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稀有变异揭示TCP基因调控黄瓜卷须发育

摘要第6-7页
Abstract第7-8页
第一章 引言第13-26页
    1.1 寻找目标基因的方法第13-20页
        1.1.1 图位克隆第13-14页
        1.1.2 转座子标签第14-15页
        1.1.3 抑制消减杂交技术第15页
        1.1.4 同源序列第15页
        1.1.5 高通量基因组测序第15-20页
    1.2 TCP转录因子家族的研究第20-24页
        1.2.1 TCP基因家族的发现第20-22页
        1.2.2 TCP基因家族的进化第22-23页
        1.2.3 TCP转录因子的生物学功能第23-24页
    1.3 植物卷须发育的研究第24页
    1.4 本研究的目的和意义第24-26页
        1.4.1 目的与意义第25页
        1.4.2 课题技术路线第25-26页
第二章 利用稀有变异克隆黄瓜卷须身份基因第26-42页
    2.1 前言第26页
    2.2 材料与方法第26-29页
        2.2.1 黄瓜稀有变异的鉴定第26-27页
        2.2.2 实验材料和种植条件第27页
        2.2.3 黄瓜DNA的提取第27页
        2.2.4 黄瓜RNA的提取第27-28页
        2.2.5 实时荧光定量PCR分析第28页
        2.2.6 CsTEN基因的图位克隆第28页
        2.2.7 利用精细定位区间内的SNP构建进化树第28页
        2.2.8 dCAPS标记分析第28-29页
        2.2.9 扫描电镜观察第29页
    2.3 结果与分析第29-42页
        2.3.1 黄瓜核心种质的稀有单核苷酸多态性分析第29-33页
        2.3.2 黄瓜变态卷须表型鉴定与遗传分析第33-36页
        2.3.3 利用稀有变异寻找CsTEN的候选基因第36-37页
        2.3.4 卷须身份基因CsTEN的克隆和导致表型发生的SNP的确定第37-42页
第三章 黄瓜卷须身份基因CsTEN的功能分析第42-60页
    3.1 前言第42页
    3.2 材料与方法第42-48页
        3.2.1 进化树构建第42页
        3.2.2 通过RACE技术获得CsTEN基因序列全长第42页
        3.2.3 葫芦科其他瓜类作物的TEN基因列序的获得第42页
        3.2.4 农杆菌热击感受态的制备及转化第42-43页
        3.2.5 农杆菌电击感受态的制备及转化第43页
        3.2.6 在本氏烟草叶片中进行瞬时表达检测第43-44页
        3.2.7 酵母激活实验第44页
        3.2.8 原位杂交实验第44-48页
    3.3 结果与分析第48-60页
        3.3.1 进化树分析CsTEN属于TCP转录因子家族第48-49页
        3.3.2 CsTEN基因的结构分析第49-52页
        3.3.3 CsTEN存在两个转录本第52-54页
        3.3.4 CsTEN具有细胞核定位能力第54页
        3.3.5 稀有SNP显著降低CsTEN的转录激活能力第54-56页
        3.3.6 正常卷须和变态卷须不同发育时期中CsTEN的时空表达第56-57页
        3.3.7 喷瓜的TEN基因分析第57-60页
第四章 CsTEN的下游基因参与黄瓜卷须的发育和运动第60-71页
    4.1 前言第60页
    4.2 材料与方法第60-61页
        4.2.1 转录组测序和GO通路富集分析第60页
        4.2.2 γ-氨基丁酸和乙酰胆碱体外处理黄瓜卷须第60-61页
    4.3 结果与分析第61-71页
        4.3.1 正常卷须和变态卷须的近等基因系的构建第61-62页
        4.3.2 正常卷须和变态卷须的转录组分析第62-64页
        4.3.3 CsTEN参与抑制CsYABBY1的表达第64-65页
        4.3.4 拟南芥中CYC/TB1亚类的TCP抑制YABBY基因表达第65-66页
        4.3.5 CsTEN抑制侧翼器官的极性发育第66-67页
        4.3.6 黄瓜卷须运动相关基因第67-71页
第五章 全文结论第71-72页
参考文献第72-82页
附录第82-98页
致谢第98-99页
作者简介第99页
研究生期间发表论文第99-100页

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