| 致谢 | 第6-10页 |
| 缩略词表 | 第10-11页 |
| 摘要 | 第11-13页 |
| Abstract | 第13-14页 |
| 1 文献综述 | 第16-26页 |
| 1.1 远缘杂交及远缘杂交在番茄中的研究 | 第16-18页 |
| 1.1.1 远缘杂交中的正反交差异现象 | 第16-17页 |
| 1.1.2 远缘杂交中的超亲现象 | 第17页 |
| 1.1.3 远缘杂交在番茄中的研究 | 第17-18页 |
| 1.2 DNA甲基化的研究 | 第18-20页 |
| 1.2.1 植物DNA甲基化的相关机制 | 第18-19页 |
| 1.2.2 DNA甲基化的生物学功能 | 第19页 |
| 1.2.3 植物RNA介导的DNA甲基化 | 第19-20页 |
| 1.3 植物小RNA研究 | 第20-24页 |
| 1.3.1 植物miRNA的研究 | 第20-22页 |
| 1.3.2 植物siRNA的研究 | 第22-24页 |
| 1.4 DNA甲基化和小RNA与远缘杂交的关系 | 第24页 |
| 1.5 本研究的目的和意义 | 第24-26页 |
| 2 番茄远缘正反交后代的性状差异及遗传差异 | 第26-37页 |
| 2.1 材料与方法 | 第26-32页 |
| 2.1.1 实验材料 | 第26-28页 |
| 2.1.2 实验方法 | 第28-32页 |
| 2.2 结果与分析 | 第32-35页 |
| 2.2.1 正反交后代植物学性状差异分析 | 第32-33页 |
| 2.2.2 基因组DNA的提取 | 第33-34页 |
| 2.2.3 正反交后代的遗传差异 | 第34-35页 |
| 2.3 讨论 | 第35-37页 |
| 3 番茄正反交中的DNA甲基化 | 第37-49页 |
| 3.1 材料与方法 | 第38-41页 |
| 3.1.1 实验材料 | 第38页 |
| 3.1.2 实验方法 | 第38-41页 |
| 3.2 结果与分析 | 第41-47页 |
| 3.2.1 基因组DNA的提取 | 第41页 |
| 3.2.2 正反交后代的DNA甲基化模式的差异 | 第41-46页 |
| 3.2.3 正反交后代的DNA甲基化状态的差异 | 第46-47页 |
| 3.3 讨论 | 第47-49页 |
| 4 小RNA对番茄正反交差异性状的影响 | 第49-71页 |
| 4.1 材料与方法 | 第50-52页 |
| 4.1.1 实验材料 | 第50页 |
| 4.1.2 实验方法 | 第50-52页 |
| 4.2 结果与分析 | 第52-69页 |
| 4.2.1 RNA质量检测 | 第52-53页 |
| 4.2.2 小RNA的长度分布 | 第53页 |
| 4.2.3 重复相关小RNA(the repeat associate sRNAs)的差异 | 第53-55页 |
| 4.2.4 已知miRNA的鉴定 | 第55-56页 |
| 4.2.5 正反交之间和亲本之间的已知miRNA的不同表达 | 第56-65页 |
| 4.2.6 差异表达的miRNAs的靶基因预测 | 第65-67页 |
| 4.2.7 远缘杂交中小RNA的改变 | 第67-69页 |
| 4.3 讨论 | 第69-71页 |
| 5 结论、创新点与后续展望 | 第71-75页 |
| 5.1 结论 | 第71-73页 |
| 5.1.1 番茄正反交杂种间以及正反交和亲本间的植株表型分析 | 第71页 |
| 5.1.2 番茄正反交杂种间的遗传差异 | 第71页 |
| 5.1.3 DNA甲基化分析 | 第71-72页 |
| 5.1.4 小RNA测序分析 | 第72-73页 |
| 5.2 创新点 | 第73页 |
| 5.3 后续展望 | 第73-75页 |
| 参考文献 | 第75-89页 |
| 硕士期间发表的论文 | 第89页 |
