| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 目录 | 第9-11页 |
| 第1章 前言 | 第11-13页 |
| ·研究背景 | 第11-12页 |
| ·研究目的 | 第12-13页 |
| 第2章 文献综述 | 第13-24页 |
| ·鸟类起源及分类系统 | 第13-15页 |
| ·鸟类的起源 | 第13-14页 |
| ·鸟类的分类系统 | 第14-15页 |
| ·线粒体的生物学特征 | 第15页 |
| ·鸟类线粒体基因组 | 第15-19页 |
| ·鸟类线粒体基因组的组成及结构特点 | 第15-16页 |
| ·鸟类线粒体基因组在鸟类系统关系分析中的应用 | 第16-19页 |
| ·分子系统学研究方法 | 第19-24页 |
| ·分子系统学 | 第19页 |
| ·构建系统发育树常用的方法 | 第19-22页 |
| ·距离法 | 第20页 |
| ·最大简约法 | 第20-21页 |
| ·最大似然法 | 第21-22页 |
| ·贝叶斯法 | 第22页 |
| ·序列处理和系统进化分析常用的软件 | 第22-24页 |
| ·序列处理 | 第22-23页 |
| ·系统树构建 | 第23-24页 |
| 第3章 6 种鸟类线粒体基因组全序列的测定及结构分析方法 | 第24-31页 |
| ·实验材料 | 第24页 |
| ·实验过程 | 第24-31页 |
| ·基因组总 DNA 的提取 | 第24-27页 |
| ·PCR 扩增 | 第27-29页 |
| ·PCR 扩增产物的检测 | 第29-30页 |
| ·PCR 扩增产物测序、序列拼接及分析 | 第30页 |
| ·系统进化树的构建 | 第30-31页 |
| 第4章 结果与分析 | 第31-72页 |
| ·鹳形目小白鹭的线粒体基因组全序列分析 | 第31-45页 |
| ·鹳形目鸟类简介及系统发育研究现状 | 第31-32页 |
| ·小白鹭线粒体基因组结构和碱基组成 | 第32-36页 |
| ·蛋白质编码基因和密码子使用 | 第36-40页 |
| ·rRNA 和 tRNA 基因 | 第40页 |
| ·非编码区 | 第40-42页 |
| ·鹳形目鸟类系统发育关系 | 第42-45页 |
| ·目小鸊鷉的线粒体基因组全序列分析 | 第45-53页 |
| ·目鸟类简介及系统发育研究现状 | 第45页 |
| ·小 线粒体基因组结构和碱基组成 | 第45-46页 |
| ·蛋白质编码基因和密码子使用 | 第46-50页 |
| ·rRNA 和 tRNA 基因 | 第50页 |
| ·非编码区 | 第50-53页 |
| ·佛法僧目冠鱼狗和蓝翡翠的线粒体基因组全序列分析 | 第53-63页 |
| ·佛法僧目鸟类简介及系统发育研究现状 | 第53页 |
| ·冠鱼狗和蓝翡翠线粒体基因组结构和碱基组成 | 第53-54页 |
| ·蛋白质编码基因和密码子使用 | 第54-62页 |
| ·rRNA 和 tRNA 基因 | 第62页 |
| ·非编码区 | 第62-63页 |
| ·鹤形目红脚苦恶鸟和白胸苦恶鸟的线粒体基因组全序列分析 | 第63-72页 |
| ·鹤形目鸟类简介及系统发育研究现状 | 第63页 |
| ·红脚苦恶鸟和白胸苦恶鸟线粒体基因组结构 | 第63-64页 |
| ·蛋白质编码基因和密码子使用 | 第64页 |
| ·rRNA 和 tRNA 基因 | 第64-71页 |
| ·非编码区 | 第71-72页 |
| 第5章 主要结论 | 第72-73页 |
| 附录 A | 第73页 |
| 附录 B | 第73-74页 |
| 参考文献 | 第74-97页 |
| 致谢 | 第97-98页 |
| 攻读硕士学位期间取得的科研成果 | 第98页 |