| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 第一章 绪论 | 第11-23页 |
| 1.1 研究背景 | 第11-17页 |
| 1.1.1 微生物燃料电池 | 第11-13页 |
| 1.1.2 产电微生物 | 第13-14页 |
| 1.1.3 胞外电子转移机制 | 第14-17页 |
| 1.2 蛋白质相互作用网络 | 第17-21页 |
| 1.2.1 蛋白质结构和功能 | 第17-18页 |
| 1.2.2 蛋白质相互作用网络 | 第18页 |
| 1.2.3 常用蛋白质相互作用数据库 | 第18-19页 |
| 1.2.4 蛋白质相互作用网络分析方法 | 第19-21页 |
| 1.3 本课题主要工作 | 第21-23页 |
| 1.3.1 研究意义和内容 | 第21-22页 |
| 1.3.2 论文组织结构 | 第22-23页 |
| 第二章 全基因组规模的电子传递相关蛋白相互作用网络构建 | 第23-33页 |
| 2.1 引言 | 第23页 |
| 2.2 数据来源 | 第23-28页 |
| 2.2.1 电子传递相关蛋白质数据 | 第23-24页 |
| 2.2.2 电子传递相关蛋白质相互作用数据 | 第24-28页 |
| 2.3 电子传递相关蛋白相互作用网络构建 | 第28-32页 |
| 2.3.1 网络可视化工具 | 第28-30页 |
| 2.3.2 网络构建 | 第30-32页 |
| 2.4 本章小结 | 第32-33页 |
| 第三章 电子传递相关蛋白相互作用网络拓扑分析 | 第33-47页 |
| 3.1 引言 | 第33页 |
| 3.2 蛋白质相互作用网络研究常用量 | 第33-34页 |
| 3.3 电子传递相关蛋白相互作用网络拓扑特性 | 第34-36页 |
| 3.3.1 无标度特征 | 第34-35页 |
| 3.3.2 小世界效应 | 第35-36页 |
| 3.4 关键EET功能蛋白 | 第36-46页 |
| 3.4.1 中心性分析 | 第36-43页 |
| 3.4.2 K-shell分析 | 第43-46页 |
| 3.5 本章小结 | 第46-47页 |
| 第四章 电子传递相关蛋白相互作用网络功能模块分析 | 第47-58页 |
| 4.1 引言 | 第47页 |
| 4.2 分析方法 | 第47-50页 |
| 4.2.1 蛋白质折叠 | 第47页 |
| 4.2.2 亚细胞定位 | 第47-48页 |
| 4.2.3 模块化 | 第48页 |
| 4.2.4 分析工具 | 第48-50页 |
| 4.3 结果及讨论 | 第50-57页 |
| 4.3.1 蛋白质折叠 | 第50-52页 |
| 4.3.2 亚细胞定位 | 第52页 |
| 4.3.3 网络模块化 | 第52-54页 |
| 4.3.4 重构EET通路 | 第54-57页 |
| 4.4 本章小结 | 第57-58页 |
| 第五章 总结和展望 | 第58-61页 |
| 5.1 总结 | 第58-59页 |
| 5.2 展望 | 第59-61页 |
| 参考文献 | 第61-71页 |
| 附录 | 第71-81页 |
| 致谢 | 第81-83页 |
| 作者简介 | 第83页 |