页
        1.4.1 强化前体物质供给第21-22页
        1.4.2 强化异源番茄红素合成路径第22-23页
        1.4.3 强化底盘细胞对产物耐受性第23页
    1.5 本课题的研究意义和主要内容第23-27页
        1.5.1 研究意义第23-24页
        1.5.2 主要研究内容第24-27页
第2章 敲除ypl062w强化前体物质供给第27-43页
    2.1 实验材料第28-31页
        2.1.1 菌株第28页
        2.1.2 实验仪器第28-30页
        2.1.3 主要试剂第30页
        2.1.4 培养基第30-31页
        2.1.5 溶液第31页
    2.2 实验方法第31-35页
        2.2.1 整合模块组装设计第31-32页
        2.2.2 整合模块构建方法第32-33页
        2.2.3 酵母转化第33-34页
        2.2.4 酵母基因组提取第34页
        2.2.5 摇瓶发酵第34页
        2.2.6 胞外代谢物检测第34页
        2.2.7 乙酰辅酶A定量第34-35页
        2.2.8 番茄红素提取与检测第35页
    2.3 结果与讨论第35-42页
        2.3.1 高效诱导型番茄红素合成路径的构建第35-37页
        2.3.2 敲除ypl062w对细胞生长和番茄红素合成的影响第37-39页
        2.3.3 敲除ypl062w对乙酸添加的响应第39-41页
        2.3.4 敲除ypl062w对乙酰辅酶A含量的影响第41-42页
    2.4 小结第42-43页
第3章 敲除ypl062w作用萜类产物合成的转录水平研究第43-61页
    3.1 实验材料第43-45页
        3.1.1 菌株第43-45页
        3.1.2 实验仪器第45页
        3.1.3 主要试剂第45页
        3.1.4 培养基第45页
        3.1.5 溶液第45页
    3.2 实验方法第45-49页
        3.2.1 整合模块构建第45-46页
        3.2.2 启动子强度表征第46页
        3.2.3 RNA-seq试验第46-47页
        3.2.4 显微镜观察第47页
        3.2.5 脂肪酸含量的测定第47页
        3.2.6 鲨烯、酵母固醇、麦角固醇的测定第47-48页
        3.2.7 香叶醇、香叶基香叶醇、青蒿二烯的测定第48-49页
    3.3 结果与讨论第49-59页
        3.3.1 敲除ypl062w对不同萜类化合物合成的影响第49-50页
        3.3.2 敲除ypl062w对MVA生成的影响第50-52页
        3.3.3 敲除ypl062w对能量代谢的影响第52-53页
        3.3.4 敲除ypl062w对异源基因表达的影响第53-55页
        3.3.5 敲除ypl062w对细胞膜组分的影响第55-59页
    3.4 小结第59-61页
第4章 YPL062W的功能再定义与重构第61-75页
    4.1 实验材料第61-67页
        4.1.1 菌株第61-66页
        4.1.2 实验仪器第66页
        4.1.3 主要试剂第66页
        4.1.4 培养基第66页
        4.1.5 溶液第66-67页
    4.2 实验方法第67-69页
        4.2.1 启动子进化保守性预测第67页
        4.2.2 启动子构建与突变第67页
        4.2.3 整合模块构建第67-68页
        4.2.4 启动子强度表征第68页
        4.2.5 萜类化合物的测定第68页
        4.2.6 荧光定量PCR第68-69页
    4.3 结果与讨论第69-74页
        4.3.1 YPL062W的转录本分析第69-70页
        4.3.2 YPL062W的功能再注释第70-72页
        4.3.3 YPL062W的重构与应用第72-74页
    4.4 小结第74-75页
第5章 番茄红素合成路径与酿酒酵母底盘细胞的适配第75-97页
    5.1 实验材料第76-82页
        5.1.1 菌株第76-82页
        5.1.2 实验仪器第82页
        5.1.3 主要试剂第82页
        5.1.4 培养基第82页
        5.1.5 溶液第82页
    5.2 实验方法第82-84页
        5.2.1 整合模块构建第82-83页
        5.2.2 启动子强度表征第83页
        5.2.3 显微镜观察第83-84页
    5.3 结果与讨论第84-95页
        5.3.1 CrtE、CrtB、CrtI来源组合筛选第84-87页
        5.3.2 CrtI微调以及细胞交配型的选择第87-90页
        5.3.3 敲除远端遗传基因座对番茄红素合成的影响第90-92页
        5.3.4 过表达INO对番茄红素合成的影响第92-93页
        5.3.5 异源表达VHb对细胞生长和番茄红素产量的影响第93-95页
    5.4 小结第95-97页
第6章 发酵过程优化第97-109页
    6.1 实验材料第97-98页
        6.1.1 菌株第97页
        6.1.2 实验仪器第97页
        6.1.3 主要试剂第97-98页
        6.1.4 培养基第98页
        6.1.5 溶液第98页
    6.2 实验方法第98-99页
        6.2.1 发酵罐发酵(5L)第98-99页
        6.2.2 发酵罐发酵(50L)第99页
    6.3 结果与讨论第99-107页
        6.3.1 基础发酵培养基确定第99-100页
        6.3.2 发酵罐(5L)分批补料条件优化第100-103页
        6.3.3 发酵罐(5L)分批补料发酵碳源优化第103-104页
        6.3.4 发酵罐(50L)过程控制优化第104-107页
    6.4 小结第107-109页
第7章 结论与展望第109-113页
    7.1 结论第109-111页
    7.2 创新点第111页
    7.3 展望第111-113页
参考文献第113-127页
发表论文和参加科研情况说明第127-129页
附录A第129-149页
致谢第149-150页

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