| 摘要 | 第1-12页 |
| ABSTRACT | 第12-14页 |
| 1 引言 | 第14-32页 |
| ·沉积物微生物多样性研究概述 | 第14-17页 |
| ·沉积物环境特征 | 第14-15页 |
| ·沉积物中微生物群落与环境因子间的相互作用 | 第15-16页 |
| ·沉积物微生物生态学研究进展 | 第16-17页 |
| ·沉积物中特定微生物群落分布的研究 | 第16页 |
| ·沉积物环境中微生物群落结构组成 | 第16-17页 |
| ·沉积物宏基因组研究 | 第17页 |
| ·细菌群落分析方法 | 第17-25页 |
| ·环境基因组165 rDNA 的PCR 扩增 | 第18-20页 |
| ·16S rDNA 文库 | 第20-23页 |
| ·T-RFLP | 第23-25页 |
| ·生物群落多样性的测度 | 第25-29页 |
| ·α多样性的测度 | 第25-27页 |
| ·物种丰富度 | 第26页 |
| ·物种相对多度模型 | 第26页 |
| ·物种多样性指数 | 第26-27页 |
| ·物种均匀度指数 | 第27页 |
| ·β多样性的测度 | 第27-29页 |
| ·二元属性数据测度法 | 第27-28页 |
| ·数量数据测度法 | 第28-29页 |
| ·生物群落梯度分析 | 第29-31页 |
| ·直接梯度分析 | 第30页 |
| ·间接梯度分析 | 第30页 |
| ·约束直接梯度分析 | 第30-31页 |
| ·典型变量分析 | 第31页 |
| ·典型相关分析 | 第31页 |
| ·冗余分析 | 第31页 |
| ·典型对应分析 | 第31页 |
| ·本文选题依据及研究意义 | 第31-32页 |
| 2 材料与方法 | 第32-42页 |
| ·生化试剂 | 第32-33页 |
| ·仪器设备 | 第33页 |
| ·样品的采集 | 第33-34页 |
| ·主要溶液的配制 | 第34页 |
| ·LB 培养基 | 第34页 |
| ·氨苄青霉素溶液 | 第34页 |
| ·X-Gal 贮液 | 第34页 |
| ·IPTG 贮液 | 第34页 |
| ·样品理化指标的测定 | 第34-35页 |
| ·PCR 引物 | 第35页 |
| ·样品总DNA 的提取及165 rDNA 的PCR 扩增 | 第35-36页 |
| ·样品总DNA 的提取 | 第35页 |
| ·16S rDNA 的PCR 扩增 | 第35-36页 |
| ·PCR 扩增的反应条件 | 第36页 |
| ·PCR 扩增产物的纯化 | 第36页 |
| ·T-RFLP 分析 | 第36页 |
| ·荧光PCR 产物的限制性酶切 | 第36页 |
| ·酶切产物的基因扫描 | 第36页 |
| ·16S rDNA 文库 | 第36-39页 |
| ·PCR 产物的连接 | 第36-37页 |
| ·E. coli DH5α感受态细胞的制备 | 第37页 |
| ·转化 | 第37-38页 |
| ·阳性克隆的筛选 | 第38页 |
| ·ARDRA 分型 | 第38-39页 |
| ·数据分析 | 第39-42页 |
| ·T-RFLP 分析 | 第39-40页 |
| ·细菌群落多样性分析 | 第39页 |
| ·去趋势对应分析 | 第39-40页 |
| ·典型对应分析 | 第40页 |
| ·16S rDNA 文库分析 | 第40-42页 |
| ·序列分析 | 第40-41页 |
| ·文库统计数据分析 | 第41-42页 |
| ·核苷酸序列登录号 | 第42页 |
| 3 结果与分析 | 第42-58页 |
| ·东平湖环境特征 | 第42-43页 |
| ·T-RFLP 分析 | 第43-49页 |
| ·样品的T-RFLP 图谱分析 | 第43页 |
| ·多样性指数分析 | 第43-45页 |
| ·T-RFLP 图谱中主要片段的定性分析 | 第45-46页 |
| ·基于T-RFLP 的主成分分析 | 第46-47页 |
| ·T-RFs 分布与沉积物环境因子之间的关系 | 第47-49页 |
| ·去趋势对应分析 | 第47页 |
| ·典型对应分析 | 第47-49页 |
| ·16S rDNA 克隆文库分析 | 第49-58页 |
| ·文库的构建 | 第49-51页 |
| ·阳性克隆子的验证 | 第49-50页 |
| ·16S rDNA 扩增片段的ARDRA 分型 | 第50-51页 |
| ·嵌合体检测及库容的估算 | 第51页 |
| ·基于16S rDNA 克隆文库的细菌多样性分析 | 第51-55页 |
| ·东平湖沉积物细菌群落结构分析 | 第51-53页 |
| ·基于16S rDNA 文库的细菌多样性指数分析 | 第53-54页 |
| ·文库间群落多样性分析 | 第54-55页 |
| ·东平湖沉积物细菌群落与环境因子之间的关系 | 第55-58页 |
| ·数据标准化及去趋势对应分析 | 第55-56页 |
| ·冗余分析 | 第56-58页 |
| 4 讨论 | 第58-61页 |
| ·东平湖沉积物环境特征 | 第58-59页 |
| ·微生物群落结构分析方法的比较 | 第59页 |
| ·东平湖沉积物细菌多样性分析 | 第59-61页 |
| ·变形杆菌类群 | 第59-60页 |
| ·其它类群 | 第60-61页 |
| 5 结论 | 第61-63页 |
| ·分子生物学方法的比较 | 第61页 |
| ·东平湖沉积物细菌群落结构 | 第61页 |
| ·沉积物环境因子对细菌群落结构的影响 | 第61-63页 |
| 参考文献 | 第63-76页 |
| 致谢 | 第76-77页 |
| 在读期间发表论文 | 第77页 |