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UVA辐射诱导黑腹果蝇差异表达基因的研究

中文摘要第7-9页
ABSTRACT第9-10页
第一章 文献综述第11-27页
    1 昆虫趋光性研究进展第11-20页
        1.1 昆虫视觉生理特性第11-14页
        1.2 昆虫趋光特性第14-16页
        1.3 昆虫应答UV辐射的研究第16-20页
    2 基因差异表达的研究第20-26页
        2.1 抑制性消减杂交(SSH)技术第20-24页
        2.2 数字表达谱RNA-Seq(Quantification)技术第24-26页
    3 本研究的目的和意义第26-27页
第二章 SSH文库的构建及差异表达基因的筛选第27-52页
    1 前言第27-28页
    2 材料和方法第28-37页
        2.1 供试昆虫第28页
        2.2 主要仪器与试剂第28-30页
        2.3 UVA辐射处理第30页
        2.4 总RNA提取和Poly A~+ RNA纯化第30-31页
        2.5 差异消减cDNA文库构建第31-34页
        2.6 产物转化测序分析第34-35页
        2.7 Gene Ontology(GO)功能分析第35页
        2.8 实时荧光定量PCR(qRT-PCR)分析第35-37页
        2.9 基因上游调控区分析第37页
    3 结果与分析第37-49页
        3.1 总RNA质量检测第37-38页
        3.2 抑制消减cDNA文库构建第38页
        3.3 消减SSH文库的筛选和ESTs序列分析第38-43页
        3.4 ESTs功能分类第43-44页
        3.5 差异表达基因的qRT-PCR分析验证第44-45页
        3.6 差异表达基因的启动子序列分析第45-49页
    4 讨论第49-52页
        4.1 参与UVA辐射的应激和免疫应答第49-50页
        4.2 参与UVA辐射的应答的能量和蛋白质代谢第50-52页
第三章 RNA-Seq文库的构建和差异表达基因的筛选第52-79页
    1 前言第52页
    2 材料与方法第52-58页
        2.1 供试昆虫第52页
        2.2 主要仪器与试剂第52-53页
        2.3 UVA辐射处理第53页
        2.4 总RNA的提取和纯化第53页
        2.5 文库的制备和Illumina测序第53-54页
        2.6 差异表达基因的筛选第54-55页
        2.7 qRT-PCR验证分析第55-56页
        2.8 DEG的生物信息学分析第56-58页
    3 结果与分析第58-74页
        3.1 Illumina测序文库数据分析第58-60页
        3.2 DEGs的鉴定和分析第60-63页
        3.3 DEGs的qRT-PCR分析验证第63-70页
        3.4 基因表达趋势聚类分析第70-72页
        3.5 显著性聚类模型的GO功能分析第72-74页
    4 讨论第74-79页
        4.1 UVA辐射诱导的应激和防御反应第74-76页
        4.2 UVA辐射对代谢过程的影响第76-79页
第四章 UVA辐射对CG7708转录水平和ACh含量的影响第79-88页
    1 前言第79-80页
    2 材料与方法第80-82页
        2.1 供试昆虫第80页
        2.2 主要仪器与试剂第80页
        2.3 UVA辐射处理第80页
        2.4 qRT-PCR分析第80-81页
        2.5 乙酰胆碱(ACh)含量测定第81-82页
        2.6 数据分析第82页
    3 结果与分析第82-87页
        3.1 CG7708表达模式第82-83页
        3.2 ACh含量测定第83-84页
        3.3 CG7708表达水平和ACh含量相关性分析第84-87页
    4 讨论第87-88页
第五章 全文总结与展望第88-91页
    1 全文总结第88-89页
    2 创新点第89-90页
    3 展望第90-91页
参考文献第91-106页
致谢第106-108页
附录第108页

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