| 摘要 | 第8-9页 |
| ABSTRACT | 第9页 |
| 第一章 绪论 | 第10-25页 |
| 1.1 中华按蚊研究进展 | 第11-17页 |
| 1.1.1 中华按蚊简介 | 第11-12页 |
| 1.1.2 蚊虫嗅觉机制概述 | 第12-17页 |
| 1.2 转录组测序技术的发展 | 第17-22页 |
| 1.2.1 测序技术的发展 | 第17-18页 |
| 1.2.2 转录组测序 | 第18-20页 |
| 1.2.3 蚊虫转录组研究进展概述 | 第20-22页 |
| 1.3 本论文的意义和研究内容 | 第22-25页 |
| 第二章 实验平台的搭建及中华按蚊转录组数据初步分析 | 第25-39页 |
| 2.1 中华按蚊的大规模饲养 | 第25-30页 |
| 2.1.1 大规模饲养平台的搭建 | 第26-27页 |
| 2.1.2 中华按蚊的扩大培养 | 第27-29页 |
| 2.1.3 中华按蚊的产卵 | 第29-30页 |
| 2.2 中华按蚊雌蚊转录组测序 | 第30-33页 |
| 2.2.1 实验雌蚊的准备 | 第31页 |
| 2.2.2 吸血前、后对照组雌蚊的制备 | 第31-32页 |
| 2.2.3 吸血前、后转录本的制备 | 第32-33页 |
| 2.2.4 RNA的纯化 | 第33页 |
| 2.3 中华按蚊转录组测序数据的初步分析 | 第33-37页 |
| 2.3.1 基因表达水平分析 | 第33-35页 |
| 2.3.2 RNA-Seq样品相关性分析 | 第35页 |
| 2.3.3 差异基因表达变化分析 | 第35-37页 |
| 2.4 本章小结 | 第37-39页 |
| 第三章 中华按蚊触角转录组提取及初步数据处理 | 第39-57页 |
| 3.1 蚊虫触角总RNA的提取及检测 | 第39-42页 |
| 3.1.1 中华按蚊触角电镜测试 | 第39-40页 |
| 3.1.2 触角组织的截取与触角总RNA样本的制备 | 第40-42页 |
| 3.2 cDNA文库的构建 | 第42-43页 |
| 3.3 测序数据及质量控制 | 第43-50页 |
| 3.3.1 原始序列数据 | 第43-44页 |
| 3.3.2 测序错误率分布检查 | 第44-46页 |
| 3.3.3 A/T/G/C含量分布检查 | 第46-47页 |
| 3.3.4 测序数据过滤 | 第47-50页 |
| 3.3.5 测序数据质量情况汇总 | 第50页 |
| 3.4 参考序列比对分析 | 第50-54页 |
| 3.4.1 reads与参考基因组比对情况统计 | 第51-52页 |
| 3.4.2 reads在参考基因组不同区域的分布情况 | 第52-54页 |
| 3.5 新转录本的预测 | 第54-55页 |
| 3.5.1 新转录本的预测 | 第54页 |
| 3.5.2 基因结构的优化 | 第54-55页 |
| 3.6 本章小结 | 第55-57页 |
| 第四章 中华按蚊吸血前后转录组差异分析 | 第57-68页 |
| 4.1 基因表达水平分析 | 第57-60页 |
| 4.2 RNA-seq整体质量评估 | 第60-61页 |
| 4.3 嗅觉相关基因的差异表达分析 | 第61-67页 |
| 4.3.1 差异表达基因列表 | 第61-62页 |
| 4.3.2 差异基因表达变化情况 | 第62-67页 |
| 4.4 本章小结 | 第67-68页 |
| 结束语 | 第68-69页 |
| 致谢 | 第69-71页 |
| 参考文献 | 第71-75页 |
| 作者在学期间取得的学术成果 | 第75页 |
