摘要 | 第5-6页 |
ABSTRACT | 第6-7页 |
第一章 绪论 | 第10-14页 |
1.1 课题的研究背景及研究目的和意义 | 第10-11页 |
1.2 本文研究内容 | 第11-12页 |
1.3 本文章节安排 | 第12-14页 |
第二章 差异甲基化区域识别算法的研究现状和相关工作 | 第14-22页 |
2.1 引言 | 第14页 |
2.2 问题的描述 | 第14-15页 |
2.3 相关的工作 | 第15-18页 |
2.4 目前方法存在的问题 | 第18页 |
2.5 论文实验相关的工作 | 第18-21页 |
2.5.1 缺失数据预处理 | 第19-21页 |
2.5.2 样本不平衡数据处理 | 第21页 |
2.6 本章小结 | 第21-22页 |
第三章 利用滑动窗口和KNN算法识别差异甲基化区域 | 第22-34页 |
3.1 相关定义 | 第22-24页 |
3.2 SWKA算法描述 | 第24-26页 |
3.3 实验结果与分析 | 第26-33页 |
3.3.1 实验环境和数据来源 | 第26-27页 |
3.3.2 结果度量测度 | 第27-28页 |
3.3.3 聚类验证与数据分类 | 第28页 |
3.3.4 结果分析 | 第28-33页 |
3.4 本章小结 | 第33-34页 |
第四章 基于贪心策略的差异甲基化区域识别算法 | 第34-44页 |
4.1 引言 | 第34页 |
4.2 Idmrags算法描述 | 第34-38页 |
4.2.1 筛选候选差异甲基化区域模型 | 第34-35页 |
4.2.2 识别差异甲基化区域模型 | 第35-36页 |
4.2.3 贪心选择策略 | 第36-37页 |
4.2.4 算法设计 | 第37页 |
4.2.5 识别差异甲基化区域 | 第37-38页 |
4.3 实验结果与分析 | 第38-43页 |
4.3.1 实验评价指标 | 第38页 |
4.3.2 聚类验证与数据分类 | 第38-39页 |
4.3.3 实验结果分析 | 第39-43页 |
4.4 本章小结 | 第43-44页 |
第五章 基于聚类验证技术的启发式差异甲基化区域识别算法 | 第44-52页 |
5.1 引言 | 第44页 |
5.2 Idmraca算法描述 | 第44-46页 |
5.2.1 基于聚类验证技术的DMRs识别模型 | 第44-45页 |
5.2.2 启发式算法 | 第45-46页 |
5.2.3 算法设计 | 第46页 |
5.3 实验结果与分析 | 第46-51页 |
5.3.1 实验结果评价指标 | 第46-47页 |
5.3.2 实验结果分析 | 第47-51页 |
5.4 本章小结 | 第51-52页 |
第六章 总结和展望 | 第52-54页 |
6.1 全文总结 | 第52-53页 |
6.2 展望 | 第53-54页 |
致谢 | 第54-55页 |
参考文献 | 第55-59页 |
附录 | 第59-60页 |
详细摘要 | 第60-62页 |