| 摘要 | 第1-9页 |
| ABSTRACT | 第9-10页 |
| 1 前言 | 第10-19页 |
| ·冷应激研究进展 | 第10-14页 |
| ·应激与冷应激 | 第10页 |
| ·冷应激对神经内分泌系统的影响 | 第10-11页 |
| ·冷应激对生产性能的影响 | 第11-12页 |
| ·冷应激对生理免疫的影响 | 第12-13页 |
| ·冷应激相关基因 | 第13-14页 |
| ·高通量 RNA 测序技术 | 第14-15页 |
| ·高通量 RNA 测序技术简介 | 第14页 |
| ·高通量 RNA 测序技术的应用 | 第14-15页 |
| ·高通量 RNA 测序技术的前景 | 第15页 |
| ·生物信息学概述 | 第15-18页 |
| ·生物信息学产生背景 | 第15-16页 |
| ·生物信息学数据库 | 第16页 |
| ·序列比对 | 第16页 |
| ·基因芯片数据分析 | 第16-18页 |
| ·本研究的目的和意义 | 第18-19页 |
| 2 材料与方法 | 第19-26页 |
| ·实验材料 | 第19页 |
| ·主要仪器和试剂 | 第19-20页 |
| ·主要仪器设备 | 第19页 |
| ·主要试剂及配制 | 第19-20页 |
| ·实验方法 | 第20-21页 |
| ·实验动物的分群和处理 | 第20-21页 |
| ·猪肌肉组织 cDNA 文库构建、检测及 Illumina 测序 | 第21页 |
| ·测序数据分析 | 第21-22页 |
| ·原始数据处理及高质量标签序列的获取 | 第21页 |
| ·测序质量评估 | 第21页 |
| ·民猪肌肉组织基因表达注释及标准化 | 第21页 |
| ·民猪差异表达基因筛选 | 第21-22页 |
| ·反义链转录分析 | 第22页 |
| ·新转录本分析 | 第22页 |
| ·猪肌肉组织表达谱数据分析 | 第22-23页 |
| ·Gene Ontology 功能显著性富集分析 | 第22-23页 |
| ·Pathway 显著性富集分析 | 第23页 |
| ·抗寒相关基因的组织验证 | 第23-26页 |
| ·引物设计 | 第23-24页 |
| ·组织 RNA 提取及反转录 | 第24-25页 |
| ·相关基因的荧光定量检测 | 第25-26页 |
| 3 结果与分析 | 第26-56页 |
| ·测序质量评估 | 第26-37页 |
| ·测序饱和度分析 | 第26页 |
| ·高质量标签序列统计分析 | 第26-28页 |
| ·民猪肌肉组织基因表达注释及标准化 | 第28-29页 |
| ·民猪差异表达基因筛选 | 第29-35页 |
| ·反义链转录分析 | 第35页 |
| ·新转录本分析 | 第35-37页 |
| ·Gene Ontology 功能显著性富集分析 | 第37-40页 |
| ·差异基因所处细胞位置富集 | 第37-39页 |
| ·差异基因参与的分子功能的富集 | 第39页 |
| ·差异基因参与的分子过程的富集 | 第39-40页 |
| ·通路的显著性富集分析 | 第40-54页 |
| ·核糖体（Ribosome）信号通路 | 第40-44页 |
| ·脂肪酸代谢通路通路 | 第44-47页 |
| ·RNA 转运信号通路 | 第47-50页 |
| ·新陈代谢通路 | 第50-54页 |
| ·抗寒相关基因的组织验证 | 第54-56页 |
| ·组织 RNA 提取及鉴定 | 第54页 |
| ·抗寒相关基因的荧光定量检测 | 第54-56页 |
| 4 讨论 | 第56-59页 |
| ·猪基因表达量分布统计概况 | 第56页 |
| ·常温和低温处理基因表达的差异 | 第56-57页 |
| ·不同处理猪体内代谢途径分析 | 第57-59页 |
| 5 结论 | 第59-61页 |
| 参考文献 | 第61-65页 |
| 攻读硕士学位期间发表学术论文 | 第65页 |