| 致谢 | 第5-7页 |
| 摘要 | 第7-9页 |
| Abstract | 第9-11页 |
| 缩略语表 | 第12-20页 |
| 第1章 绪论 | 第20-40页 |
| 1.1 计算机辅助药物设计概述 | 第20-22页 |
| 1.1.1 计算机辅助药物设计发展概况 | 第20-21页 |
| 1.1.2 计算机辅助药物设计与药理学、毒理学的关系 | 第21-22页 |
| 1.2 计算毒理学的研究背景与意义 | 第22-23页 |
| 1.3 计算毒理学概述 | 第23-25页 |
| 1.4 定量结构毒性关系及其拓展 | 第25-26页 |
| 1.5 机器学习及其在毒性理论预测中的应用 | 第26-38页 |
| 1.5.1 机器学习的发展概况 | 第26-29页 |
| 1.5.2 机器学习算法沿革和软件实现 | 第29-37页 |
| 1.5.3 机器学习在毒性理论预测中的应用 | 第37-38页 |
| 1.6 毒性理论预测方法面临的挑战和机遇 | 第38页 |
| 1.7 本文的研究内容 | 第38-40页 |
| 第2章 药物经口急性毒性的理论预测 | 第40-63页 |
| 2.1 引言 | 第40-42页 |
| 2.2 研究方法 | 第42-47页 |
| 2.2.1 数据集构建和预处理 | 第42页 |
| 2.2.2 分子描述符的计算 | 第42页 |
| 2.2.3 数据降维 | 第42-43页 |
| 2.2.4 QSTR建模方法 | 第43-46页 |
| 2.2.5 QSTR模型的评估和验证 | 第46页 |
| 2.2.6 应用域分析 | 第46-47页 |
| 2.2.7 预测误差较大化合物的骨架分析 | 第47页 |
| 2.3 研究结果与讨论 | 第47-61页 |
| 2.3.1 大鼠经口急性毒性数据的性质分布 | 第47-51页 |
| 2.3.2 大鼠经口急性毒性的各回归模型的比较 | 第51-54页 |
| 2.3.3 通过一致性建模准确预测大鼠经口急性毒性 | 第54-55页 |
| 2.3.4 对具有较大预测误差的化合物的分析 | 第55-58页 |
| 2.3.5 RVM回归模型给出的重要描述符和片段的分析 | 第58-61页 |
| 2.4 本章小结 | 第61-63页 |
| 第3章 药物呼吸道毒性的定性和定量预测 | 第63-92页 |
| 3.1 引言 | 第63-66页 |
| 3.2 研究方法 | 第66-74页 |
| 3.2.1 数据集构建和预处理 | 第66-67页 |
| 3.2.2 分子描述符的计算 | 第67页 |
| 3.2.3 数据降维 | 第67-68页 |
| 3.2.4 QSTR建模方法 | 第68-71页 |
| 3.2.5 QSTR模型的评价和验证 | 第71-72页 |
| 3.2.6 应用域分析 | 第72-73页 |
| 3.2.7 具有较大预测误差的化合物分析 | 第73-74页 |
| 3.3 研究结果与讨论 | 第74-91页 |
| 3.3.1 小鼠腹腔注射致呼吸道毒性数据的性质分析 | 第74-78页 |
| 3.3.2 小鼠呼吸道毒性的各回归模型的比较 | 第78-80页 |
| 3.3.3 小鼠呼吸道毒性的各分类模型的比较 | 第80-83页 |
| 3.3.4 对具有较大预测误差的化合物的分析 | 第83-85页 |
| 3.3.5 XGBoost模型分类错误的分子的重要片段分析 | 第85-91页 |
| 3.4 本章小结 | 第91-92页 |
| 第4章 基于提升算法的药物泌尿系统毒性的理论预测 | 第92-124页 |
| 4.1 引言 | 第92-96页 |
| 4.2 研究方法 | 第96-105页 |
| 4.2.1 数据集构建和预处理 | 第96-97页 |
| 4.2.2 数据降维 | 第97-98页 |
| 4.2.3 QSTR建模方法 | 第98-102页 |
| 4.2.4 QSTR模型的评估和验证 | 第102-104页 |
| 4.2.5 应用域分析 | 第104-105页 |
| 4.2.6 基于SARpy的化合物结构警报分析 | 第105页 |
| 4.3 研究结果与讨论 | 第105-122页 |
| 4.3.1 小鼠腹腔注射致泌尿系统毒性数据的性质分析 | 第105-110页 |
| 4.3.2 小鼠泌尿系统毒性的各回归模型的比较 | 第110-113页 |
| 4.3.3 小鼠泌尿系统毒性的各分类模型的比较 | 第113-116页 |
| 4.3.4 对具有较大预测误差的化合物的分析 | 第116-119页 |
| 4.3.5 rbfSVMBoost模型分类错误化合物的分析 | 第119-122页 |
| 4.3.6 泌尿系统毒性的结构警报分析 | 第122页 |
| 4.4 本章小结 | 第122-124页 |
| 第5章 总结和展望 | 第124-128页 |
| 5.1 总结 | 第124-126页 |
| 5.2 存在的不足和展望 | 第126-128页 |
| 主要创新性 | 第128-129页 |
| 参考文献 | 第129-153页 |
| 作者简介 | 第153-154页 |
| 附录 | 第154-161页 |
