黄瓜灰霉病PMA-qPCR方法及互作转录组学研究

摘要	第1-5页
Abstract	第5-10页
1 引言	第10-20页
·黄瓜灰霉病及其病原菌	第10-13页
·灰霉病的危害与防治	第10页
·灰葡萄孢的致病机制	第10-13页
·侵入宿主表面	第10-11页
·侵入细胞壁杀死宿主细胞	第11页
·毒素	第11-12页
·草酸	第12页
·活性氧	第12页
·转化宿主组织	第12页
·酶类	第12-13页
·克服宿主的防御反应	第13页
·植物抵抗病原体的机制	第13-15页
·模式触发的免疫PTI	第13-14页
·触发的免疫效应ETI	第14-15页
·转录组测序研究植物病原体互作	第15-18页
·宿主或病原体转录组研究的发展	第15-17页
·转录组测序的优势	第17页
·病原体的转录组测序	第17-18页
·宿主的转录组测序	第18页
·转录调控对植物病原体互作的影响	第18-19页
·本研究的目的和意义	第19-20页
2 黄瓜灰霉病PMA-qPCR诊断方法构建	第20-30页
·材料和方法	第20-25页
·供试材料	第20页
·主要试剂及设备	第20-21页
·试验方法	第21-25页
·灰葡萄孢菌P729特异基因的扩增	第21-22页
·目的条带的回收与纯化	第22页
·回收条带测序鉴定	第22页
·荧光定量PCR引物设计和特异性验证	第22-23页
·标准品的构建	第23-24页
·Real—time PCR标准曲线的建立	第24-25页
·实际样本的检测	第25页
·结果	第25-29页
·灰葡萄孢菌P729基因的扩增	第25-26页
·荧光定量引物的特异性验证	第26-27页
·标准曲线的构建	第27-28页
·重复性分析	第28-29页
·实际样品的检测	第29页
·小结与讨论	第29-30页
3 黄瓜与灰葡萄孢菌互作转录组学分析	第30-72页
·实验材料与方法	第30-41页
·实验材料	第30页
·主要试剂和设备	第30页
·黄瓜的培养和侵染	第30-31页
·黄瓜种子的消毒	第30-31页
·黄瓜的培养和侵染	第31页
·RNA的提取	第31页
·总RNA的质量检测	第31-33页
·文库的构建及上机检测	第33页
·数据分析	第33-36页
·测序质量评估	第34-35页
·数据过滤	第35页
·序列比对到参考基因组	第35页
·基因表达水平分析和差异表达分析	第35页
·差异基因的GO富集分析和KEGG富集分析	第35-36页
·差异基因定量验证	第36-41页
·结果	第41-68页
·测序数据过滤	第41-43页
·将序列比对到参考基因组	第43页
·差异基因分析	第43-51页
·植物和病原体的差异基因的GO富集分析	第51-58页
·黄瓜GO富集分析	第51-54页
·灰葡萄孢菌的GO富集分析	第54-58页
·植物和病原体的KEGG富集分析	第58-68页
·黄瓜的差异基因的KEGG富集分析	第58-64页
·灰葡萄孢菌的差异基因的KEGG富集分析	第64-68页
·差异基因的qPCR验证	第68页
·小结与讨论	第68-72页
4 定量模型分析转录调控驱动黄瓜-灰葡萄孢菌互作	第72-80页
·方法	第72-74页
·基于似然的混合模型	第72-73页
·通过EM算法估计	第73页
·实际数据	第73页
·假设检验	第73-74页
·结果	第74-79页
·聚类分组	第74-76页
·富集结果分析	第76-79页
·讨论	第79-80页
5 结论	第80-82页
参考文献	第82-88页
个人简介	第88-90页
导师简介	第90-92页
致谢	第92页