| 摘要 | 第8-10页 |
| Abstract | 第10-12页 |
| 缩略语表Abbreviation | 第13-14页 |
| 1 前言 | 第14-35页 |
| 1.1 水稻黄单胞菌概述 | 第14-17页 |
| 1.1.1 白叶枯病是一种危害极大的水稻病害 | 第14-15页 |
| 1.1.2 水稻黄单胞菌概述 | 第15-17页 |
| 1.2 黄单胞菌的致病因子 | 第17-23页 |
| 1.2.1 三型分泌系统是重要的致病因子 | 第17-21页 |
| 1.2.2 多种致病因子共同影响黄单胞菌致病力 | 第21-23页 |
| 1.3 双组份信号传导系统调控黄单胞菌中的致病因子 | 第23-30页 |
| 1.3.1 双组份信号传导系统结构概述 | 第23-25页 |
| 1.3.2 双组份信号传导系统信号传递模式 | 第25-26页 |
| 1.3.3 黄单胞菌中的双组份信号传导系统 | 第26-30页 |
| 1.4 多种信号传导系统构成复杂的调控网络 | 第30-34页 |
| 1.4.1 群体感应系统控制致病因子的表达 | 第30-32页 |
| 1.4.2 第二信使环二鸟苷酸偶联多种调控系统 | 第32-34页 |
| 1.5 本研究的目的及意义 | 第34-35页 |
| 2 材料与方法 | 第35-74页 |
| 2.1 实验材料 | 第35-56页 |
| 2.1.1 菌株及质粒 | 第35-41页 |
| 2.1.2 引物 | 第41-52页 |
| 2.1.3 培养基及抗生素 | 第52-55页 |
| 2.1.4 仪器设备与试剂 | 第55-56页 |
| 2.2 实验方法 | 第56-74页 |
| 2.2.1 基本遗传操作 | 第56-58页 |
| 2.2.2 水稻黄单胞菌中无标记基因敲除 | 第58-59页 |
| 2.2.3 水稻黄单胞菌无标记插入目的DNA片段 | 第59-60页 |
| 2.2.4 水稻黄单胞菌对敏感水稻致病力测定 | 第60-61页 |
| 2.2.5 水稻黄单胞菌胞外多糖产量定性测定 | 第61页 |
| 2.2.6 水稻黄单胞菌群集运动测定 | 第61页 |
| 2.2.7 水稻黄单胞菌对活性氧及高渗透压耐受性测定 | 第61-62页 |
| 2.2.8 多基因操纵子中单基因回补策略 | 第62-63页 |
| 2.2.9 水稻黄单胞菌总蛋白抽提-蛋白质组样品准备 | 第63页 |
| 2.2.10 iTRAQ蛋白质组质谱分析 | 第63页 |
| 2.2.11 iTRAQ蛋白质组数据处理 | 第63-64页 |
| 2.2.12 水稻黄单胞菌总RNA抽提 | 第64-65页 |
| 2.2.13 水稻黄单胞菌cDNA第一链合成 | 第65-66页 |
| 2.2.14 SYBR Green I法定量PCR检测基因表达 | 第66-67页 |
| 2.2.15 蛋白异源表达纯化 | 第67-69页 |
| 2.2.16 蛋白质免疫印记(Western blot) | 第69-70页 |
| 2.2.17 细菌双杂交检测蛋白相互作用 | 第70-71页 |
| 2.2.18 水稻黄单胞菌环境适应性测定 | 第71-72页 |
| 2.2.19 凝胶阻滞迁移实验(EMSA) | 第72-73页 |
| 2.2.20 RNA测序数据分析 | 第73-74页 |
| 3 结果与分析 | 第74-122页 |
| 3.1 全基因组普查PXO99~A中的双组份信号传导系统 | 第74-81页 |
| 3.1.1 PX099A中双组份信号传导系统生物信息学分析 | 第74-76页 |
| 3.1.2 获得了PX099~A 39个组氨酸激酶基因缺失突变体 | 第76-78页 |
| 3.1.3 组氨酸激酶基因缺失对致病因子的影响 | 第78-80页 |
| 3.1.4 组氨酸激酶基因缺失对致病力的影响 | 第80-81页 |
| 3.2 StoS与SreKRS在水稻黄单胞菌中的功能研究 | 第81-101页 |
| 3.2.1 StoS与SreKRS生物信息学分析及验证 | 第81-83页 |
| 3.2.2 StoS与SreKRS对PXO99~A生长的调控 | 第83-84页 |
| 3.2.3 StoS与SreKRS正调控胞外多糖以及群集运动 | 第84-85页 |
| 3.2.4 StoS与SreKRS正调控抗逆性 | 第85-86页 |
| 3.2.5 StoS或者SreKRS的功能缺失不影响PXO99~A致病力 | 第86-87页 |
| 3.2.6 iTRAQ差异蛋白质组结果概述 | 第87-89页 |
| 3.2.7 StoS与SreKRS信号通路之间相互重叠 | 第89-91页 |
| 3.2.8 StoS与SreKRS对胞外多糖以及群集运动的调控通路 | 第91-94页 |
| 3.2.9 StoS与SreKRS正调控逆境耐受性相关蛋白表达 | 第94-95页 |
| 3.2.10 StoS与SreKRS通过HrpG-HrpX负调控Hrp以及T3SSe | 第95-97页 |
| 3.2.11 StoS与SreKRS转录后负调控HrpG | 第97-99页 |
| 3.2.12 StoS与SreKRS是PXO99~A适应环境所必需的 | 第99-101页 |
| 3.3 PhoB/PhoR对水稻黄单胞菌致病力调控机理研究 | 第101-122页 |
| 3.3.1 PhoB/PhoR信息学分析 | 第101-103页 |
| 3.3.2 PhoR正调控PXO99~A的致病力 | 第103页 |
| 3.3.3 phoB缺失对PXO99~A致病力没有影响 | 第103-104页 |
| 3.3.4 PhoB直接正调控phoBR的表达 | 第104-106页 |
| 3.3.5 PhoR负调控phoBR的表达 | 第106-107页 |
| 3.3.6 过量表达PhoB对PX099A生长不利 | 第107-109页 |
| 3.3.7 PhoB/PhoR调控的靶标基因 | 第109-114页 |
| 3.3.8 PhoB/PhoR调控水稻黄单胞菌磷饥饿应急 | 第114-117页 |
| 3.3.9 PhoB/PhoR调控tonB受体基因表达 | 第117-120页 |
| 3.3.10 PhoB/PhoR通过调控木糖利用影响生长 | 第120-122页 |
| 4 讨论与展望 | 第122-127页 |
| 4.1 黄单胞菌中Hrp以及T3SSe的调控机制探讨 | 第122-123页 |
| 4.2 phoR突变体生长变弱的原因 | 第123-124页 |
| 4.3 水稻黄单胞菌对磷酸盐匮乏的应对策略 | 第124-125页 |
| 4.4 本研究对黄单胞菌中信号传导机制理解的提升 | 第125-127页 |
| 参考文献 | 第127-139页 |
| 附录 | 第139-140页 |
| 致谢 | 第140-142页 |
