| 摘要 | 第7-9页 |
| Abstract | 第9-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-24页 |
| 1.1 柑橘黄龙病概况 | 第12-17页 |
| 1.1.1 黄龙病的发生与分布 | 第12-13页 |
| 1.1.2 黄龙病症状 | 第13-14页 |
| 1.1.3 黄龙病的寄主范围及传播途径 | 第14页 |
| 1.1.4 柑橘不同品种对黄龙病的敏感性差异研究 | 第14-15页 |
| 1.1.5 病原分子生物学研究 | 第15-17页 |
| 1.2 韧皮部杆菌亚洲种（Las）与植物寄主互作研究进展 | 第17-20页 |
| 1.2.1 Las导致寄主代谢平衡失调 | 第17-18页 |
| 1.2.2 激素介导的寄主应答反应 | 第18-19页 |
| 1.2.3 寄主的防卫反应 | 第19-20页 |
| 1.3 转录组学技术研究进展 | 第20-24页 |
| 1.3.1 转录组学及其研究方法 | 第20页 |
| 1.3.2 RNA-seq技术及其在植物抗病研究中的应用 | 第20-24页 |
| 第二章 引言 | 第24-26页 |
| 第三章 野生柑橘响应Las侵染的生物学研究 | 第26-34页 |
| 3.1 材料与方法 | 第26-30页 |
| 3.1.1 供试材料 | 第26页 |
| 3.1.2 主要试剂与仪器 | 第26-27页 |
| 3.1.3 主要存储液 | 第27-28页 |
| 3.1.4 总核酸提取 | 第28-29页 |
| 3.1.5 引物 | 第29页 |
| 3.1.6 反应体系及程序 | 第29-30页 |
| 3.2 结果与分析 | 第30-32页 |
| 3.2.1 野生柑橘不同品种接种黄龙病后含菌量变化 | 第30-31页 |
| 3.2.2 野生柑橘感染黄龙病后的症状差异 | 第31-32页 |
| 3.3 讨论 | 第32-33页 |
| 3.4 结论 | 第33-34页 |
| 第四章 马蜂柑和甜橙响应Las侵染的比较转录组学研究 | 第34-54页 |
| 4.1 材料与方法 | 第34-39页 |
| 4.1.1 供试材料 | 第34页 |
| 4.1.2 主要试剂与仪器 | 第34-35页 |
| 4.1.3 主要存储液 | 第35-36页 |
| 4.1.4 总核酸提取 | 第36页 |
| 4.1.5 核酸RNA提取 | 第36页 |
| 4.1.6 转录组测序 | 第36-37页 |
| 4.1.7 数据分析 | 第37-38页 |
| 4.1.8 RT-qPCR验证 | 第38-39页 |
| 4.2 结果与分析 | 第39-51页 |
| 4.2.1 RNA质量检测 | 第39-40页 |
| 4.2.2 测序数据过滤 | 第40-41页 |
| 4.2.3 参考基因组比对结果 | 第41页 |
| 4.2.4 新转录本预测 | 第41页 |
| 4.2.5 各样品间差异表达基因情况 | 第41-42页 |
| 4.2.6 差异表达基因GO功能分析 | 第42-43页 |
| 4.2.7 差异表达基因代谢途径富集分析 | 第43-44页 |
| 4.2.8 差异表达基因功能聚类分析 | 第44-49页 |
| 4.2.9 RT-qPCR验证 | 第49-51页 |
| 4.3 讨论 | 第51-53页 |
| 4.3.1 Las侵染对马蜂柑和甜橙淀粉代谢和光合作用的影响存在差异 | 第51-52页 |
| 4.3.2 马蜂柑和甜橙对Las的防御机制 | 第52-53页 |
| 4.4 结论 | 第53-54页 |
| 第五章 宜昌橙、道县野橘和甜橙响应Las侵染的比较转录组学研究 | 第54-72页 |
| 5.1 材料与方法 | 第54-55页 |
| 5.1.1 供试材料 | 第54页 |
| 5.1.2 主要试剂（盒）与仪器 | 第54页 |
| 5.1.3 常用储备液 | 第54页 |
| 5.1.4 总核酸提取 | 第54页 |
| 5.1.5 总RNA提取 | 第54-55页 |
| 5.1.6 转录组测序 | 第55页 |
| 5.1.7 数据分析 | 第55页 |
| 5.1.8 RT-qPCR验证 | 第55页 |
| 5.2 结果与分析 | 第55-67页 |
| 5.2.1 RNA质量检测 | 第55-56页 |
| 5.2.2 测序数据过滤 | 第56-57页 |
| 5.2.3 参考基因组比对结果 | 第57页 |
| 5.2.4 新转录本预测 | 第57页 |
| 5.2.5 各样品间差异表达基因情况 | 第57-58页 |
| 5.2.6 差异表达基因GO功能分析 | 第58-59页 |
| 5.2.7 差异表达基因代谢途径富集分析 | 第59-61页 |
| 5.2.8 差异表达基因功能聚类分析 | 第61-66页 |
| 5.2.9 RT-qPCR验证 | 第66-67页 |
| 5.3 讨论 | 第67-69页 |
| 5.3.1 Las诱导的差异表达基因数量与显症程度具有一致性 | 第67页 |
| 5.3.2 不同寄主对Las的应答反应存在一定差异 | 第67-69页 |
| 5.3.3 不同野生柑橘品种对Las应答反应之间的异同 | 第69页 |
| 5.4 结论 | 第69-72页 |
| 第六章 主要结论、创新点与展望 | 第72-74页 |
| 6.1 主要结论 | 第72-73页 |
| 6.1.1 野生柑橘响应Las侵染的生物学研究 | 第72页 |
| 6.1.2 马蜂柑和甜橙响应Las侵染的比较转录组学研究 | 第72页 |
| 6.1.3 宜昌橙、道县野橘和甜橙响应Las侵染的转录组学研究 | 第72-73页 |
| 6.1.4 不同野生柑橘对Las的应答反应存在一定的相似性 | 第73页 |
| 6.2 创新点 | 第73页 |
| 6.3 展望 | 第73-74页 |
| 参考文献 | 第74-84页 |
| 附录Ⅰ 缩略词与中英文对照 | 第84-86页 |
| 附录Ⅱ 附表 | 第86-104页 |
| 攻读硕士学位期间发表论文及参加科研项目 | 第104-106页 |
| 致谢 | 第106-107页 |
