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葡萄类病毒基因多样性分析及其侵染性克隆的构建

Abberviation第1-6页
Abstract第6-8页
摘要第8-13页
1. Introduction第13-34页
   ·Classification, structure and replication of viroids第13-17页
     ·Classification第13-15页
     ·Structure第15-16页
     ·Replication第16-17页
   ·Spreading and control第17-18页
     ·Spreading第17页
     ·Control第17-18页
   ·Detection of viroids第18-22页
     ·Biological indexing第18页
     ·Polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE)第18-20页
     ·Molecular hybridization第20-21页
     ·RT-PCR第21页
     ·Single–strand conformation polymorphism (SSCP)第21-22页
   ·Current status of grapevine viroids第22-32页
     ·Grapevine yellow speckle disease第22-27页
     ·Australian grapevine viroid (AGVd)第27-29页
     ·Hop stunt viroid (HSVd)第29-30页
     ·Citrus exocortis viroid (CEVd)第30页
     ·Transmission and spread of grapevine viroids第30-32页
     ·Viroid infectivity第32页
   ·Purpose and significance of the present research第32-34页
2. Genetic diversity of grapevine viroids第34-56页
   ·Materials第34-35页
     ·Viroid sources第34页
     ·Vector and strain第34-35页
     ·Reagents第35页
     ·Instrument第35页
   ·Methods第35-44页
     ·Isolation and extraction of viroids第35-36页
     ·Preparation of RNA probe第36-38页
     ·Procedure of Dot-blot第38-39页
     ·Polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE)第39-40页
     ·RT-PCR第40-42页
     ·Extraction of PCR products第42页
     ·Ligation第42-43页
     ·Preparation for DH5αcompetent cells第43页
     ·Transformation第43页
     ·Screening of the positive clones第43页
     ·Sequencing and sequence analysis第43-44页
   ·Detection results第44-46页
     ·Results of Dot-blot hybridization第44-45页
     ·Results of RT-PCR第45-46页
   ·Results of cloning and sequence analysis第46-55页
     ·AGVd第46-49页
     ·GYSVd-2第49-52页
     ·GYSVd第52-55页
   ·Discussion for chapter 2第55-56页
3. Construction of infectious clones第56-60页
   ·Materials第56页
     ·Tested plasmid第56页
     ·Reagent and instrument第56页
   ·Schematic for the construction of infectious clones第56-57页
     ·AGVd第56页
     ·HSVd第56-57页
     ·AGVd + HSVd第57页
   ·Methods第57-58页
     ·Plasmid extraction第57页
     ·Restriction enzyme digestion第57页
     ·Reclaim of the restriction enzyme digestion products第57页
     ·Ligation第57-58页
     ·Transformation第58页
     ·Screening of the positive clones第58页
     ·Sequencing第58页
   ·Results第58-59页
     ·Results of colony PCR第58-59页
     ·Results of restriction enzyme digestion.第59页
     ·Results of sequencing第59页
   ·Discussion for chapter 3第59-60页
4. Discussion for the full paper第60-62页
   ·Genetic diversity of grapevine viroids第60-61页
   ·Construction of infectious clones第61页
   ·List of sequences deposited in GenBank第61-62页
References第62-67页
Appendix第67-68页
Acknowledgements第68-69页
Published papers第69页

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