| 摘要 | 第8-10页 |
| ABSTRACT | 第10-12页 |
| 缩略语表 | 第13-14页 |
| 第一章 前言 | 第14-24页 |
| 1 神农架金丝猴概述 | 第14-15页 |
| 1.1 金丝猴的分类与地理分布 | 第14页 |
| 1.2 神农架金丝猴的介绍 | 第14-15页 |
| 1.3 神农架金丝猴的保护 | 第15页 |
| 2 益生菌的概述 | 第15-18页 |
| 2.1 益生菌的益生作用 | 第15-16页 |
| 2.1.1 维持肠道微生态平衡 | 第15-16页 |
| 2.1.2 增强机体免疫力 | 第16页 |
| 2.1.3 提供营养物质和各种酶 | 第16页 |
| 2.2 益生菌株的应用原则 | 第16-17页 |
| 2.2.1 安全性 | 第16-17页 |
| 2.2.2 有效性 | 第17页 |
| 2.2.3 可生产性 | 第17页 |
| 2.3 益生粪肠球菌的生物学特性 | 第17页 |
| 2.4 益生粪肠球菌的发酵工艺 | 第17-18页 |
| 2.4.1 培养条件 | 第17-18页 |
| 2.4.2 培养基的优化 | 第18页 |
| 2.5 益生粪肠球菌的实际应用 | 第18页 |
| 3 肠道菌群的概述 | 第18-22页 |
| 3.1 肠道菌群对机体的作用 | 第19页 |
| 3.2 肠道菌群失调引起的疾病 | 第19-20页 |
| 3.2.1 消化系统疾病 | 第19页 |
| 3.2.2 心血管系统疾病 | 第19-20页 |
| 3.2.3 内分泌系统疾病 | 第20页 |
| 3.2.4 精神性疾病 | 第20页 |
| 3.2.5 特应性疾病 | 第20页 |
| 3.3 灵长类肠道菌群的研究现状 | 第20-22页 |
| 3.3.1 人类肠道菌群的研究现状 | 第20-21页 |
| 3.3.2 非人灵长类肠道菌群的研究现状 | 第21-22页 |
| 4 宏基因组学 | 第22-23页 |
| 4.1 宏基因组学的定义及应用领域 | 第22页 |
| 4.2 宏基因组学在人肠道微生物研究中的应用 | 第22-23页 |
| 5 本研究的目的与意义 | 第23-24页 |
| 第二章 金丝猴源粪肠球菌dlt7a发酵工艺的优化 | 第24-39页 |
| 1 研究目的和意义 | 第24页 |
| 2 材料与方法 | 第24-28页 |
| 2.1 试验材料 | 第24-25页 |
| 2.1.1 菌种 | 第24页 |
| 2.1.2 主要试剂 | 第24页 |
| 2.1.3 培养基配制 | 第24-25页 |
| 2.1.4 主要仪器设备 | 第25页 |
| 2.2 试验方法 | 第25-26页 |
| 2.2.1 粪肠球菌的活化 | 第25页 |
| 2.2.2 粪肠球菌的计数 | 第25-26页 |
| 2.3 种子培养基的筛选与种龄的确定 | 第26页 |
| 2.3.1 种子培养基的筛选 | 第26页 |
| 2.3.2 种龄的确定 | 第26页 |
| 2.4 发酵培养基的优化 | 第26-28页 |
| 2.4.1 发酵培养条件的确定 | 第26-27页 |
| 2.4.2 发酵培养基配方的优化 | 第27-28页 |
| 2.4.3 优化前后发酵培养基的比较 | 第28页 |
| 3 结果与分析 | 第28-37页 |
| 3.1 最佳种子培养基 | 第28-29页 |
| 3.2 最佳接种时间 | 第29-30页 |
| 3.3 培养条件的优化 | 第30-32页 |
| 3.3.1 最佳装液量 | 第30页 |
| 3.3.2 最佳接种量 | 第30-31页 |
| 3.3.3 最佳初始pH值 | 第31-32页 |
| 3.4 发酵培养基的优化 | 第32-36页 |
| 3.4.1 PB试验设计 | 第32-33页 |
| 3.4.2 最陡爬坡试验 | 第33页 |
| 3.4.3 Box-Behnken响应面法 | 第33-36页 |
| 3.5 优化前后发酵培养基的比较 | 第36-37页 |
| 4 讨论 | 第37-38页 |
| 4.1 种子液的制备 | 第37页 |
| 4.2 发酵培养基的优化 | 第37-38页 |
| 5 小结 | 第38-39页 |
| 第三章 金丝猴源粪肠球菌dlt7a益生菌制剂对宿主肠道菌群的影响 | 第39-63页 |
| 1 研究目的和意义 | 第39页 |
| 2 材料与方法 | 第39-44页 |
| 2.1 材料 | 第39-41页 |
| 2.1.1 试验动物及其饲养管理 | 第39页 |
| 2.1.2 菌种 | 第39-40页 |
| 2.1.3 培养基的配制 | 第40页 |
| 2.1.4 主要试剂及溶液的配制 | 第40页 |
| 2.1.5 主要仪器设备 | 第40-41页 |
| 2.2 方法 | 第41-44页 |
| 2.2.1 制备粪肠球菌dlt7a益生菌制剂 | 第41页 |
| 2.2.2 动物饲喂实验 | 第41-42页 |
| 2.2.3 宏基因组测序 | 第42-43页 |
| 2.2.4 生物信息学分析 | 第43-44页 |
| 2.2.5 数据统计分析 | 第44页 |
| 3 结果与分析 | 第44-58页 |
| 3.1 粪肠球菌dlt7a益生菌制剂的制备 | 第44页 |
| 3.2 宏基因组测序结果 | 第44-45页 |
| 3.3 神农架金丝猴肠道菌群的多样性 | 第45-47页 |
| 3.4 粪肠球菌dlt7a对神农架金丝猴肠道菌群结构的影响 | 第47-55页 |
| 3.4.1 基于门水平的影响 | 第47-50页 |
| 3.4.2 基于属水平的影响 | 第50-53页 |
| 3.4.3 基于种水平的影响 | 第53-55页 |
| 3.5 粪肠球菌dlt7a对神农架金丝猴肠道菌群潜在功能的影响 | 第55-58页 |
| 3.5.1 肠道菌群宏基因组的碳水化合物活性酶注释的比较分析 | 第55-56页 |
| 3.5.2 肠道菌群宏基因组的KEGG功能分类的比较分析 | 第56-58页 |
| 4 讨论 | 第58-61页 |
| 4.1 动物试验 | 第58页 |
| 4.2 粪肠球菌dlt7a对神农架金丝猴肠道菌群结构的影响 | 第58-60页 |
| 4.3 粪肠球菌dlt7a对神农架金丝猴肠道菌群潜在功能的影响 | 第60-61页 |
| 4.3.1 基于CAZy注释的影响 | 第60-61页 |
| 4.3.2 基于KEGG通路功能分类的影响 | 第61页 |
| 5 小结 | 第61-63页 |
| 结论 | 第63-64页 |
| 参考文献 | 第64-74页 |
| 附录 | 第74-81页 |
| 致谢 | 第81页 |
