| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-8页 |
| 主要符号表 | 第23-25页 |
| 引言 | 第25-26页 |
| 1 文献综述 | 第26-65页 |
| 1.1 燃料乙醇 | 第26-36页 |
| 1.1.1 燃料乙醇产业现状 | 第26-28页 |
| 1.1.2 燃料乙醇发展历程 | 第28-36页 |
| 1.2 菊芋乙醇 | 第36-48页 |
| 1.2.1 菊芋概述 | 第36-38页 |
| 1.2.2 两步法菊芋乙醇发酵 | 第38-41页 |
| 1.2.3 一步法菊芋乙醇发酵 | 第41-45页 |
| 1.2.4 全植株菊芋乙醇发酵 | 第45-46页 |
| 1.2.5 菊芋乙醇生产面临的机遇与挑战 | 第46-48页 |
| 1.3 马克斯克鲁维酵母 | 第48-59页 |
| 1.3.1 马克斯克鲁维酵母生理代谢特性 | 第48-50页 |
| 1.3.2 马克斯克鲁维酵母在产酶方面的应用 | 第50-54页 |
| 1.3.3 马克斯克鲁维酵母在燃料乙醇生产方面的应用 | 第54-58页 |
| 1.3.4 马克斯克鲁维酵母在其他工业领域的应用 | 第58-59页 |
| 1.4 菊粉酶及其表达调控机制概述 | 第59-63页 |
| 1.4.1 菊粉酶研究现状 | 第59-61页 |
| 1.4.2 菊粉酶的表达调控机制 | 第61-63页 |
| 1.5 研究工作主要思路 | 第63-65页 |
| 1.5.1 选题依据 | 第63页 |
| 1.5.2 存在问题 | 第63页 |
| 1.5.3 研究内容及技术路线 | 第63-65页 |
| 2 不同通气策略下的乙醇发酵 | 第65-80页 |
| 2.1 引言 | 第65页 |
| 2.2 实验材料与方法 | 第65-69页 |
| 2.2.1 菌种 | 第65页 |
| 2.2.2 培养基 | 第65页 |
| 2.2.3 培养条件 | 第65-66页 |
| 2.2.4 乙醇发酵策略 | 第66页 |
| 2.2.5 实验试剂 | 第66页 |
| 2.2.6 仪器设备 | 第66-67页 |
| 2.2.7 两阶段通气策略调控下的菊芋乙醇生料发酵 | 第67页 |
| 2.2.8 分析方法 | 第67-69页 |
| 2.3 结果与讨论 | 第69-79页 |
| 2.3.1 不同通气量对乙醇发酵过程的影响 | 第69-70页 |
| 2.3.2 初始菊粉酶活力和接种生物量对乙醇发酵过程的影响 | 第70-71页 |
| 2.3.3 两阶段通气策略对乙醇发酵过程的影响 | 第71-73页 |
| 2.3.4 乙醇发酵过程中的甘油和乙酸 | 第73-75页 |
| 2.3.5 两阶段通气策略调控下的菊芋乙醇生料发酵 | 第75-79页 |
| 2.4 本章小结 | 第79-80页 |
| 3 氧化还原电位控制下的乙醇发酵 | 第80-92页 |
| 3.1 引言 | 第80页 |
| 3.2 实验材料与方法 | 第80-82页 |
| 3.2.1 菌种 | 第80页 |
| 3.2.2 培养基 | 第80页 |
| 3.2.3 培养条件 | 第80页 |
| 3.2.4 ORP调控策略 | 第80-81页 |
| 3.2.5 实验试剂 | 第81页 |
| 3.2.6 仪器设备 | 第81页 |
| 3.2.7 分析方法 | 第81-82页 |
| 3.2.8 代谢通量分析 | 第82页 |
| 3.3 结果与讨论 | 第82-91页 |
| 3.3.1 不同控制策略总通气量与ORP变化的分析 | 第82-84页 |
| 3.3.2 不同ORP控制策略下发酵情况的综合评价与比较 | 第84-88页 |
| 3.3.3 代谢通量分析 | 第88-91页 |
| 3.4 本章小结 | 第91-92页 |
| 4 不同乙醇发酵条件下的全局转录组学分析 | 第92-118页 |
| 4.1 引言 | 第92页 |
| 4.2 实验材料与方法 | 第92-97页 |
| 4.2.1 菌种 | 第92页 |
| 4.2.2 培养基 | 第92页 |
| 4.2.3 培养条件 | 第92-93页 |
| 4.2.4 转录组学分析 | 第93-96页 |
| 4.2.5 实验试剂 | 第96页 |
| 4.2.6 仪器设备 | 第96页 |
| 4.2.7 分析方法 | 第96页 |
| 4.2.8 实时定量荧光PCR | 第96-97页 |
| 4.3 结果与讨论 | 第97-117页 |
| 4.3.1 不同条件下的乙醇发酵性能概述 | 第97-101页 |
| 4.3.2 基因组注释 | 第101页 |
| 4.3.3 转录组分析总述 | 第101-102页 |
| 4.3.4 不同条件下的马克斯克鲁维酵母转录组学分析 | 第102-105页 |
| 4.3.5 中心碳代谢途径的基因表达差异分析 | 第105-109页 |
| 4.3.6 乙醇及甘油生成途径基因表达差异 | 第109-111页 |
| 4.3.7 氧化压力防御途径的基因表达差异 | 第111页 |
| 4.3.8 糖转运蛋白的基因表达差异 | 第111-112页 |
| 4.3.9 转录调控相关基因的差异表达情况 | 第112-114页 |
| 4.3.10 细胞自噬和线粒体氧化磷酸化相关基因的差异表达情况 | 第114-117页 |
| 4.4 本章小结 | 第117-118页 |
| 5 基于转录组分析的关键基因功能表征 | 第118-145页 |
| 5.1 引言 | 第118页 |
| 5.2 实验材料与方法 | 第118-125页 |
| 5.2.1 菌种和质粒 | 第118页 |
| 5.2.2 培养基 | 第118-119页 |
| 5.2.3 培养条件 | 第119页 |
| 5.2.4 分子操作技术 | 第119-122页 |
| 5.2.5 实验试剂 | 第122-123页 |
| 5.2.6 仪器设备 | 第123页 |
| 5.2.7 过表达重组菌的构建 | 第123-124页 |
| 5.2.8 KmTPX1,KmTRX和KmTrxR基因的功能验证 | 第124-125页 |
| 5.3 结果与讨论 | 第125-144页 |
| 5.3.1 基因KmTPX1的生物学功能 | 第125-135页 |
| 5.3.2 基因KmTrxR的生物学功能 | 第135-140页 |
| 5.3.3 基因KmTRX和基因KmTrxR的协同作用 | 第140-144页 |
| 5.4 本章小结 | 第144-145页 |
| 6 马克斯克鲁维酵母产菊粉酶表达调控机制探究 | 第145-171页 |
| 6.1 引言 | 第145页 |
| 6.2 实验材料和方法 | 第145-151页 |
| 6.2.1 菌株 | 第145页 |
| 6.2.2 培养基 | 第145-147页 |
| 6.2.3 实验试剂和仪器设备 | 第147页 |
| 6.2.4 培养条件对菊粉酶活力的影响 | 第147页 |
| 6.2.5 分子生物学操作 | 第147-151页 |
| 6.2.6 荧光强度测定 | 第151页 |
| 6.2.7 分析方法 | 第151页 |
| 6.3 结果与讨论 | 第151-170页 |
| 6.3.1 培养条件对菊粉酶活力和细胞生长的影响 | 第151-157页 |
| 6.3.2 菊粉酶启动子的启动活性 | 第157-158页 |
| 6.3.3 不同截断长度菊粉酶启动子的启动活性比较 | 第158-161页 |
| 6.3.4 菊粉酶启动子抑制区域探讨 | 第161-164页 |
| 6.3.5 菊粉酶启动子核心启动原件分析 | 第164-165页 |
| 6.3.6 随机突变筛选高启动活性的菊粉酶启动子 | 第165-170页 |
| 6.4 本章小结 | 第170-171页 |
| 7 结论、创新点与展望 | 第171-173页 |
| 7.1 结论 | 第171-172页 |
| 7.2 创新点 | 第172页 |
| 7.3 展望 | 第172-173页 |
| 参考文献 | 第173-194页 |
| 附录 | 第194-205页 |
| 作者简介 | 第205-206页 |
| 攻读博士学位期间科研项目及参加科研项目 | 第206-208页 |
| 致谢 | 第208页 |
