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水稻染色质调控因子功能分析

缩略词表第1-8页
中文摘要第8-10页
Abstract第10-13页
1 文献综述第13-35页
   ·表观遗传学概述第13-14页
     ·表观遗传学定义第13页
     ·表观遗传学与经典遗传学第13-14页
   ·表观遗传调控分子机制第14-23页
     ·真核生物染色质的结构第14-15页
     ·DNA甲基化第15-16页
     ·组蛋白修饰第16-18页
     ·表观修饰信号的识别第18-21页
     ·其它机制第21-23页
   ·染色质变构因子第23-29页
   ·细胞周期调控第29-35页
     ·细胞周期调控的研究第29-31页
     ·植物的细胞周期调控的研究第31-33页
     ·表观遗传调控细胞周期第33-35页
2. 材料和方法第35-45页
   ·水稻材料第35页
   ·载体及构建第35-36页
   ·菌株第36页
   ·水稻SNF2基因序列的分析第36页
   ·遗传转化第36页
   ·RNA抽提、RT-PCR、定量PCR和Northern杂交第36-37页
   ·DNA的抽提以及突变体的基因型鉴定第37页
   ·组织切片第37页
   ·叶绿素的测定第37-38页
   ·组蛋白的抽提和western blot第38页
   ·水稻全基因组基因芯片分析第38-39页
   ·染色质免疫共沉淀第39-40页
   ·体外组蛋白结合实验第40页
   ·酵母双杂交第40页
   ·MMS处理第40-45页
3. 结果与分析第45-84页
   ·水稻CHD基因的序列分析与转基因材料的获得第45-53页
     ·水稻CHD基因的序列分析第45-49页
     ·遗传转化材料的获得第49-53页
   ·转基因材料分析与CHD1功能研究第53-73页
     ·CHD1的基因结构分析以及cDNA全长的分析第53页
     ·CHD1的表达模式第53-54页
     ·chd1突变体和CHD1 RNAi转基因植株出现相同的表型第54-57页
     ·chd1植株叶片和茎的细胞数目减少第57-59页
     ·chd1植株叶片上表面表皮毛增多且叶片的叶绿素含量下降第59-60页
     ·WEE1在chd1中的表达量上升第60-62页
     ·水稻WEE1和CHD1对DNA诱变剂MMS呈现相反的表达变化第62-64页
     ·chd1突变体中WEE1的上升表达仅在田间种植的叶片中发生第64-65页
     ·chd1较野生型对MMS更敏感第65-67页
     ·DNA损伤早期诱导的基因在chd1中的表达量没有变化第67-68页
     ·chd1植株全基因组芯片分析第68-71页
     ·western blot检测chd1植株各种组蛋白修饰的变化第71-73页
     ·CHD1的PHD结构域可以在体外与H3K27me3结合第73页
   ·水稻LHP1的功能分析第73-77页
     ·水稻LHP1基因的结构以及cDNA全长的获得第73-75页
     ·LHP1的表达谱分析第75页
     ·LHP1的chromoshadow结构域可以形成二聚体第75-76页
     ·LHP1 RNAi转基因植株没有表型第76-77页
   ·HDAC11的互作蛋白的筛选第77-84页
     ·酵母双杂交筛选HDAC11的互作蛋白第77-79页
     ·筛选出来的蛋白为水稻特异基因并在籼粳之间存在多态性第79-81页
     ·重新转化验证互作第81-82页
     ·HDAP蛋白的N端不参与与HDAC11的互作第82-83页
     ·HDAP与HDAC11的表达谱分析第83-84页
4. 讨论第84-89页
   ·CHD1在DNA损伤信号传导中的作用第84-86页
   ·水稻LHP1可能有别于拟南芥同源基因的功能第86页
   ·CHD1抑制基因的表达可能需要H3K27的三甲基化第86-87页
   ·CHD1可能在水稻发育中也具有重要作用第87-89页
参考文献第89-99页
附录Ⅰ 部分实验的操作流程第99-110页
附录Ⅱ 作者简历第110-112页
致谢第112-113页

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