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桑树miR3954-MuLnc1-ta-siRNA级联途径的鉴定及其功能研究

中文摘要第10-12页
Abstract第12-14页
1.前言第15-30页
    1.1 植物miRNA的研究进展第15-19页
        1.1.1 植物miRNA的加工及作用机制第15-16页
        1.1.2 植物miRNA的生物功能第16-19页
    1.2 植物lncRNA研究进展第19-25页
        1.2.1 Lnc RNAs产生及其分类第19-21页
        1.2.2 植物lncRNAs作用机制第21-23页
        1.2.3 植物lncRNA的生物学功能第23-25页
            1.2.3.1 LncRNA参与植物生长发育的调控第23-24页
            1.2.3.2 LncRNA与植物响应环境胁迫的关系第24-25页
    1.3 Ta-siRNA的研究进展第25-27页
        1.3.1 Ta-siRNA的形成机制第25-26页
        1.3.2 MiRNA—TAS—tasiRNA—target gene级联反应的类型及功能第26-27页
    1.4 LncRNA与miRNA相互作用研究进展第27-28页
    1.5 本研究的目的及意义第28-30页
2 材料与方法第30-53页
    2.1 材料第30-31页
        2.1.1 植物材料第30页
        2.1.2 菌株和载体第30页
        2.1.3 试剂第30页
        2.1.4 主要仪器第30页
        2.1.5 PCR引物第30-31页
    2.2 方法第31-53页
        2.2.1 Mul-miR3954靶基因的预测第31页
        2.2.2 MiR3954切割靶基因MuLnc1产生ta-siRNAs的验证第31-38页
            2.2.2.1 mRNA杂交第31-36页
            2.2.2.2 sRNA杂交第36-38页
        2.2.3 cDNA的合成第38-39页
        2.2.4 MulMIR3954基因的PCR扩增第39页
        2.2.5 桑树MulMIR3954组织表达特性分析第39-40页
        2.2.6 PCR扩增产物纯化第40-41页
        2.2.7 MulMIR3954扩增片段与克隆载体的链接第41页
        2.2.8 连接产物转化大肠杆菌第41页
        2.2.9 阳性质粒鉴定第41页
        2.2.10序列检测第41页
        2.2.11 MulMIR3954连接植物表达载体的构建第41-43页
        2.2.12 农杆菌GV3101感受态的制备及转化第43页
        2.2.13 转化拟南芥、转基因植株筛选与鉴定第43-44页
        2.2.14 转MulMIR3954基因拟南芥植株RNA提取第44页
        2.2.15 转MulMIR3954基因拟南芥Northern杂交第44-45页
        2.2.16 转MulMIR3954基因拟南芥荧光定量PCR第45页
        2.2.17 转MulMIR3954基因拟南芥表型分析第45页
        2.2.18 MulMIR3954拟南芥植株接种Pst DC3000和CFU值测定第45页
        2.2.19 转MulMIR3954基因拟南芥的盐和干旱胁迫处理第45页
        2.2.20 转MulMIR3954基因拟南芥脯氨酸和丙二醛含量测定第45-47页
        2.2.21 MuLnc1基因序列扩增第47页
        2.2.22 PCR产物纯化第47页
        2.2.23 MuLnc1与其同源序列的核苷酸对比分析第47页
        2.2.24 桑树中MuLnc1的组织表达特异性第47-48页
        2.2.25 MuLnc1植物表达载体的构建第48页
        2.2.26 农杆菌GV3101感受态转化第48页
        2.2.27 转MuLnc1化拟南芥、转基因植株筛选与鉴定第48-49页
        2.2.28 转MuLnc1基因拟南芥植株RNA提取第49页
        2.2.29 转MuLnc1基因拟南芥荧光定量PCR第49页
        2.2.30 转MuLnc1基因拟南芥Northern杂交第49页
        2.2.31 转MuLnc1基因拟南芥表型分析第49页
        2.2.32 转MuLnc1基因拟南芥植株接种Pst DC3000和CFU值测定第49页
        2.2.33 转MuLnc1基因拟南芥的盐和干旱胁迫处理第49页
        2.2.34 转MuLnc1基因拟南芥脯氨酸和丙二醛含量测定第49页
        2.2.35 Mul-CML27基因的PCR扩增第49-50页
        2.2.36 PCR产物纯化第50页
        2.2.37 Mul-CML27基因的生物信息学分析第50页
        2.2.38 桑树中Mul-CML27组织表达特异性第50页
        2.2.39 Mul-CML27植物表达载体的构建第50-51页
        2.2.40 农杆菌GV3101感受态转化第51页
        2.2.41 Mul-CML27转化拟南芥、转基因植株筛选与鉴定第51页
        2.2.42 转Mul-CML27基因拟南芥RNA提取第51页
        2.2.43 转Mul-CML27基因拟南芥荧光定量和Northern blot第51页
        2.2.44 转基因拟南芥Mul-CML27表型分析第51页
        2.2.45 Mul-CML27拟南芥植株接种Pst DC3000和CFU值测定第51页
        2.2.46 转Mul-CML27基因拟南芥的盐和干旱胁迫处理第51页
        2.2.47 转Mul-CML27基因拟南芥脯氨酸和丙二醛含量测定第51页
        2.2.48 转MulMIR3954基因拟南芥与转MuLnc1基因拟南芥杂交与杂交苗的鉴定第51-52页
        2.2.49 杂交苗RNA提取第52页
        2.2.50 杂交苗Northern blot和荧光定量第52页
        2.2.51 杂交苗中ta-siRNA表达量分析第52页
        2.2.52 杂交苗植株接种Pst DC3000和CFU值测定第52页
        2.2.53 杂交苗干旱和盐处理第52页
        2.2.54 杂交苗脯氨酸和丙二醛含量测定第52-53页
3 结果与分析第53-78页
    3.1 桑树miR3954-Mu Lnc-tasiRNA级联途径的鉴定第53-54页
        3.1.1 桑树mul-miR3954可以靶向MuLnc1第53页
        3.1.2 Mul-miR3954可以切割MuLnc1产生ta-siRNAs第53-54页
    3.2 MulMIR3954基因的克隆及功能分析第54-61页
        3.2.1 MulMIR3954基因的克隆及序列分析第54-55页
        3.2.2 Mul-miR3954的组织表达特性分析第55-56页
        3.2.3 MulMIR3954基因生物学功能分析第56-61页
            3.2.3.1 MulMIR3954基因植物表达载体的构建第56-57页
            3.2.3.2 转MulMIR3954基因拟南芥的获得及鉴定第57-58页
            3.2.3.3 转MulMIR3954基因拟南芥表型分析第58-59页
            3.2.3.4 转MulMIR3954基因拟南芥对Pst DC3000的抗性第59页
            3.2.3.5 转MulMIR3954基因拟南芥对干旱和盐胁迫的抗性第59-61页
    3.3 MuLnc1基因的克隆及功能分析第61-67页
        3.3.1 MuLnc1基因的克隆与序列分析第61-62页
        3.3.2 MuLnc1组织表达特性分析第62页
        3.3.3 MuLnc1的生物功能分析第62-67页
            3.3.3.1 MuLnc1植物表达载体的构建第62-63页
            3.3.3.2 转MuLnc1基因拟南芥的获得及鉴定第63-64页
            3.3.3.3 转MuLnc1基因拟南芥表型分析第64-65页
            3.3.3.4 转MuLnc1基因拟南芥对Pst DC3000的抗性分析第65-66页
            3.3.3.5 转MuLnc1基因拟南芥对干旱和盐胁迫抗性第66-67页
    3.4 桑树钙调素类似蛋白基因CML27的克隆以及功能分析第67-74页
        3.4.1 桑树钙调素类似蛋白基因CML27的克隆第67页
        3.4.2 Mul-CML27基因的生物信息学分析第67-70页
        3.4.3 Mul-CML27的组织表达特性分析第70页
        3.4.4 Mul-CML27基因的生物学功能分析第70-74页
            3.4.4.1 Mul-CML27植物表达载体的构建第70-71页
            3.4.4.2 转Mul-CML27基因拟南芥的获得及鉴定第71-72页
            3.4.4.3 转Mul-CML27基因拟南芥表型分析第72-73页
            3.4.4.4 转Mul-CML27基因拟南芥对Pst DC3000的抗性分析第73页
            3.4.4.5 转Mul-CML27基因拟南芥对干旱和盐胁迫抗性第73-74页
    3.5 Mul-miR3954-Mu Lnc1-ta-siRNA级联途径功能分析第74-78页
        3.5.1 转MuLnc1和转MulMIR3954基因拟南芥杂交苗的获得和鉴定第74-76页
        3.5.2 Mul-miR3954-MuLnc1-ta-siRNA级联的功能分析第76-77页
        3.5.3 杂交苗盐和干旱胁迫抗性第77-78页
4. 讨论第78-82页
    4.1 Mul-miR3954和MulLnc1的生物功能第78-79页
    4.2 Mul-CML27的生物功能第79-80页
    4.3 Mul-miR3954-Mu Lnc1-tasiRNA级联的功能第80-82页
5 结论第82-83页
参考文献第83-93页
致谢第93-94页
攻读学位期间发表的论文及成果第94页

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