| 摘要 | 第1-11页 |
| Abstract | 第11-13页 |
| 1 前言 | 第13-29页 |
| ·东平湖概况 | 第13-15页 |
| ·东平湖地理位置 | 第13-14页 |
| ·东平湖水文概况 | 第14-15页 |
| ·湖泊微生物多样性研究进展 | 第15-19页 |
| ·微生物多样性涵义 | 第15页 |
| ·湖泊微生物多样性 | 第15-19页 |
| ·微生物多样性研究方法 | 第19-27页 |
| ·传统方法 | 第19页 |
| ·分子生物学方法 | 第19-20页 |
| ·环境样品基因组DNA 的提取与纯化 | 第20-21页 |
| ·16S rRNA 的结构及性质 | 第21-22页 |
| ·聚合酶链式反应（PCR） | 第22页 |
| ·基于PCR 技术的研究方法 | 第22-27页 |
| ·选题依据 | 第27-29页 |
| 2 材料与方法 | 第29-44页 |
| ·实验材料 | 第29-30页 |
| ·采样位点 | 第29-30页 |
| ·采样时间 | 第30页 |
| ·样品编号 | 第30页 |
| ·试剂﹑仪器设备 | 第30-34页 |
| ·主要仪器设备 | 第30-31页 |
| ·生化试剂 | 第31-32页 |
| ·PCR 引物 | 第32-33页 |
| ·分析软件 | 第33-34页 |
| ·实验方法 | 第34-44页 |
| ·样品采集 | 第34页 |
| ·湖水理化性质分析 | 第34页 |
| ·吖啶橙染色直接计数法(AODC)分析 | 第34-35页 |
| ·湖水样品DNA 的提取与纯化 | 第35-36页 |
| ·提取基因组总DNA | 第35页 |
| ·琼脂糖凝胶电泳 | 第35页 |
| ·DNA 浓度的确定 | 第35-36页 |
| ·T-FFLP 分析 | 第36-38页 |
| ·用于T-FFLP 的PCR 扩增 | 第36页 |
| ·PCR 产物的纯化 | 第36-37页 |
| ·PCR 产物的限制性内切酶酶切 | 第37页 |
| ·酶切产物的基因扫描 | 第37页 |
| ·T-RFLP 分析方法 | 第37-38页 |
| ·16S rRNA 基因文库的构建与分析 | 第38-41页 |
| ·用于16S rRNA 基因文库构建的PCR 扩增 | 第38页 |
| ·PCR 产物的纯化 | 第38页 |
| ·感受态细胞Escherichia coli DH5α的制备（CaCl2 法） | 第38-39页 |
| ·16S rRNA 基因文库的构建 | 第39页 |
| ·菌液PCR 检测阳性克隆 | 第39页 |
| ·16S rRNA 基因文库的RFLP 分析 | 第39-40页 |
| ·DNA 测序 | 第40页 |
| ·系统发育分析 | 第40页 |
| ·克隆文库多样性分析方法 | 第40-41页 |
| ·DGGE 分析 | 第41-44页 |
| ·用于DGGE 的PCR 扩增 | 第41-42页 |
| ·PCR 产物的纯化 | 第42页 |
| ·DGGE 电泳 | 第42页 |
| ·Quantity One 软件包分析 | 第42-44页 |
| 3 结果与分析 | 第44-68页 |
| ·湖水理化性质 | 第44-45页 |
| ·AODC | 第45-47页 |
| ·湖水微生物总DNA 提取 | 第47页 |
| ·T-RFLP 分析 | 第47-50页 |
| ·用于T-RFLP 的PCR 扩增 | 第47-48页 |
| ·T-RFLP 图谱 | 第48-49页 |
| ·样品的多样性比较 | 第49-50页 |
| ·16S rRNA 基因文库的构建 | 第50-62页 |
| ·用于16S rRNA 基因文库构建的PCR 扩增 | 第50页 |
| ·细菌16S rRNA 克隆文库构建 | 第50-51页 |
| ·细菌16S rRNA 扩增片段的限制性酶切分析 | 第51-52页 |
| ·测序结果分析 | 第52-55页 |
| ·浮游细菌群落的丰度和物种均度 | 第55页 |
| ·系统发育分析 | 第55-62页 |
| ·DGGE | 第62-65页 |
| ·DGGE 图谱分析 | 第62-63页 |
| ·Quantity One 软件分析 | 第63-65页 |
| ·相关性分析 | 第65-68页 |
| 4 讨论 | 第68-73页 |
| ·微生物多样性时间性差异 | 第69页 |
| ·微生物多样性空间性差异 | 第69页 |
| ·各类微生物的分析 | 第69-71页 |
| ·分子生物学方法之间的比较 | 第71页 |
| ·几点建议 | 第71-73页 |
| 参考文献 | 第73-85页 |
| 附录 | 第85-99页 |
| 致谢 | 第99-100页 |
| 攻读学位期间发表论文情况 | 第100页 |
