| 中文摘要 | 第7-9页 |
| Abstract | 第9-10页 |
| 一 文献综述 | 第11-27页 |
| 1.1 miRNA介绍 | 第11-15页 |
| 1.1.1 miRNA的发现 | 第11-12页 |
| 1.1.2 miRNA的形成过程 | 第12-14页 |
| 1.1.3 miRNA的特点 | 第14页 |
| 1.1.4 miRNA的研究方法 | 第14-15页 |
| 1.2 植物中miRNA的研究进展 | 第15-25页 |
| 1.2.1 拟南芥中的miRNA | 第16-18页 |
| 1.2.2 水稻中miRNA的研究进展 | 第18-19页 |
| 1.2.3 玉米中miRNA的研究进展 | 第19-20页 |
| 1.2.4 小麦中的miRNA | 第20-21页 |
| 1.2.5 高粱中miRNA的研究进展 | 第21-22页 |
| 1.2.6 甘蔗中miRNA的研究进展 | 第22-25页 |
| 1.3 本研究的目的与意义 | 第25-27页 |
| 二 甘蔗高贵种miRNA的鉴定与分析 | 第27-48页 |
| 2.1 前言 | 第27页 |
| 2.2 材料与试剂 | 第27-28页 |
| 2.2.1 材料 | 第27页 |
| 2.2.2 试剂与仪器 | 第27-28页 |
| 2.3 方法 | 第28-31页 |
| 2.3.1 甘蔗组织RNA的提取及质量检测 | 第28-29页 |
| 2.3.2 甘蔗小RNA文库的构建及测序 | 第29页 |
| 2.3.3 生物信息学分析 | 第29页 |
| 2.3.4 miRNA的stem-loop RT-PCR验证 | 第29-31页 |
| 2.4 结果与分析 | 第31-47页 |
| 2.4.1 测序结果质量分析 | 第31页 |
| 2.4.2 候选miRNA的预测 | 第31-32页 |
| 2.4.3 同源miRNA和未知miRNA的鉴定 | 第32-33页 |
| 2.4.4 靶基因预测与GO富集分析 | 第33-43页 |
| 2.4.5 miRNA的实验验证和miRNA与靶基因的相关性分析 | 第43-47页 |
| 2.5 讨论 | 第47-48页 |
| 三 甘蔗原始种与栽培种的miRNA研究 | 第48-80页 |
| 3.1 前言 | 第48页 |
| 3.2 材料与方法 | 第48-54页 |
| 3.2.1 植物材料 | 第48-49页 |
| 3.2.2 试剂与仪器 | 第49页 |
| 3.2.3 方法 | 第49-54页 |
| 3.3 生物信息学分析 | 第54-55页 |
| 3.4 结果与分析 | 第55-78页 |
| 3.4.1 原始数据处理 | 第55-57页 |
| 3.4.2 生物信息学预测到的所有候选miRNA | 第57页 |
| 3.4.3 甘蔗同源miRNA的鉴定及聚类分析 | 第57-65页 |
| 3.4.4 甘蔗中新的miRNA的鉴定与表达分析 | 第65-75页 |
| 3.4.5 靶基因的预测及靶基因的GO富集分析 | 第75-76页 |
| 3.4.6 miRNA与靶基因的相关性分析 | 第76-78页 |
| 3.5 讨论 | 第78-80页 |
| 四 结论 | 第80-82页 |
| 4.1 甘蔗高贵种中miRNA的鉴定与分析 | 第80页 |
| 4.2 甘蔗不同品种中miRNA的比较分析 | 第80-82页 |
| 参考文献 | 第82-87页 |
| 附录 | 第87-93页 |
| 致谢 | 第93页 |