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猪F-box基因家族部分基因的分子特征、SNP检测与性状关联分析暨FBXO40基因的功能初探

第一部分 猪F-box基因家族部分基因的分子特征、SNP检测与性状关联分析第1-75页
 中文摘要第9-11页
 ABSTRACT第11-13页
 1 文献综述第13-24页
   ·猪抗病育种研究进展第13-16页
     ·猪抗病育种研究现状第13-14页
     ·抗病力、免疫相关基因研究进展第14-16页
   ·泛素-蛋白酶体概况第16-18页
     ·泛素-蛋白酶体的组成第16-17页
     ·泛素-蛋白酶体途径的功能第17-18页
   ·E3泛素连接酶研究现状第18-20页
   ·F-box基因家族研究进展第20-23页
   ·E3泛素连接酶在猪抗病育种研究的前景第23-24页
 2 研究目的和意义第24-25页
 3 材料与方法第25-37页
   ·材料第25-29页
     ·DNA和RNA样品第25页
     ·载体第25-26页
     ·菌株第26页
     ·主要试剂第26-27页
     ·主要试剂的配置第27-28页
     ·主要仪器设备及来源第28页
     ·主要分子生物学软件和数据库第28-29页
   ·方法第29-37页
     ·基因组DNA的提取第29页
     ·总RNA提取、检测及DNase-Ⅰ处理第29-31页
     ·基因cDNA序列和基因组序列的分离第31-33页
     ·基因染色体定位第33页
     ·基因蛋白序列比对及进化树绘制第33-34页
     ·基因的表达谱分析第34页
     ·基因的多态检测(SNP)第34页
     ·基因多态与性状的关联分析第34-37页
 4 结果与分析第37-65页
   ·组织总RNA的甲醛变性胶电泳检测结果第37页
   ·猪FBXO5、FBXO7和FBXO40基因Contig的获得第37-38页
   ·猪FBXO5、FBXO7和FBXO40蛋白质序列比对及进化树绘制第38-44页
     ·猪FBXO5和FBXO7基因编码蛋白的序列推导第38-42页
     ·猪FBXO5、FBXO7和FBXO40蛋白序列比对和进化树绘制第42-44页
   ·猪FBXO5和FBXO7基因的基因组结构第44-45页
   ·猪FBXO5、FBXO7和FBXO40基因表达谱分析第45-52页
     ·猪FBXO5、FBXO7和FBXO40基因组织表达谱分析第45-49页
     ·猪FBXO5、FBXO7和FBXO40基因时间表达谱分析第49-50页
     ·猪FBXO5、FBXO7和FBXO40基因组织与细胞表达差异第50-52页
   ·猪FBXO40基因染色体定位第52页
   ·猪FBXO5、FBXO7和FBXO40基因SNP鉴定与遗传变异分析第52-65页
     ·猪FBXO5、FBXO7和FBXO40基因SNP鉴定第52-56页
     ·猪FBXO5、FBXO7和FBXO40基因多态性在不同猪群中的检测第56-59页
     ·基因多态与性状的关联分析第59-65页
 5 讨论第65-71页
   ·猪基因电子克隆策略第65页
   ·总RNA的提取与质量第65-66页
   ·猪FBXO5、FBXO7和FBXO40基因表达规律第66页
     ·关于组织表达谱第66页
   ·猪FBXO40基因染色体定位第66-67页
   ·猪FBXO5、FBXO7和FBXO40基因SNP检测第67-68页
   ·猪FBXO5、FBXO7和FBXO40等位基因频率分析及关联分析第68-71页
     ·猪FBXO5、FBXO7和FBXO40基因等位基因频率分析第68页
     ·猪FBXO5、FBXO7和FBXO40基因不同基因型与性状关联分析第68-71页
 6 小结第71-75页
   ·本研究主要结论第71-72页
   ·本研究的特色与创新之处第72页
   ·本研究的不足之处及由本研究所引出的问题第72-75页
第二部分 FBXO40基因的功能初探第75-104页
 中文摘要第75-76页
 ABSTRACT第76-77页
 1 文献综述第77-81页
   ·肌萎缩研究概况第77-78页
   ·去神经肌萎缩研究进展第78-80页
     ·骨骼肌去神经支配后细胞超微结构的改变第78-79页
     ·骨骼肌去神经支配后蛋白质的改变第79页
     ·骨骼肌去神经支配后酶的变化第79页
     ·骨骼肌去神经支配后运动终板的变化第79-80页
     ·去神经肌萎缩与细胞凋亡的关系第80页
   ·FBXO40基因研究进展第80-81页
 2 研究目的和意义第81-82页
 3 材料与方法第82-90页
   ·材料与试剂第82-84页
     ·主要试剂第82页
     ·载体第82-83页
     ·细胞系和菌株第83页
     ·主要试剂的配制第83-84页
     ·主要仪器设备及来源第84页
     ·主要分子生物学软件和数据库第84页
   ·方法第84-90页
     ·mFBXO40基因物理定位、结构与结构域信息第84-85页
     ·mFBXO40基因表达信息第85页
     ·mFBXO40基因蛋白质活性位点和亚细胞定位预测第85页
     ·mFBXO40基因进化分析第85页
     ·细胞总RNA的提取与cDNA的合成第85页
     ·mFBXO40基因荧光融合蛋白表达载体的构建第85-86页
     ·mFBXO40基因超表达载体和功能域缺失载体的构建第86-87页
     ·脂质体转染细胞第87-90页
 4 结果与分析第90-100页
   ·mFBXO40基因物理定位、结构与结构域信息整理结果第90页
   ·mFBXO40基因表达信息整理结果第90-92页
   ·mFBXO40蛋白质活性位点和亚细胞定位预测第92-95页
     ·mFBXO40蛋白质活性位点预测第92-93页
     ·mFBXO40蛋白质亚细胞定位预测第93-95页
   ·mFBXO40基因进化分析第95-96页
   ·mFBXO40基因重组质粒载体双酶切结果第96-98页
     ·mFBXO40基因荧光融合蛋白表达载体双酶切结果第96页
     ·mFBXO40基因超表达载体和功能域缺失载体双酶切结果第96-98页
   ·mFBXO40基因荧光融合蛋白表达载体亚细胞定位结果第98页
   ·mFBXO40基因超表达载体和功能域缺失载体转染结果第98-100页
     ·染后RT-PCR检测目的基因第98-100页
 5 讨论第100-102页
   ·关于载体构建第100页
   ·亚细胞定位结果分析第100页
   ·超表达结果分析第100-102页
 6 小结第102-104页
   ·本研究主要结论第102页
   ·本研究的特色与创新之处第102页
   ·本研究的不足之处及由本研究所引出的问题第102-104页
参考文献第104-113页
附表1 本研究中第一部分用到的引物第113-115页
附表2 本研究中第二部分所用到的引物第115-116页
附表3 缩略词表(Abbreviations)第116-118页
附表4 主要性状的中英文对照和缩写第118-120页
附图1 FBXO5氨基酸序列在不同物种间的比对结果第120-122页
附图2 FBXO7基因在不同物种问的氨基酸序列比对结果第122-125页
附图3 FBXO40基因F-box结构域在不同物种间序列比对结果第125-126页
在读期间发表论文题录第126-127页
致谢第127-128页

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