竹稻杂交及比较基因组学研究
| 致谢 | 第1-8页 |
| 摘要 | 第8-10页 |
| Abstract | 第10-13页 |
| 目录 | 第13-15页 |
| 图表一览 | 第15-16页 |
| 缩略词表 | 第16-18页 |
| 第1章 文献综述 | 第18-38页 |
| ·禾本科及其水稻和竹类植物 | 第18-29页 |
| ·禾本科植物系统发育树 | 第18-24页 |
| ·水稻 | 第24-26页 |
| ·竹类植物 | 第26-28页 |
| ·竹稻远缘杂交在水稻育种利用研究 | 第28-29页 |
| ·禾本科作物比较基因组学研究 | 第29-36页 |
| ·比较基因组学 | 第29-31页 |
| ·禾本科作物比较基因组学 | 第31-36页 |
| ·本研究的目的和组织 | 第36-38页 |
| 第2章 竹稻田间杂交试验 | 第38-50页 |
| ·引言 | 第38-40页 |
| ·材料和方法 | 第40-43页 |
| ·实验材料 | 第40页 |
| ·竹类植物花粉活力测定 | 第40页 |
| ·田间杂交实验 | 第40-41页 |
| ·竹稻杂种胚抢救 | 第41页 |
| ·竹稻杂种验证 | 第41-43页 |
| ·结果与分析 | 第43-48页 |
| ·竹类植物开花生物学调查 | 第43-45页 |
| ·竹类植物花粉活力 | 第45页 |
| ·竹稻杂种的分子证据 | 第45-48页 |
| ·讨论 | 第48-50页 |
| 第3章 竹稻比较基因组学研究 | 第50-86页 |
| ·引言 | 第50-52页 |
| ·材料和方法 | 第52-65页 |
| ·实验材料 | 第52页 |
| ·流式细胞仪检测基因组大小 | 第52页 |
| ·基因组DNA提取及测序 | 第52-53页 |
| ·毛竹BAC克隆构建 | 第53-60页 |
| ·BAC克隆测序及拼接 | 第60-61页 |
| ·基因组调查序列(GSS)分析 | 第61页 |
| ·基因组BAC序列分析 | 第61-62页 |
| ·毛竹特异基因验证 | 第62-65页 |
| ·结果与分析 | 第65-83页 |
| ·毛竹基因组大小确定 | 第65-68页 |
| ·毛竹GSS序列分析 | 第68-71页 |
| ·毛竹BAC克隆及测序 | 第71-72页 |
| ·毛竹BAC序列基因注释 | 第72-73页 |
| ·毛竹BAC重复序列构成 | 第73-79页 |
| ·毛竹BAC序列共线性分析 | 第79-83页 |
| ·讨论 | 第83-86页 |
| ·基因组大小评估中参照的选择 | 第83-84页 |
| ·基因组考察序列测序量的确定 | 第84页 |
| ·水稻是研究竹类植物的理想参考基因组 | 第84-86页 |
| 第4章 利用水稻SSR标记研究毛竹居群遗传多态性 | 第86-94页 |
| ·引言 | 第86-88页 |
| ·材料和方法 | 第88-90页 |
| ·实验材料 | 第88页 |
| ·DNA的提取和检测 | 第88-89页 |
| ·SSR引物设计和选择 | 第89页 |
| ·PCR扩增及检测 | 第89-90页 |
| ·结果与分析 | 第90-92页 |
| ·毛竹SSR引物扩增结果 | 第90页 |
| ·水稻SSR引物在毛竹上成功扩增结果 | 第90-91页 |
| ·不同居群毛竹的遗传多态性 | 第91-92页 |
| ·讨论 | 第92-94页 |
| 参考文献 | 第94-101页 |
| 附录一 构建BAC文库试剂列表 | 第101-106页 |
| 附录二 变性PAGE检测方法 | 第106-107页 |
| 附录三 毛竹SSR引物序列信息列表 | 第107-110页 |
| 附录四 120对水稻SSR引物信息列表 | 第110-113页 |
| 博士期间已发表和在投稿文章 | 第113页 |