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逆境胁迫对突光假单胞菌SN15-2耐热性的影响及氧化胁迫适应后的差异表达蛋白分析

摘要第5-6页
Abstract第6-7页
第1章 前言第11-19页
    1.1 生防菌及荧光假单胞菌概述第11-12页
        1.1.1 生防菌简介第11页
        1.1.2 荧光假单胞菌简介第11页
        1.1.3 荧光假单胞菌的生物防治机理第11-12页
    1.2 逆环境刺激提高微生物对后续致死环境耐受性的研究进展第12-13页
    1.3 蛋白组学技术第13-16页
    1.4 Parallel Reaction Monitoring (PRM)技术第16页
    1.5 荧光定量PCR第16-17页
    1.6 研究目的和意义第17-18页
    1.7 研究内容第18-19页
        1.7.1 不同逆环境适应对荧光假单胞菌SN15-2生长及耐热性的影响第18页
        1.7.2 逆环境适应对荧光假单胞菌SN15-2生防能力的影响第18页
        1.7.3 荧光假单胞菌SN15-2差异蛋白组学分析第18-19页
第2章 不同逆环境适应对荧光假单胞菌SN15-2耐热性的影响第19-28页
    2.1 材料和方法第19-21页
        2.1.1 生防菌株第19页
        2.1.2 试剂第19页
        2.1.3 仪器第19-20页
        2.1.4 培养基第20页
        2.1.5 不同温度下荧光假单胞菌的生长情况第20页
        2.1.6 荧光假单胞菌SN15-2盐胁迫适应第20页
        2.1.7 荧光假单胞菌SN15-2氧化胁迫适应第20-21页
        2.1.8 荧光假单胞菌SN15-2酸胁迫适应第21页
        2.1.9 逆环境对荧光假单胞菌SN15-2生长的影响第21页
        2.1.10 逆环境适应后的耐热性检测第21页
    2.2 结果与分析第21-26页
        2.2.1 不同培养温度下荧光假单胞菌SN15-2的生长情况第21-22页
        2.2.2 盐胁迫对荧光假单胞菌SN15-2生长的影响第22-23页
        2.2.3 氧化胁迫适应对荧光假单胞菌SN15-2生长的影响第23页
        2.2.4 酸胁迫适应对荧光假单胞菌SN15-2生长的影响第23-24页
        2.2.5 盐胁迫适应对荧光假单胞菌SN15-2耐热性的影响第24-25页
        2.2.6 氧化胁迫适应对荧光假单胞菌SN15-2耐热性的影响第25页
        2.2.7 酸胁迫适应对荧光假单胞菌SN15-2耐热性的影响第25-26页
        2.2.8 比较不同逆环境适应对荧光假单胞菌SN15-2耐热性的影响第26页
    2.3 讨论第26-28页
第3章 氧化胁迫适应对荧光假单胞菌SN15-2生防能力的影响第28-40页
    3.1 材料和方法第28-32页
        3.1.1 菌株第28页
        3.1.2 试剂第28页
        3.1.3 仪器第28-29页
        3.1.4 培养基第29页
        3.1.5 氧化胁迫适应后荧光假单胞菌SN15-2产噬铁素能力测定第29页
        3.1.6 氧化胁迫适应后荧光假单胞菌SN15-2生物膜形成能力测定第29-30页
        3.1.7 氧化胁迫适应对荧光假单胞菌SN15-2抗生素相关基因的影响第30页
        3.1.8 氧化胁迫适应对荧光假单胞菌SN15-2抗生素2,4-DAPG产生的影响第30-31页
        3.1.9 对植物病原菌平板拮抗的测定第31-32页
    3.2 结果与分析第32-39页
        3.2.1 氧化胁迫适应后荧光假单胞菌SN15-2产噬铁素能力测定第32-34页
        3.2.2 氧化胁迫适应后荧光假单胞菌SN15-2生物膜形成能力测定第34页
        3.2.3 氧化胁迫适应对荧光假单胞菌SN15-2抗生素相关基因的影响第34-35页
        3.2.4 氧化胁迫适应对荧光假单胞菌SN15-2抗生素2,4-DAPG产生的影响第35-36页
        3.2.5 对植物病原菌平板拮抗作用的影响的测定第36-39页
    3.3 讨论第39-40页
第4章 氧化胁迫适应后荧光假单胞菌SN15-2差异表达蛋白的分析第40-61页
    4.1 材料第40-42页
        4.1.1 菌株第40页
        4.1.2 试剂与试剂盒第40-41页
        4.1.3 仪器第41-42页
        4.1.4 数据处理软件第42页
    4.2 方法第42-45页
        4.2.1 蛋白质提取第42页
        4.2.2 蛋白质酶解与tandem mass tag (TMT)标记第42页
        4.2.3 High pH Reversed-Phase肽段分级第42-43页
        4.2.4 LC-MS/MS数据采集第43页
        4.2.5 数据分析第43-44页
        4.2.6 生物信息学分析第44页
        4.2.7 Parallel reaction monitoring (PRM)分析验证TMT结果可靠性第44-45页
    4.3 结果与分析第45-57页
        4.3.1 肽段质量控制第45-47页
        4.3.2 鉴定蛋白质和肽段特性描述第47-50页
        4.3.3 差异表达蛋白质的筛选第50-51页
        4.3.4 差异表达蛋白质的聚类分析第51-53页
        4.3.5 差异表达蛋白质Gene Ontology (GO)功能富集分析第53-54页
        4.3.6 差异表达蛋白质KEGG通路富集分析第54-56页
        4.3.7 差异表达蛋白质相互作用网络分析第56页
        4.3.8 PRM验证第56-57页
    4.4 讨论第57-61页
第5章 结论与展望第61-63页
    5.1 结论第61-62页
    5.2 展望第62-63页
参考文献第63-72页
专利申请及论文发表第72-73页
致谢第73-74页
附录第74-80页

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