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NaHCO3胁迫下柽柳根部组织基因的表达调控研究

摘要第1-5页
Abstract第5-13页
1 绪论第13-33页
 引言第13页
   ·植物耐盐机理研究第13-16页
     ·渗透调节第13-14页
     ·离子区域化第14-15页
     ·改变光合作用途径第15页
     ·活性氧清除第15-16页
   ·转录组学研究方法第16-22页
     ·基因芯片第16-17页
     ·基因表达系列分析第17-18页
     ·大规模平行测序技术第18页
     ·基于新一代高通量测序技术的转录组测序(RNA-Seq)第18-22页
   ·植物水通道蛋白的研究进展第22-30页
     ·水通道蛋白的发现第22-23页
     ·水通道蛋白的结构第23-24页
     ·水通道蛋白的分类第24-25页
     ·植物水通道蛋白的功能第25-27页
     ·植物水通道蛋白的表达和活性调控第27-30页
   ·本研究的目的与意义第30页
   ·研究内容及技术路线第30-33页
2 NaHCO_3胁迫下柽柳根部转录组分析第33-59页
   ·试验材料第33页
     ·植物材料第33页
     ·试剂第33页
   ·试验方法第33-38页
     ·柽柳总RNA的提取第33-34页
     ·Solexa测序第34页
     ·转录组测序产量统计及组装第34-35页
     ·基因功能注释第35页
     ·基因表达量注释第35页
     ·NaHCO_3胁迫下柽柳根组织基因表达谱的构建第35-36页
     ·基因表达谱的Real-Time PCR验证第36-38页
   ·结果与分析第38-57页
     ·RNA质量检测第38-39页
     ·Solexa测序产量和组装质量统计第39-40页
     ·基因功能注释第40-42页
     ·高丰度表达基因分析第42-44页
     ·差异表达基因的筛选第44-46页
     ·差异表达基因的GO功能分类第46-48页
     ·差异表达基因的STEM聚类和功能富集分析第48-50页
     ·盐胁迫应答相关转录因子的鉴定第50-53页
     ·盐碱胁迫应答相关基因分析第53-54页
     ·Solexa测序结果的Real-Time PCR验证第54-57页
   ·讨论第57-58页
   ·本章小结第58-59页
3 脂质转运蛋白家族基因的克隆与分析第59-74页
   ·试验材料第59页
     ·植物材料第59页
   ·试验方法第59-61页
     ·植物材料的处理第59页
     ·脂质转移蛋白家族基因的克隆与序列分析第59页
     ·实时荧光定量RT-PCR第59-61页
   ·结果与分析第61-71页
     ·ThLTP家族基因的克隆与生物信息学分析第61-63页
     ·ThLTPs基因在根、茎和叶中的转录第63-64页
     ·ThLTPs基因响应不同胁迫表达模式分析第64-71页
   ·讨论第71-73页
   ·本章小结第73-74页
4 水通道蛋白家族基因的克隆与分析第74-86页
   ·试验材料第74页
     ·植物材料第74页
   ·试验方法第74-75页
     ·植物材料的处理第74页
     ·水通道蛋白家族基因的克隆与序列分析第74页
     ·实时荧光定量RT-PCR第74-75页
   ·结果与分析第75-85页
     ·ThAQP家族基因的克隆和生物信息学分析第75-78页
     ·ThAQPs基因响应不同胁迫表达模式分析第78-85页
   ·讨论第85页
   ·本章小结第85-86页
5 柽柳ThAQP11启动子的克隆及功能分析第86-97页
   ·试验材料第86-87页
     ·植物材料第86页
     ·菌种与载体第86页
     ·主要试剂第86页
     ·主要培养基第86-87页
     ·溶液配制第87页
   ·试验方法第87-92页
     ·ThAQP11基因的启动子克隆及分析第87-88页
     ·ThAQP11启动子的表达特性分析第88-89页
     ·柽柳ThAQP11基因上游表达调控基因的研究第89-92页
   ·结果与分析第92-96页
     ·ThAQP11基因启动子序列分析第92-93页
     ·ThAQP11基因的时空表达特性第93-94页
     ·pHIS2-靶DNA重组报告载体的获得及其3-AT浓度选择第94页
     ·报告载体(pHIS2-靶DNA)与文库的互作筛选第94-95页
     ·ThAQP11基因上游调控因子的确定第95-96页
   ·讨论第96页
   ·本章小结第96-97页
结论第97-99页
参考文献第99-111页
附录第111-112页
攻读学位期间发表的学术论文第112-113页
致谢第113-114页

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