| 摘要 | 第1-8页 |
| ABSTRACT | 第8-9页 |
| 1 文献综述 | 第9-23页 |
| ·水稻条纹病毒的研究进展 | 第9-10页 |
| ·水稻条纹病毒的基因组结构及功能 | 第9页 |
| ·RSV 与水稻互作的研究 | 第9-10页 |
| ·水稻矮缩病毒的研究进展 | 第10-12页 |
| ·RDV 的基因组结构及功能 | 第10-11页 |
| ·RDV 与水稻互作的研究 | 第11-12页 |
| ·基因芯片在水稻功能基因组研究中的应用 | 第12-23页 |
| ·基因芯片概述 | 第12-13页 |
| ·基因芯片在水稻功能基因组研究中的应用 | 第13-17页 |
| ·可利用的植物基因表达谱数据库 | 第17-19页 |
| ·生物信息学概述 | 第19-23页 |
| 2. 材料与方法 | 第23-39页 |
| ·供试材料 | 第23-24页 |
| ·水稻品种 | 第23页 |
| ·电脑设备 | 第23页 |
| ·基因芯片 | 第23页 |
| ·编程语言 | 第23页 |
| ·使用软件与网站 | 第23-24页 |
| ·实验方法 | 第24-39页 |
| ·芯片数据导入EXCEL 表格 | 第24-25页 |
| ·pathway 的数据格式化 | 第25-28页 |
| ·统计pathway 的数据中参与基因所在的染色体 | 第28-30页 |
| ·比较芯片数据中上调下调值相同的基因参与了哪些pathway | 第30-32页 |
| ·比较芯片数据中上调下调值相异的基因参与了哪些pathway | 第32-35页 |
| ·利用NCBI 分析基因 | 第35页 |
| ·BLAST | 第35-39页 |
| 3. 结果与分析 | 第39-56页 |
| ·由所得基因芯片统计基因上调下调值变化结果 | 第39-42页 |
| ·RDV 与RSV 中有着相同变化的上调下调值的基因统计 | 第39页 |
| ·编程以利于分析和对所得数据进一步分析结果 | 第39-42页 |
| ·全部PATHWAY 的统计结果 | 第42-56页 |
| ·整体pathway 的表现 | 第42-43页 |
| ·多条异常pathway 的详细信息结果 | 第43-49页 |
| ·本实验室相关研究涉及基因的分析结果 | 第49-56页 |
| 4. 讨论 | 第56-64页 |
| ·赤霉素(GIBBERELLIN，GA) | 第56-63页 |
| ·赤霉素合成代谢途径分析 | 第56-59页 |
| ·DELLA 蛋白 | 第59-61页 |
| ·SRL1 蛋白 | 第61-62页 |
| ·赤霉素代谢合成路径 | 第62-63页 |
| ·生物信息学的应用 | 第63-64页 |
| ·计算机编程在生物信息学中的应用 | 第63页 |
| ·生物信息学分析的若干问题 | 第63-64页 |
| 5. 展望 | 第64-65页 |
| 参考文献 | 第65-71页 |
| 附录 | 第71-80页 |
