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半夏凝集素结构分析与分子模拟研究

摘要第1-9页
Abstract第9-13页
第一章 文献综述第13-19页
   ·凝集素第13-15页
     ·植物凝集素第13页
     ·甘露糖结合型植物凝集素第13-14页
     ·半夏凝集素第14-15页
   ·植物凝集素结构与功能的研究第15-16页
     ·植物凝集素结构第15-16页
     ·植物凝集素功能第16页
   ·分子模拟第16-17页
     ·同源建模第16-17页
     ·分子对接第17页
   ·本实验的研究目的、研究思路及内容第17-19页
     ·研究目的第17页
     ·研究方法和内容第17-19页
第二章 半夏凝集素结构预测分析第19-30页
   ·实验第19-20页
     ·实验材料与仪器第19-20页
     ·实验方法第20页
       ·半夏凝集素一级结构分析第20页
       ·半夏凝集素二级结构预测第20页
       ·半夏凝集素的其他功能性结构的预测第20页
   ·结果分析第20-29页
     ·半夏凝集素一级结构分析第20-24页
       ·半夏凝集素基本理化性质分析第20-22页
       ·半夏凝集素的疏水性分析第22页
       ·半夏凝集素序列比对与同源树分析第22-24页
     ·半夏凝集素二级结构预测第24-25页
     ·半夏凝集素的功能预测第25-29页
       ·蛋白跨膜域分析第25-26页
       ·蛋白信号肽分析第26页
       ·蛋白的亚细胞定位第26-27页
       ·蛋白中典型氨基酸残基的磷酸化分析第27页
       ·蛋白豆蔻酰化,蛋白激酶磷酸化、糖基化及甘露糖特异性结合位点的分析第27-28页
       ·蛋白功能域分析第28-29页
   ·讨论与结论第29-30页
第三章 半夏凝集素的同源建模第30-43页
   ·实验第31页
     ·实验材料与仪器第31页
     ·实验方法第31页
       ·获取半夏凝集素序列第31页
       ·将半夏凝集素序列提交 Swiss-model 进行同源建模第31页
       ·半夏凝集素同源模型的质量评估第31页
       ·半夏凝集素三维结构的一般性质第31页
   ·结果分析第31-41页
     ·半夏凝集素与模板蛋白的序列比对第31-32页
     ·半夏凝集素同源模型的构建结果第32-34页
     ·半夏凝集素同源模型的质量评估第34-39页
     ·半夏凝集素三维结构的基本性质第39-41页
       ·半夏凝集素同源模型三维结构的表面特性第39-40页
       ·半夏凝集素三维结构静电势表面第40页
       ·半夏凝集素三维结构的溶剂可及性表面第40-41页
       ·半夏凝集素亚基之间的相互结合作用第41页
   ·结论与讨论第41-43页
第四章 半夏凝集素的分子对接第43-58页
   ·实验第44-45页
     ·实验材料与仪器第44页
     ·实验方法第44-45页
       ·对接前的受体几何结构优化与能量优化第44-45页
       ·对接前的配体准备与受体准备第45页
       ·对接条件的设定第45页
       ·运行对接程序第45页
   ·结果分析第45-56页
     ·小分子糖配体的对接结果第45-51页
     ·大分子核酸、蛋白配体的对接结果第51-56页
   ·结论与讨论第56-58页
总结与展望第58-60页
参考文献第60-64页
硕士期间研究成果第64-65页
致谢第65页

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