| 项目支持 | 第3-6页 |
| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-9页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-24页 |
| 1.1 家兔起源驯化概述 | 第12-15页 |
| 1.2 国内主要家兔品种 | 第15-19页 |
| 1.2.1 九嶷山兔概况 | 第15页 |
| 1.2.2 万载兔概况 | 第15-16页 |
| 1.2.3 四川白兔概况 | 第16页 |
| 1.2.4 福建黄兔概况 | 第16-17页 |
| 1.2.5 云南花兔概况 | 第17页 |
| 1.2.6 闽西南黑兔概况 | 第17-18页 |
| 1.2.7 比利时兔概况 | 第18页 |
| 1.2.8 新西兰兔概况 | 第18-19页 |
| 1.3 群体遗传学及遗传多样性 | 第19-20页 |
| 1.4 选择压力研究进展 | 第20-21页 |
| 1.5 RAD测序技术及其应用 | 第21-23页 |
| 1.5.1 RAD测序技术流程 | 第21-22页 |
| 1.5.2 RAD测序技术在动植物群体遗传关系以及系统发生学上的应用 | 第22-23页 |
| 1.6 本研究的目的和意义 | 第23-24页 |
| 第二章 基于常染色体解析中国家兔地方品种遗传关系 | 第24-35页 |
| 2.1 试验材料 | 第24-25页 |
| 2.2 试验方法 | 第25-27页 |
| 2.2.1 血液样品DNA提取与检测 | 第25页 |
| 2.2.2 文库构建 | 第25页 |
| 2.2.3 生物信息学分析 | 第25-27页 |
| 2.3 结果与分析 | 第27-34页 |
| 2.3.1 测序基本数据分析 | 第27页 |
| 2.3.2 群体遗传关系分析 | 第27-34页 |
| 2.4 讨论 | 第34页 |
| 2.5 小结 | 第34-35页 |
| 第三章 基于Y染色体解析中国家兔地方品种遗传关系 | 第35-43页 |
| 3.1 试验材料 | 第35页 |
| 3.2 试验方法 | 第35-36页 |
| 3.2.1 血液样品DNA提取与检测 | 第35页 |
| 3.2.2 文库构建 | 第35-36页 |
| 3.2.3 生物信息学分析 | 第36页 |
| 3.3 结果分析 | 第36-41页 |
| 3.3.1 系统进化树分析 | 第36-39页 |
| 3.3.2 主成分分析 | 第39-41页 |
| 3.4 讨论 | 第41-42页 |
| 3.5 小结 | 第42-43页 |
| 第四章 中国地方家兔选择压力分析 | 第43-61页 |
| 4.1 试验材料 | 第43页 |
| 4.2 试验方法 | 第43-45页 |
| 4.2.1 群体内核苷酸多样性分析（π分析） | 第43-44页 |
| 4.2.2 遗传多样性分析（Tajima’s D分析） | 第44页 |
| 4.2.3 群体间遗传分化分析（Fst分析） | 第44-45页 |
| 4.3 结果与分析 | 第45-58页 |
| 4.4 讨论 | 第58-60页 |
| 4.5 小结 | 第60-61页 |
| 第五章 结论与创新点 | 第61-62页 |
| 5.1 结论 | 第61页 |
| 5.2 创新点 | 第61-62页 |
| 参考文献 | 第62-67页 |
| 附录 | 第67-70页 |
| 致谢 | 第70-71页 |
| 作者简介 | 第71页 |