MDL算法用于时间梯度设计试验猪骨骼肌基因调控网络分析上的研究
| 中文摘要 | 第1-9页 |
| ABSTRACT | 第9-11页 |
| 缩略语表 | 第11-12页 |
| 一、文献综述 | 第12-27页 |
| 1 前言 | 第12页 |
| 2 基因芯片 | 第12-16页 |
| ·芯片原理 | 第12-13页 |
| ·芯片的合成 | 第13-14页 |
| ·基因芯片的应用 | 第14-15页 |
| ·早期基因测序 | 第14页 |
| ·基因突变和多态性检测 | 第14页 |
| ·发现新基因 | 第14-15页 |
| ·基因表达及网络调控的研究 | 第15页 |
| ·基因芯片的方向 | 第15-16页 |
| 3 芯片数据处理 | 第16-23页 |
| ·数据预处理 | 第16-18页 |
| ·芯片数据标准化 | 第17页 |
| ·芯片标准化软件 | 第17页 |
| ·芯片数据标准 | 第17-18页 |
| ·差异基因的筛选 | 第18-19页 |
| ·差异基因的概念 | 第18页 |
| ·筛选差异基因的方法 | 第18-19页 |
| ·基因注释 | 第19-20页 |
| ·基因注释的概念 | 第19页 |
| ·基因注释的方法 | 第19-20页 |
| ·基因表达网络的研究 | 第20-23页 |
| ·基因网络概述 | 第20-21页 |
| ·基因网络研究方法 | 第21-22页 |
| ·基因表达网络研究的现状 | 第22-23页 |
| 4 基因芯片在营养学领域的研究 | 第23-25页 |
| ·营养相关基因及相互作用 | 第23-24页 |
| ·营养素与肿瘤细胞表达方面的研究 | 第24页 |
| ·营养需要与基因多态性方面的研究 | 第24-25页 |
| ·基因组学方面的研究 | 第25页 |
| 5 研究目的及意义 | 第25-27页 |
| 二、预处理、差异基因筛选和注释 | 第27-39页 |
| 1 前言 | 第27页 |
| 2 材料与方法 | 第27-34页 |
| ·材料 | 第27-28页 |
| ·数据来源 | 第28页 |
| ·数据处理 | 第28-34页 |
| ·芯片数据标准化 | 第28-29页 |
| ·差异基因的筛选 | 第29-33页 |
| ·差异基因注释 | 第33-34页 |
| 3 结果与分析 | 第34-38页 |
| ·差异基因筛选 | 第34-35页 |
| ·基因注释 | 第35-37页 |
| ·序列注释 | 第35页 |
| ·功能注释 | 第35-37页 |
| ·小结 | 第37-38页 |
| 4 讨论 | 第38-39页 |
| 三、差异基因调控网络的构建 | 第39-60页 |
| 1 前言 | 第39-40页 |
| 2 材料与方法 | 第40-43页 |
| ·材料 | 第40页 |
| ·网络构建方法 | 第40-43页 |
| ·动态贝叶斯网络 | 第40-41页 |
| ·MDL算法网络 | 第41页 |
| ·Cytoscape 2.6平台的应用 | 第41-43页 |
| 3 结果与分析 | 第43-57页 |
| ·脂肪相关的调控网络 | 第43-51页 |
| ·动态贝叶斯网络 | 第43-44页 |
| ·MDL网络算法 | 第44-45页 |
| ·小结 | 第45-51页 |
| ·肌肉相关的调控网络 | 第51-56页 |
| ·动态贝叶斯网络 | 第51-52页 |
| ·MDL网络算法 | 第52页 |
| ·小结 | 第52-56页 |
| ·总结 | 第56-57页 |
| ·脂肪调控网络 | 第56页 |
| ·肌肉调控网络 | 第56-57页 |
| 4 讨论 | 第57-60页 |
| ·脂肪相关调控网络 | 第57-58页 |
| ·肌肉相关调控网络 | 第58-59页 |
| ·MDL算法网络 | 第59-60页 |
| 四、结语 | 第60-62页 |
| 1 研究结论 | 第60-61页 |
| 2 创新及不足 | 第61-62页 |
| 附录一 | 第62-64页 |
| 附录二 | 第64-65页 |
| 附录三 | 第65-85页 |
| 附录四 | 第85-88页 |
| 附录五 | 第88-90页 |
| 参考文献 | 第90-96页 |
| 致谢 | 第96页 |
