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基于局部特征表达和全局统计降维算法的蛋白质亚细胞定位研究

摘要第3-5页
Abstract第5-6页
第一章 绪论第10-16页
    1.1 研究背景及意义第10-13页
        1.1.1 蛋白质亚细胞定位简介第10-12页
        1.1.2 研究背景第12-13页
        1.1.3 研究意义第13页
    1.2 研究现状第13-14页
    1.3 本文研究内容及创新点第14-15页
    1.4 论文组织结构第15-16页
第二章 几种现存的全局特征表达与分类算法第16-22页
    2.1 经典的蛋白质特征描述方法第16-18页
        2.1.1 氨基酸组成方法第16页
        2.1.2 二肽组成第16页
        2.1.3 伪氨基酸组成第16-18页
        2.1.4 位置特异性分数矩阵描述方法第18页
    2.2 几种现存的全局蛋白质特征描述方法第18-19页
        2.2.1 PseAA和PSSM的融合特征描述方法第18页
        2.2.2 二肽组成与PSSM融合(DipCPSSM)特征描述方法第18-19页
        2.2.3 PsePSSM特征描述方法第19页
    2.3 分类算法第19-20页
    2.4 分类模型的检验和评价指标第20-21页
        2.4.1 模型检验第20页
        2.4.2 评价指标第20-21页
    2.5 本章小结第21-22页
第三章 基于PSSM分段的局部特征表达与LDA算法的蛋白质亚细胞定位第22-30页
    3.1 相关概念第22-23页
    3.2 基于PSSM分段分布的氨基酸组成特征表达第23页
    3.3 一种现存的局部特征表达方法-PSSM-S第23-24页
    3.4 降维算法与分类算法第24-25页
        3.4.1 线性判别分析第24-25页
        3.4.2 分类算法第25页
    3.5 实验结果及分析第25-29页
        3.5.1 实验数据及实验过程第25-26页
        3.5.2 PSSM-SAA与现存特征表达算法对比第26-29页
    3.6 本章小结第29-30页
第四章 全局统计降维算法对蛋白质数据的影响第30-36页
    4.1 降维算法第30-32页
        4.1.1 MDA第30-31页
        4.1.2 MMLDA第31-32页
    4.2 分类算法第32页
    4.3 实验结果与分析第32-34页
        4.3.1 实验数据及实验过程第32-33页
        4.3.2 实验结果分析第33-34页
    4.4 本章小结第34-36页
第五章 包含二级结构预测信息的局部特征表达预测蛋白质亚细胞位置第36-42页
    5.1 Chou-Fasman方法第36-38页
    5.2 基于Chou-Fasman方法预测二级结构信息的特征表达第38-39页
    5.3 分类算法第39页
    5.4 实验结果及分析第39-41页
        5.4.1 实验数据及实验过程第39-40页
        5.4.2 实验结果分析第40-41页
    5.5 本章小结第41-42页
第六章 总结与展望第42-44页
    6.1 全文工作总结第42页
    6.2 未来展望第42-44页
参考文献第44-48页
攻读硕士学位期间完成的科研成果第48-50页
致谢第50页

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