| 摘要 | 第6-9页 |
| ABSTRACT | 第9-12页 |
| 中英文对照及缩略词表 | 第19-20页 |
| 第1章 绪论 | 第20-44页 |
| 1.1 抗生素种类、作用机制和应用 | 第20-25页 |
| 1.2 抗生素使用现状与环境影响 | 第25-28页 |
| 1.2.1 我国抗生素使用现状 | 第25-26页 |
| 1.2.2 环境中的抗生素残留 | 第26页 |
| 1.2.3 抗生素的环境影响 | 第26-28页 |
| 1.3 耐药基因的产生、作用机制和研究方法 | 第28-37页 |
| 1.3.1 耐药基因作用机制 | 第28-33页 |
| 1.3.2 耐药基因的产生与水平转移 | 第33-35页 |
| 1.3.3 基于传统培养法的耐药基因研究方法 | 第35-36页 |
| 1.3.4 基于非传统培养方法的耐药基因研究方法 | 第36-37页 |
| 1.4 农田土壤中耐药基因的传播与扩散 | 第37-42页 |
| 1.4.1 畜禽养殖业中耐药基因的污染与扩散 | 第37-39页 |
| 1.4.2 畜禽粪肥的施用对土壤耐药基因的污染 | 第39-42页 |
| 1.5 研究意义、思路和内容 | 第42-44页 |
| 第2章 研究方法 | 第44-52页 |
| 2.1 土壤培养实验方案 | 第44-45页 |
| 2.1.1 供试材料 | 第44页 |
| 2.1.2 实验方案 | 第44-45页 |
| 2.2 土壤添加实验方案 | 第45-46页 |
| 2.2.1 供试材料 | 第45页 |
| 2.2.2 实验方案 | 第45-46页 |
| 2.3 生物分析方法 | 第46-50页 |
| 2.3.1 仪器与试剂 | 第46-47页 |
| 2.3.2 DNA提取及质量检测 | 第47页 |
| 2.3.3 耐药基因荧光定量PCR检测（SYBR? Green I染料法） | 第47-50页 |
| 2.4 化学分析方法 | 第50-51页 |
| 2.5 数据处理 | 第51-52页 |
| 第3章 长期施用粪肥土壤中耐药基因归趋分析 | 第52-68页 |
| 3.1 耐药基因检测结果分析 | 第52-63页 |
| 3.1.1 16S rRNA基因、耐药基因、可移动遗传元件绝对丰度分析 | 第52-58页 |
| 3.1.2 长期施用粪肥土壤培养组中移动元件、总耐药基因降解拟合 | 第58-60页 |
| 3.1.3 移动元件、总耐药基因相对丰度相关性分析 | 第60-62页 |
| 3.1.4 样品主成分分析 | 第62-63页 |
| 3.1.5 总耐药基因相对丰度降解拟合 | 第63页 |
| 3.2 讨论 | 第63-66页 |
| 3.2.1 长期施用粪肥对土壤中耐药基因水平的影响 | 第63-64页 |
| 3.2.2 添加生物质碳及控制含水率对耐药基因及可移动遗传元件消减过程的影响 | 第64-65页 |
| 3.2.3 可移动遗传元件与耐药基因之间的正相关关系 | 第65-66页 |
| 3.3 小结 | 第66-68页 |
| 第4章 长期施用粪肥土壤中抗生素归趋分析 | 第68-76页 |
| 4.1 土壤培养实验中抗生素检测结果分析 | 第68-73页 |
| 4.1.1 土壤培养实验中抗生素检出的种类与动态变化 | 第68-70页 |
| 4.1.2 M+组抗生素环境行为相关性分析 | 第70-72页 |
| 4.1.3 土壤培养实验抗生素主成分分析 | 第72-73页 |
| 4.2 讨论 | 第73-74页 |
| 4.2.1 抗生素残留对土壤微生物的影响 | 第73页 |
| 4.2.2 生物质碳对抗生素环境行为的影响 | 第73-74页 |
| 4.2.3 部分抗生素在土壤中的环境行为 | 第74页 |
| 4.3 小结 | 第74-76页 |
| 第5章 粪肥添加的土壤中耐药基因归趋分析 | 第76-102页 |
| 5.1 实验结果分析 | 第76-99页 |
| 5.1.1 土壤添加实验耐药基因绝对丰度分析 | 第76-86页 |
| 5.1.2 粪肥添加实验土壤中耐药基因、可移动遗传元件相对丰度变化分析 | 第86-88页 |
| 5.1.3 可移动遗传元件、耐药基因相对丰度相关性分析 | 第88-96页 |
| 5.1.4 土壤添加实验耐药基因与可移动遗传元件降解拟合 | 第96-97页 |
| 5.1.5 土壤样品主成分分析 | 第97-99页 |
| 5.2 讨论 | 第99-100页 |
| 5.2.1 土壤添加实验中耐药基因的水平转移机制 | 第99页 |
| 5.2.2 堆肥作用对耐药基因的去除 | 第99-100页 |
| 5.3 小结 | 第100-102页 |
| 第6章 全文结论、创新之处和研究展望 | 第102-104页 |
| 6.1 全文结论 | 第102-103页 |
| 6.2 创新之处 | 第103页 |
| 6.3 研究展望 | 第103-104页 |
| 参考文献 | 第104-116页 |
| 致谢 | 第116-118页 |
| 作者简历及攻读学位期间发表的学术论文与研究成果 | 第118页 |
