Abberviation | 第1-6页 |
Abstract | 第6-8页 |
摘要 | 第8-13页 |
1. Introduction | 第13-34页 |
·Classification, structure and replication of viroids | 第13-17页 |
·Classification | 第13-15页 |
·Structure | 第15-16页 |
·Replication | 第16-17页 |
·Spreading and control | 第17-18页 |
·Spreading | 第17页 |
·Control | 第17-18页 |
·Detection of viroids | 第18-22页 |
·Biological indexing | 第18页 |
·Polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE) | 第18-20页 |
·Molecular hybridization | 第20-21页 |
·RT-PCR | 第21页 |
·Single–strand conformation polymorphism (SSCP) | 第21-22页 |
·Current status of grapevine viroids | 第22-32页 |
·Grapevine yellow speckle disease | 第22-27页 |
·Australian grapevine viroid (AGVd) | 第27-29页 |
·Hop stunt viroid (HSVd) | 第29-30页 |
·Citrus exocortis viroid (CEVd) | 第30页 |
·Transmission and spread of grapevine viroids | 第30-32页 |
·Viroid infectivity | 第32页 |
·Purpose and significance of the present research | 第32-34页 |
2. Genetic diversity of grapevine viroids | 第34-56页 |
·Materials | 第34-35页 |
·Viroid sources | 第34页 |
·Vector and strain | 第34-35页 |
·Reagents | 第35页 |
·Instrument | 第35页 |
·Methods | 第35-44页 |
·Isolation and extraction of viroids | 第35-36页 |
·Preparation of RNA probe | 第36-38页 |
·Procedure of Dot-blot | 第38-39页 |
·Polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE) | 第39-40页 |
·RT-PCR | 第40-42页 |
·Extraction of PCR products | 第42页 |
·Ligation | 第42-43页 |
·Preparation for DH5αcompetent cells | 第43页 |
·Transformation | 第43页 |
·Screening of the positive clones | 第43页 |
·Sequencing and sequence analysis | 第43-44页 |
·Detection results | 第44-46页 |
·Results of Dot-blot hybridization | 第44-45页 |
·Results of RT-PCR | 第45-46页 |
·Results of cloning and sequence analysis | 第46-55页 |
·AGVd | 第46-49页 |
·GYSVd-2 | 第49-52页 |
·GYSVd | 第52-55页 |
·Discussion for chapter 2 | 第55-56页 |
3. Construction of infectious clones | 第56-60页 |
·Materials | 第56页 |
·Tested plasmid | 第56页 |
·Reagent and instrument | 第56页 |
·Schematic for the construction of infectious clones | 第56-57页 |
·AGVd | 第56页 |
·HSVd | 第56-57页 |
·AGVd + HSVd | 第57页 |
·Methods | 第57-58页 |
·Plasmid extraction | 第57页 |
·Restriction enzyme digestion | 第57页 |
·Reclaim of the restriction enzyme digestion products | 第57页 |
·Ligation | 第57-58页 |
·Transformation | 第58页 |
·Screening of the positive clones | 第58页 |
·Sequencing | 第58页 |
·Results | 第58-59页 |
·Results of colony PCR | 第58-59页 |
·Results of restriction enzyme digestion. | 第59页 |
·Results of sequencing | 第59页 |
·Discussion for chapter 3 | 第59-60页 |
4. Discussion for the full paper | 第60-62页 |
·Genetic diversity of grapevine viroids | 第60-61页 |
·Construction of infectious clones | 第61页 |
·List of sequences deposited in GenBank | 第61-62页 |
References | 第62-67页 |
Appendix | 第67-68页 |
Acknowledgements | 第68-69页 |
Published papers | 第69页 |