| 本论文的创新性研究工作 | 第1-7页 |
| 中文摘要 | 第7-9页 |
| ABSTRACT | 第9-12页 |
| 缩略词表 | 第12-13页 |
| 第一部分 文献综述及选题目的和意义 | 第13-25页 |
| 第一章 肠炎沙门氏菌及动物肠道微生物生态系统的研究进展 | 第13-25页 |
| 1 肠炎沙门氏菌的研究进展 | 第13-15页 |
| ·概述 | 第13页 |
| ·病原学 | 第13页 |
| ·流行病学 | 第13-14页 |
| ·诊断方法 | 第14页 |
| ·预防和控制 | 第14-15页 |
| 2 动物肠道微生物生态系统的研究进展 | 第15-22页 |
| ·肠道正常菌群 | 第15-16页 |
| ·肠道正常菌群的生理作用 | 第16-18页 |
| ·病原微生物感染对肠道正常菌群的影响 | 第18-21页 |
| ·病原微生物侵入肠道打破肠道正常的微生态平衡 | 第18页 |
| ·破坏肠道粘膜屏障 | 第18-19页 |
| ·肠道菌群的易位 | 第19-20页 |
| ·调节肠道菌群失衡的措施 | 第20-21页 |
| ·肠道微生态定量研究方法论 | 第21-22页 |
| 3 论文选题目的和意义 | 第22-25页 |
| 第二部分 实验研究 | 第25-56页 |
| 第二章 双重实时荧光定量PCR方法的建立及初步运用 | 第25-39页 |
| 1 材料 | 第25-26页 |
| ·实验动物 | 第25页 |
| ·菌株 | 第25页 |
| ·实验仪器及主要试剂 | 第25-26页 |
| ·实验试剂的配制 | 第26页 |
| 2 实验方法 | 第26-31页 |
| ·双重荧光定量PCR方法的设计 | 第26-28页 |
| ·双重荧光定量PCR方法的建立 | 第28-30页 |
| ·验证两菌引物的合理性和特异性 | 第28页 |
| ·标准品模板的制备 | 第28页 |
| ·标准品模板拷贝浓度的测定 | 第28页 |
| ·双重实时荧光定量PCR反应条件的优化 | 第28-29页 |
| ·双重实时荧光定量PCR标准曲线的制作 | 第29页 |
| ·双重实时荧光定量PCR检测细菌数的敏感性 | 第29页 |
| ·双重实时荧光定量PCR重复性试验 | 第29页 |
| ·双重实时荧光定量PCR特异性试验 | 第29页 |
| ·双重实时荧光定量PCR对鸭肠道内双歧杆菌和芽孢杆菌定量检测 | 第29-30页 |
| ·数据处理 | 第30-31页 |
| 3 结果 | 第31-36页 |
| ·验证双重实时荧光定量PCR引物的合理性和特异性 | 第31-32页 |
| ·常规PCR产物及测序结果 | 第31页 |
| ·SYBR Green I PCR做熔点曲线分析 | 第31-32页 |
| ·双重实时荧光定量PCR条件的优化 | 第32页 |
| ·双重实时荧光定量PCR标准曲线的制作 | 第32-33页 |
| ·双重实时荧光定量PCR敏感性测定结果 | 第33-34页 |
| ·双重实时荧光定量PCR重复性试验 | 第34页 |
| ·双重实时荧光定量PCR特异性试验 | 第34-35页 |
| ·双重实时荧光定量PCR对鸭肠道内双歧杆菌和芽孢杆菌定量检测结果 | 第35-36页 |
| 4 讨论 | 第36-38页 |
| 5 小结 | 第38-39页 |
| 第三章 人工感染肠炎沙门氏菌对鸭肠道菌6种细菌(双歧杆菌、芽胞杆菌、肠球菌、大肠杆菌、葡萄球菌、乳酸杆菌)数量的影响 | 第39-56页 |
| 1 材料 | 第39-40页 |
| ·实验动物 | 第39页 |
| ·菌株 | 第39页 |
| ·实验仪器及主要试剂 | 第39-40页 |
| ·实验试剂的配制 | 第40页 |
| 2 实验方法 | 第40-45页 |
| ·动物试验 | 第40-42页 |
| ·感染剂量设计 | 第40-41页 |
| ·实验鸭饲养管理 | 第41页 |
| ·动物分组和采样时间表 | 第41-42页 |
| ·采样设计 | 第42页 |
| ·样品处理及粪便中菌群总DNA的提取 | 第42-43页 |
| ·阳性模板的制备 | 第43-44页 |
| ·标准菌株的培养 | 第43-44页 |
| ·标准菌株基因组的提取 | 第44页 |
| ·样品的检测分析 | 第44-45页 |
| 3 结果 | 第45-51页 |
| ·鸭源SE(MY_1)检测死亡率结果 | 第45页 |
| ·口服组 | 第45页 |
| ·滴鼻组 | 第45页 |
| ·皮下组 | 第45页 |
| ·FQ-PCR对鸭肠道内双歧杆菌、芽孢杆菌、肠球菌、大肠杆菌、葡萄球菌和乳酸杆菌动力学的研究 | 第45-51页 |
| ·对照组鸭肠道内双歧杆菌、芽孢杆菌、肠球菌、大肠杆菌、葡萄球菌和乳酸杆菌数量变化规律 | 第45-46页 |
| ·人工感染鸭肠道内双歧杆菌、芽孢杆菌、肠球菌、大肠杆菌、葡萄球菌和乳酸杆菌数量变化规律 | 第46-51页 |
| 4 讨论 | 第51-55页 |
| ·实时荧光定量PCR技术在肠道微生物生态学中的应用及优点 | 第51-52页 |
| ·健康雏鸭肠道内六菌属的检测分析 | 第52页 |
| ·SE感染雏鸭后对其肠道内菌群的影响 | 第52-55页 |
| 5 小结 | 第55-56页 |
| ·健康雏鸭肠道内主要菌群变化 | 第55页 |
| ·SE感染后对鸭肠道内主要菌群的影响 | 第55-56页 |
| 第三部分 结论 | 第56-57页 |
| 第四部分 参考文献 | 第57-68页 |
| 附表 | 第68-81页 |
| 致谢 | 第81-82页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文目录 | 第82页 |
