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斜生栅藻诱导型防御的权衡策略与代价分析及在转录组水平上的差异

摘要第3-6页
Abstract第6-9页
第1章 绪论第14-23页
    1.1 藻类的诱导型反牧食防御第14-16页
        1.1.1 藻类的组成型防御第14-15页
        1.1.2 藻类的诱导型防御第15-16页
    1.2 诱导型反捕食防御的代价第16-18页
    1.3 生存环境不利时生物诱导型反捕食防御的权衡策略第18-20页
        1.3.1 环境资源水平下降时,生物在生长与防御间的权衡策略第18-19页
        1.3.2 种间关系影响生物诱导防御第19页
        1.3.3 污染物等环境胁迫时生物抵御胁迫和捕食双重压力的权衡策略第19-20页
    1.4 本文的研究目的和内容第20-23页
        1.4.1 研究目的第20页
        1.4.2 主要研究内容第20-22页
        1.4.3 研究框架图第22页
        1.4.4 本研究的主要创新点第22-23页
第2章 斜生栅藻诱导型反牧食防御在资源可得性降低时的代价和权衡策略第23-62页
    2.1 引言第23-24页
    2.2 材料方法第24-29页
        2.2.1 实验生物第24-25页
        2.2.2 大型溞滤液的制备第25页
        2.2.3 斜生栅藻的活化第25页
        2.2.4 实验设计第25-27页
            2.2.4.1 光照强度对斜生栅藻诱导型反牧食防御的影响第25-26页
            2.2.4.2 培养基浓度对斜生栅藻诱导型反牧食防御的影响第26页
            2.2.4.3 氮元素水平对斜生栅藻诱导型反牧食防御的影响第26页
            2.2.4.4 磷元素水平对斜生栅藻诱导型反牧食防御的影响第26页
            2.2.4.5 镁离子水平对斜生栅藻诱导型反牧食防御的影响第26-27页
            2.2.4.6 钙离子水平对斜生栅藻诱导型反牧食防御的影响第27页
        2.2.5 培养基第27页
        2.2.6 培养体系中总磷和总氮的测定第27-28页
        2.2.7 栅藻生长和形态的观察第28页
        2.2.8 栅藻细胞活体叶绿素荧光参数的测定第28页
        2.2.9 栅藻细胞叶绿体色素的测定第28-29页
        2.2.10 栅藻细胞多聚糖含量的测定第29页
    2.3 结果第29-57页
        2.3.1 光照强度对斜生栅藻诱导型反牧食防御的影响第29-35页
        2.3.2 培养基浓度水平对斜生栅藻诱导型反牧食防御的影响第35-39页
        2.3.3 氮元素水平对斜生栅藻诱导型反牧食防御的影响第39-44页
        2.3.4 磷元素对斜生栅藻诱导型反牧食防御的影响第44-49页
        2.3.5 镁离子水平对斜生栅藻诱导型反牧食防御的影响第49-53页
        2.3.6 钙离子水平对斜生栅藻诱导型反牧食防御的影响第53-56页
        2.3.7 氮、磷缺乏对斜生栅藻多聚糖含量的影响第56-57页
    2.4 讨论第57-60页
    2.5 本章小结第60-62页
第3章 斜生栅藻在竞争能力与反牧食防御间的权衡第62-83页
    3.1 引言第62-63页
    3.2 材料方法第63-65页
        3.2.0 实验生物第63页
        3.2.1 大型溞滤液的制备第63页
        3.2.2 藻类初始密度比的确定第63-64页
        3.2.3 藻种的活化第64页
        3.2.4 实验设计第64页
        3.2.5 竞争抑制指数的计算第64页
        3.2.6 种群密度曲线第64-65页
    3.3 结果第65-80页
        3.3.1 斜生栅藻在铜绿微囊藻存在时诱导型反牧食防御的权衡策略第65-71页
        3.3.2 斜生栅藻在小球藻存在时诱导型反牧食防御的权衡策略第71-75页
        3.3.3 斜生栅藻在针杆藻存在时诱导型反牧食防御的权衡策略第75-80页
    3.4 讨论第80-82页
    3.5 本章小结第82-83页
第4章 水生植物和其他藻类的次生代谢产物对斜生栅藻诱导型反牧食防御的影响第83-105页
    4.1 引言第83-84页
    4.2 材料方法第84-86页
        4.2.1 实验生物第84-85页
        4.2.2 大型溞滤液的制备第85页
        4.2.3 藻毒素溶液的配置及实验设计第85页
        4.2.4 大型水生植物浸出液的获得及实验设计第85-86页
    4.3 结果第86-101页
        4.3.1 微藻毒索MC-LR对斜生栅藻诱导型反牧食防御的影响第86-90页
            4.3.1.1 微囊藻毒素MC-LR对斜生栅藻群体形成的影响第86-89页
            4.3.1.2 微囊藻毒素MC-LR对斜生栅藻生长的影响第89-90页
        4.3.2 大型水生植物浸出液对斜生栅藻诱导型反牧食防御的影响第90-101页
            4.3.2.1 大型水生植物对斜生栅藻群体组成的影响第90-94页
            4.3.2.2 斜生栅藻在不同处理下的生长状况第94-97页
            4.3.2.3 斜生栅藻在不同处理下的光合活性第97-101页
    4.4 讨论第101-103页
    4.5 本章小结第103-105页
第5章 环境污染物对斜生栅藻诱导型反牧食防御的干扰第105-129页
    5.1 引言第105-107页
    5.2 材料方法第107-108页
        5.2.1 实验生物第107页
        5.2.2 大型溞滤液的制备第107页
        5.2.3 实验设计第107-108页
            5.2.3.1 锌浓度对斜生栅藻诱导型反牧食防御的影响第107页
            5.2.3.2 表面活性剂对斜生栅藻诱导型反牧食防御的影响第107-108页
    5.3 结果第108-125页
        5.3.1 锌浓度对斜生栅藻诱导型反牧食防御的影响第108-118页
        5.3.2 表面活性剂对斜生栅藻诱导型反牧食防御的影响第118-125页
    5.4 讨论第125-128页
    5.5 本章小结第128-129页
第6章 斜生栅藻在长期反复的捕食者信息素刺激下诱导型防御的权衡第129-142页
    6.1 引言第129-130页
    6.2 材料方法第130-131页
        6.2.1 实验生物第130页
        6.2.2 大型溞滤液的制备第130页
        6.2.3 实验设计第130-131页
    6.3 结果第131-140页
        6.3.1 斜生栅藻防御群体消失后再次诱导第131-138页
            6.3.1.1 斜生栅藻在不同处理下的群体形成强度第131-135页
            6.3.1.2 斜生栅藻在不同处理下的生长率第135-137页
            6.3.1.3 防御群体与生长率和初始细胞密度的关系第137-138页
        6.3.2 栅藻防御群体达到峰值时再次诱导第138-140页
    6.4 讨论第140-141页
    6.5 本章小结第141-142页
第7章 斜生栅藻诱导型反牧食防御群体形成在转录组水平上的差异第142-162页
    7.1 引言第142-143页
    7.2 材料方法第143-146页
        7.2.1 实验生物第143页
        7.2.2 测序前处理第143页
        7.2.3 栅藻总RNA的提取和转录组的测序第143页
        7.2.4 转录组测序原始数据的统计、质控、去杂处理和序列的拼接第143-144页
        7.2.5 拼接结果的注释第144页
        7.2.6 基因表达量分析第144页
        7.2.7 COG分类第144页
        7.2.8 差异表达基因筛选第144-145页
        7.2.9 Gene Ontology功能显著性富集分析第145页
        7.2.10 Pathway显著性富集分析第145页
        7.2.11 差异表达基因的实时荧光定量PCR (qPCR)验证第145-146页
    7.3 结果第146-159页
        7.3.1 斜生栅藻在不同培养条件下的表型变化和生长率第146-148页
        7.3.2 斜生栅藻在不同培养条件下的RNA-seq第148-159页
            7.3.2.1 测序数据质量评估第148页
            7.3.2.2 转录本测序的组装与拼接,以及基因功能注释第148-152页
            7.3.2.3 差异表达基因分析第152-158页
            7.3.2.4 实时定量检测RNA-seq数据第158-159页
    7.4 讨论第159-161页
    7.5 本章小结第161-162页
第8章 总结与展望第162-164页
参考文献第164-189页
发表论文、资助与获奖情况第189-192页
致谢第192-193页

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