| 中文摘要 | 第1-5页 |
| abstract | 第5-9页 |
| 第一章 文献综述 | 第9-17页 |
| ·猪F18大肠杆菌抗病育种进展 | 第9-10页 |
| ·miRNA | 第10-16页 |
| ·miRNA的形成 | 第11页 |
| ·miRNA合成调控过程 | 第11-12页 |
| ·miRNA的作用机制 | 第12-13页 |
| ·miRNA靶基因的预测分析 | 第13-14页 |
| ·靶基因验证 | 第14页 |
| ·miRNA与疾病发生的关系 | 第14-15页 |
| ·猪miRNA研究 | 第15-16页 |
| ·本试验的目的和意义 | 第16-17页 |
| 第二章 材料和方法 | 第17-29页 |
| ·主要试验仪器和材料 | 第17-18页 |
| ·实验试剂 | 第18-19页 |
| ·所需溶液的配制 | 第19-20页 |
| ·粘附试验相关试剂配制 | 第19-20页 |
| ·试验样本 | 第20页 |
| ·试验方法和步骤 | 第20-21页 |
| ·仔猪小肠上皮细胞分离 | 第20-21页 |
| ·粘附试验中使用大肠杆菌培养方法 | 第21页 |
| ·重组菌与仔猪小肠上皮细胞的体外黏附试验 | 第21页 |
| ·结果判定 | 第21页 |
| ·目标miRNA在E coli F18敏感组和抗性组间的荧光定量验证 | 第21-23页 |
| ·组织处理 | 第21-22页 |
| ·RNA浓度和纯度检测 | 第22页 |
| ·甲醛变性琼脂糖凝胶电泳的检测 | 第22页 |
| ·cDNA合成 | 第22-23页 |
| ·荧光定量PCR反应体系及反应条件 | 第23页 |
| ·数据处理与分析 | 第23页 |
| ·小RNA测序文库制备 | 第23-24页 |
| ·反转录及扩增(Reverse Transcribe and Amplify) | 第24-29页 |
| ·反转录 | 第25页 |
| ·PCR扩增 | 第25-26页 |
| ·cDNA 纯化 | 第26-27页 |
| ·测序结果数据分析 | 第27页 |
| ·大肠杆菌F18菌株敏感型和抵抗型对比组差异miRNA筛选结果分析 | 第27-28页 |
| ·图论：网络图(Network)的分析方法 | 第28页 |
| ·差异miRNA靶基因的预测 | 第28-29页 |
| 第三章 结果与分析 | 第29-49页 |
| ·粘附试验分析结果 | 第29-30页 |
| ·大肠杆菌F18菌株敏感型和抵抗型对比组Solexa测序直接结果 | 第30页 |
| ·大肠杆菌F18菌株敏感型和抵抗型对比组差异miRNA筛选结果 | 第30-34页 |
| ·差异miRNA前体与转录因子结合网络——TF-Gene-Network | 第34-35页 |
| ·Q-PCR结果 | 第35-36页 |
| ·差异miRNA靶基因与表达谱差异基因交集基因的功能分析 | 第36-42页 |
| ·交集基因Go ontology分析及网络构建(miR-GO-Network) | 第36-38页 |
| ·交集基因Pathway分析 | 第38-40页 |
| ·差异miRNA与显著性GO、显著性Pathway所属交集靶基因的分析及调控网络的构建 | 第40-42页 |
| ·候选差异miRNA的确定 | 第42页 |
| ·靶基因的分析结果 | 第42-49页 |
| 第四章 讨论 | 第49-53页 |
| 全文结论 | 第53-54页 |
| 参考文献 | 第54-57页 |
| 致谢 | 第57-58页 |
| 攻读学位期间发表和参与发表的学术论文目录 | 第58-59页 |
