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GT1-7细胞中重要功能基因KISS1和GnRH启动子DNA甲基化的研究

摘要第5-8页
abstract第8-9页
第1章 前言第12-23页
    1.1 表观遗传调控第12页
        1.1.1 表观遗传学的提出与研究内容第12页
    1.2 DNA甲基化概述第12-15页
        1.2.1 DNA甲基化和DNA甲基转移酶第13页
        1.2.2 DNA甲基化的特征第13-14页
        1.2.3 DNA甲基化调节与基因表达的关系第14页
        1.2.4 DNA甲基化的主要研究方法第14-15页
    1.3 第二代测序技术第15-16页
        1.3.1 第二代测序技术的产生第15页
        1.3.2 第二代测序技术的主要应用第15-16页
        1.3.3 二代测序技术存在的问题第16页
    1.4 Sanger测序第16-17页
        1.4.1 Sanger测序的意义第17页
    1.5 性发育概述第17-19页
        1.5.1 性发育与表观遗传第18-19页
    1.6 立题背景第19-21页
        1.6.1 KISS1基因与性发育第19页
        1.6.2 GnRH与性发育第19-20页
        1.6.3 GT1-7 细胞系第20页
        1.6.4 利用金标准亚硫酸氢盐修饰后测序进行DNA甲基化研究第20-21页
    1.7 研究内容第21-22页
    1.8 研究意义第22-23页
第2章 材料与方法第23-51页
    2.1 材料第23-27页
        2.1.1 细胞系、基因序列和基因组结构第23页
        2.1.2 程序和数据库第23-27页
    2.2 方法第27-51页
        2.2.1 KISS1和GnRH基因转录本的确定第27-30页
        2.2.2 基因表达量的检测第30页
        2.2.3 基因的启动子区域确定第30-31页
        2.2.4 亚硫酸氢盐测序PCR(BSP)第31-39页
        2.2.5 二代测序文库构建第39-49页
        2.2.6 细胞培养的常规操作第49-50页
        2.2.7 数据分析及作图第50-51页
第3章 结果与分析第51-66页
    3.1 KISS1基因的启动子区域的确定第51-54页
        3.1.1 KISS1基因转录本表达量的检测第51-52页
        3.1.2 KISS1基因启动子软件预测第52页
        3.1.3 KISS1基因启动子区域与转录因子结合部位分析第52-54页
    3.2 Gn RH基因启动子区域的确定第54-56页
        3.2.1 小鼠中GnRH基因转录本查找第54页
        3.2.2 GnRH基因启动子NCBI定位第54页
        3.2.3 GnRH基因启动子区域与转录因子结合位点分析第54-56页
    3.3 GT1-7 细胞巢式PCR产物鉴定第56页
    3.4 利用二代测序检测DNA甲基化第56-61页
        3.4.1 PCR产物进行二代测序的建库第56-58页
        3.4.2 DNA经重亚硫酸氢盐转化效率第58页
        3.4.3 二代测序结果分析第58-61页
    3.5 利用克隆测序检测DNA甲基化第61-64页
        3.5.1 菌落PCR的阳性克隆鉴定第61-63页
        3.5.2 克隆测序结果分析第63页
        3.5.3 KISS1和GnRH基因启动子CpG位点甲基化水平第63-64页
    3.6 GT1-7 细胞二代测序与克隆测序结果比较第64-66页
第4章 讨论第66-69页
    4.1 基因启动子区域的确定第66页
    4.2 基因表达水平分析第66-67页
    4.3 基因组DNA的重亚硫酸盐处理第67页
    4.4 巢式PCR第67-68页
    4.5 二代测序研究DNA甲基化第68页
    4.6 克隆测序第68-69页
第5章 结论与展望第69-70页
    5.1 结论第69页
    5.2 展望第69-70页
参考文献第70-75页
课题来源第75-76页
攻读硕士学位期间发表学术论文目录第76-77页
致谢第77页

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