| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-9页 |
| 1 文献综述 | 第10-21页 |
| 1.1 猪链球菌研究进展 | 第10-11页 |
| 1.2 猪副猪嗜血杆菌概述 | 第11-13页 |
| 1.3 混合感染研究进展 | 第13-15页 |
| 1.4 新一代转录组学 | 第15-16页 |
| 1.5 RNA-seq | 第16-21页 |
| 1.5.1 RNA-seq概述 | 第16页 |
| 1.5.2 RNA-seq技术和优点 | 第16-18页 |
| 1.5.3 RNA-seq备选的应用软件 | 第18-21页 |
| 2 目的与意义 | 第21-22页 |
| 3 材料与方法 | 第22-30页 |
| 3.1 材料 | 第22-23页 |
| 3.1.1 菌株及培养条件 | 第22页 |
| 3.1.2 实验相关试剂 | 第22-23页 |
| 3.1.3 实验动物 | 第23页 |
| 3.2 方法 | 第23-30页 |
| 3.2.1 引物 | 第23页 |
| 3.2.2 生长曲线的测定及计数方法 | 第23-24页 |
| 3.2.3 基因组的提取 | 第24页 |
| 3.2.4 PCR反应 | 第24-25页 |
| 3.2.5 琼脂糖凝胶电泳 | 第25页 |
| 3.2.6 动物试验方法 | 第25-26页 |
| 3.2.7 革兰氏染色 | 第26页 |
| 3.2.8 RNA相关实验 | 第26-28页 |
| 3.2.9 RNA-seq技术的分析方法 | 第28-30页 |
| 4 结果与分析 | 第30-57页 |
| 4.1 SS与HPS混合培养时的生长情况 | 第30-32页 |
| 4.1.1 猪链球菌与副猪嗜血杆菌等量混合培养 | 第30-31页 |
| 4.1.2 猪链球菌与副猪嗜血杆菌1：10混合培养 | 第31-32页 |
| 4.1.3 猪链球菌上清与副猪嗜血杆菌混合培养 | 第32页 |
| 4.2 RNA的提取、验证 | 第32-34页 |
| 4.2.1 RNA样品的提取 | 第32-33页 |
| 4.2.2 样本检测 | 第33-34页 |
| 4.2.3 数据分析 | 第34页 |
| 4.3 猪链球菌的RNA-seq结果分析 | 第34-46页 |
| 4.3.1 猪链球菌在与猪副猪嗜血杆菌混合培养条件时差异表达基因的概况 | 第34-35页 |
| 4.3.2 与碳代谢有关的差异表达基因 | 第35-41页 |
| 4.3.3 膜转运系统的调控 | 第41-44页 |
| 4.3.4 核苷酸代谢调控 | 第44-46页 |
| 4.4 猪副猪嗜血杆菌的RNA-seq结果分析 | 第46-52页 |
| 4.4.1 概述 | 第46-47页 |
| 4.4.2 碳代谢过程中基因表达调控 | 第47页 |
| 4.4.3 核苷酸代谢调控 | 第47-48页 |
| 4.4.4 翻译调控 | 第48-49页 |
| 4.4.5 其它差异表达基因调控 | 第49-52页 |
| 4.5 动物实验 | 第52-57页 |
| 4.5.1 临床变化 | 第52页 |
| 4.5.2 病理变化 | 第52-57页 |
| 5 讨论 | 第57-60页 |
| 6 结论 | 第60-61页 |
| 参考文献 | 第61-68页 |
| 致谢 | 第68页 |