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生物酶法合成肝素的多种关键酶制备和酶反应工程研究

致谢第5-6页
摘要第6-8页
Abstract第8-9页
第一章 绪论第15-39页
    1.1 生物合成肝素第15-20页
        1.1.1 肝素研究背景第15-16页
        1.1.2 肝素的体内合成途径第16-17页
        1.1.3 体外酶法合成肝素第17-19页
        1.1.4 体外酶法合成超低分子量肝素(ULMWH)第19-20页
    1.2 PAPS的合成以及PAPS再生系统的研究进展第20-22页
        1.2.1 PAPS的酶法合成第21页
        1.2.2 PAPS再生系统第21-22页
    1.3 肝素修饰酶的研究进展第22-28页
        1.3.1 肝素修饰酶的表达情况第22页
        1.3.2 肝素修饰酶的底物特异性第22-25页
        1.3.3 肝素修饰酶的结构第25-28页
    1.4 酶一步纯化与定点固定化研究进展第28-30页
        1.4.1 常用的固定化酶方法第28-29页
        1.4.2 甲酰甘氨酸修饰与酶的固定化第29-30页
    1.5 肝素结构的分析技术第30-32页
    1.6 UDP-GlcNAc和UDP-GlcNTFA的合成研究进展第32-38页
        1.6.1 UDP-GlcNAc合成的研究进展第32-35页
        1.6.2 UDP-GlcNTFA合成的研究进展第35-38页
    1.7 本课题的基本思路和研究内容第38-39页
第二章 材料与方法第39-46页
    2.1 实验材料第39-40页
        2.1.1 实验菌株第39页
        2.1.2 质粒第39页
        2.1.3 重要试剂、工具酶及试剂盒第39页
        2.1.4 培养基第39-40页
    2.2 试验仪器第40-41页
    2.3 实验及分析方法第41-46页
        2.3.1 分子克隆实验第41-43页
        2.3.2 目标蛋白在大肠杆菌中诱导表达、检测分析及分离纯化第43-46页
第三章 3'-磷酸腺苷5'-磷酸硫酸的酶法合成第46-56页
    3.1 引言第46-47页
    3.2 材料与方法第47-49页
        3.2.1 材料第47页
        3.2.2 方法第47-49页
    3.3 结果与讨论第49-55页
        3.3.1 ATP硫化酶和APS激酶表达与纯化第49-50页
        3.3.2 PAPS合成条件的优化第50-53页
        3.3.3 最适条件下,不同底物浓度PAPS随时间的积累量变化第53页
        3.3.4 底物fed-batch以提高反应的转化效率第53-54页
        3.3.5 PAPS反应产物的LC-MS验证第54-55页
    3.4 本章小结第55-56页
第四章 五种肝素修饰酶在大肠杆菌中的重组表达和纯化第56-73页
    4.1 引言第56页
    4.2 实验材料第56页
        4.2.1 菌株及培养基第56页
        4.2.2 主要试剂第56页
    4.3 实验方法第56-58页
        4.3.1 C5异构化酶,2OST,6OST1,6OST3以及3OST1的全基因合成第56-57页
        4.3.2 质粒的构建第57页
        4.3.3 表达重组蛋白第57页
        4.3.4 重组蛋白的纯化第57页
        4.3.5 重组蛋白的脱盐浓缩第57-58页
    4.4 结果与讨论第58-72页
        4.4.1 肝素修饰酶C5 epimerase,2OST,6OST1,6OST3和3OST的密码子优化第58页
        4.4.2 C5异构化酶的表达与纯化第58-61页
        4.4.3 2OST的表达与纯化第61-63页
        4.4.4 6OST1的表达与纯化第63-65页
        4.4.5 6OST3的表达与纯化第65-68页
        4.4.6 3OST1的表达与纯化第68-71页
        4.4.7 五个酶纯化后浓缩效果第71-72页
    4.5 本章小结第72-73页
第五章 麦芽糖结合蛋白的甲酰甘氨酸修饰及定点固定化第73-96页
    5.1 引言第73-74页
    5.2 实验材料第74页
        5.2.1 主要试剂第74页
    5.3 实验方法第74-79页
        5.3.1 同源建模以及醛基化标签插入位点的选择第74页
        5.3.2 载体的构建第74-77页
        5.3.3 重组蛋白表达第77页
        5.3.4 一步固定化以及纯化第77-78页
        5.3.5 绿色荧光蛋白荧光量的测定第78页
        5.3.6 精氨酸水解酶酶活的测定第78-79页
    5.4 结果第79-92页
        5.4.1 同源建模以及醛基化标签插入位点的选择第79-82页
        5.4.2 pMAl-mbp-FGE质粒的构建,表达以及一步固定化第82-86页
        5.4.3 GFP的一步纯化以及固定化第86-87页
        5.4.4 精氨酸水解酶的一步纯化以及固定化第87-89页
        5.4.5 固定化精氨酸水解酶的酶学性质第89-92页
    5.5 讨论第92-95页
    5.6 本章小结第95-96页
第六章 肝素修饰酶的定点固定化及一锅法制备生物肝素第96-107页
    6.1 引言第96页
    6.2 实验材料第96页
    6.3 实验方法第96-99页
        6.3.1 N-sulfo heparosan的制备第96-97页
        6.3.2 表达载体的构建第97页
        6.3.3 表达重组蛋白第97页
        6.3.4 一步固定化以及纯化第97页
        6.3.5 生物合成肝素的制备第97-98页
        6.3.6 定性检测生物合成肝素的生物活性第98页
        6.3.7 血凝仪-APTT法测定肝素的效价第98-99页
    6.4 结果与讨论第99-105页
        6.4.1 N-solfo heparosan的制备第99-100页
        6.4.2 质粒的构建第100-101页
        6.4.3 C5 epimerase,2OST,6OST1,6OST3,3OST1的固定化第101-103页
        6.4.4 定性测定肝素的抗凝血活性第103-104页
        6.4.5 血凝仪-APTT法定量测定肝素的效价第104-105页
    6.5 本章小结第105-107页
第七章 肝素的结构鉴定第107-120页
    7.1 引言第107-108页
    7.2 实验材料第108页
    7.3 实验方法第108-109页
        7.3.1 酶水解制备肝素二糖第108页
        7.3.2 使用G-10预装柱处理肝素二糖第108-109页
        7.3.3 SAX-HPLC分析肝素二糖第109页
    7.4 结果与讨论第109-118页
        7.4.1 Hep Ⅰ,Ⅱ,Ⅲ裂解肝素类物质的最佳时间第109-110页
        7.4.2 G-10预装柱回收肝素裂解二糖的效果第110-111页
        7.4.3 SAX-HPLC分析条件的优化第111-113页
        7.4.4 SAX-HPLC分析肝素二糖第113-118页
    7.5 本章小结第118-120页
第八章 UDP-N-乙酰葡萄糖胺和UDP-N-三氟乙酰葡萄糖胺的化学酶法合成第120-139页
    8.1 引言第120-121页
    8.2 实验材料第121页
        8.2.1 载体与菌株第121页
        8.2.2 主要用酶第121页
    8.3 实验方法第121-127页
        8.3.1 GlcNTFA的化学合成第121页
        8.3.2 引物设计第121页
        8.3.3 大肠杆菌K12(MG1655)以及双歧杆菌基因组的提取第121-122页
        8.3.4 PCR扩增目的基因第122页
        8.3.5 重组表达载体的构建第122-123页
        8.3.6 表达重组蛋白第123页
        8.3.7 目标蛋白分离纯化第123-124页
        8.3.8 NahK、GlmU、PPase酶活的测定第124-126页
        8.3.9 酶法合成UDP-GlcNAc和UDP-GlcNTFA第126页
        8.3.10 产物的分析第126-127页
        8.3.11 制备型HPLC分离UDP-GlcNAc和UDP-GlcNTFA第127页
    8.4 结果与讨论第127-137页
        8.4.1 化学合成GlcNTFA第127-128页
        8.4.2 酶的克隆,表达与纯化第128-129页
        8.4.3 酶法合成UDP-GlcNAc和UDP-GlcNTFA第129-131页
        8.4.4 不同反应条件对合成UDP-GlcNAc和UDP-GlcNTFA的影响第131-135页
        8.4.5 底物分批补料的放大UDP-GlcNAc和UDP-GlcNTFA生产第135-137页
    8.5 本章小结第137-139页
第九章 结论与展望第139-143页
    9.1 结论第139-141页
    9.2 创新点第141页
    9.3 展望第141-143页
参考文献第143-153页
附录第153-161页
作者简历第161页

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