| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 第一章 前言 | 第12-23页 |
| 1.1 青风藤的研究进展 | 第12-18页 |
| 1.1.1 青风藤植株的生物学特性 | 第12页 |
| 1.1.2 青风藤化学成分研究进展 | 第12-13页 |
| 1.1.3 青风藤药理作用研究进展 | 第13-16页 |
| 1.1.4 青风藤资源现状 | 第16-17页 |
| 1.1.5 青风藤资源利用 | 第17-18页 |
| 1.2 异喹啉类生物碱合成途径研究进展 | 第18-20页 |
| 1.2.1 异喹啉类生物碱 | 第18页 |
| 1.2.2 异喹啉类生物碱合成通路 | 第18-20页 |
| 1.3 高通量测序研究进展 | 第20-22页 |
| 1.3.1 高通量测序简介 | 第20页 |
| 1.3.2 转录组测序的介绍与原理 | 第20-21页 |
| 1.3.3 转录组测序在药用植物中的研究进展 | 第21-22页 |
| 1.4 本研究目的与意义 | 第22-23页 |
| 第二章 青风藤转录组池库的建立 | 第23-36页 |
| 2.1 材料 | 第23-24页 |
| 2.1.1 实验材料 | 第23-24页 |
| 2.1.2 实验试剂 | 第24页 |
| 2.1.3 实验仪器 | 第24页 |
| 2.2 方法 | 第24-27页 |
| 2.2.1 基因组DNA提取及检测 | 第24-25页 |
| 2.2.2 引物设计 | 第25页 |
| 2.2.3 PCR扩增及产物检测 | 第25-26页 |
| 2.2.4 序列比对校正及单倍型统计 | 第26页 |
| 2.2.5 建库测序流程 | 第26页 |
| 2.2.6 生物信息分析流程 | 第26-27页 |
| 2.3 结果与分析 | 第27-35页 |
| 2.3.1 基因组DNA电泳检测结果 | 第27-28页 |
| 2.3.2 单倍型结果 | 第28页 |
| 2.3.3 测序获得的数据 | 第28-29页 |
| 2.3.4 拼接转录本长度分布 | 第29-30页 |
| 2.3.5 基因功能注释情况 | 第30页 |
| 2.3.6 Nr注释结果分析 | 第30-31页 |
| 2.3.7 GO分类 | 第31-32页 |
| 2.3.8 KOG分类 | 第32-33页 |
| 2.3.9 KEGG分类 | 第33-34页 |
| 2.3.10 青藤碱合成相关KEGG注释情况 | 第34-35页 |
| 2.4 讨论与小结 | 第35-36页 |
| 第三章 青风藤内化学成分鉴定及青藤碱生物合成通路预测 | 第36-44页 |
| 3.1 材料 | 第36页 |
| 3.1.1 实验材料 | 第36页 |
| 3.1.2 实验试剂 | 第36页 |
| 3.1.3 实验仪器 | 第36页 |
| 3.2 方法 | 第36-37页 |
| 3.2.1 标准品制备 | 第36页 |
| 3.2.2 青风藤样品制备 | 第36-37页 |
| 3.2.3 色谱分析条件 | 第37页 |
| 3.2.4 质谱分析条件 | 第37页 |
| 3.2.5 数据分析 | 第37页 |
| 3.3 结果与分析 | 第37-40页 |
| 3.3.1 青风藤内生物碱分析结果 | 第37-39页 |
| 3.3.2 青风藤内几种重要的生物碱二级质谱分析 | 第39-40页 |
| 3.4 讨论与小结 | 第40-44页 |
| 第四章 青藤碱含量差异显著的两个青风藤材料转录组分析 | 第44-57页 |
| 4.1 材料 | 第44-45页 |
| 4.1.1 实验材料 | 第44页 |
| 4.1.2 实验试剂 | 第44页 |
| 4.1.3 实验仪器 | 第44-45页 |
| 4.2 方法 | 第45-47页 |
| 4.2.1 青藤碱含量测定 | 第45页 |
| 4.2.2 总RNA提取 | 第45-46页 |
| 4.2.3 转录组测序实验流程 | 第46页 |
| 4.2.4 生物信息分析流程 | 第46-47页 |
| 4.3 结果与分析 | 第47-55页 |
| 4.3.1 青风藤内青藤碱含量 | 第47-49页 |
| 4.3.2 测序获得的数据 | 第49-50页 |
| 4.3.3 拼接转录本长度分布 | 第50-51页 |
| 4.3.4 基因功能注释情况 | 第51页 |
| 4.3.5 差异表达水平分析 | 第51-52页 |
| 4.3.6 差异表达基因GO富集分析 | 第52-54页 |
| 4.3.7 差异表达基因KEGG富集分析 | 第54-55页 |
| 4.3.8 异喹啉类生物碱生物合成通路 | 第55页 |
| 4.4 讨论与小结 | 第55-57页 |
| 第五章 异喹啉生物碱生物合成途径相关基因的表达分析 | 第57-63页 |
| 5.1 材料 | 第57页 |
| 5.1.1 实验材料 | 第57页 |
| 5.1.2 试剂 | 第57页 |
| 5.1.3 仪器 | 第57页 |
| 5.2 方法 | 第57-60页 |
| 5.2.1 CDS预测 | 第57页 |
| 5.2.2 引物设计 | 第57-58页 |
| 5.2.3 总RNA提取 | 第58页 |
| 5.2.4 反转录 | 第58-59页 |
| 5.2.5 实时定量PCR | 第59-60页 |
| 5.3 结果与分析 | 第60-62页 |
| 5.4 讨论与小结 | 第62-63页 |
| 研究创新点 | 第63页 |
| 下一步研究计划 | 第63-64页 |
| 参考文献 | 第64-74页 |
| 附录1 | 第74-76页 |
| 附录2 | 第76-79页 |
| 致谢 | 第79-80页 |
| 作者简介 | 第80页 |
